Jatropha Genome Database
- JcCB0093811.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0093811.10 - phase: 0
(1329 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00441 2635 0.0
KJC_s17101 797 0.0
KJC_s14077 694 0.0
>KJC_c00441
Length = 1588
Score = 2635 bits (1329), Expect = 0.0
Identities = 1329/1329 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggcaaacaagacgataccgttgcatcggctgccgcggaaggattccaactagtagga 60
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Sbjct: 1526 atgggcaaacaagacgataccgttgcatcggctgccgcggaaggattccaactagtagga 1467
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Sbjct: 1406 catgtggagttctggtgtacagatgctactaatacggcacgccgtttttcttggggattg 1347
Query: 181 ggaatgccaatcgtggttaaatctgatatctccaccggcaacgttacccacgcttcctat 240
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Query: 241 ctactgcgctccggcgacctcaacttcttgtttactgctccctactctccgtcaattgct 300
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Query: 361 tgccgcaatttcaccgccaagcatgggcttgcagtccgagccatcgcattagaagtggaa 420
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Query: 421 gacgctgtaattgcattcaacactagtgtggctcacggtgcccaaccctcggcagaacct 480
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Query: 481 atagcactggataatcgtgctgttgttgcagaagttcatttatacggcgatgtcgttttg 540
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Sbjct: 1046 atagcactggataatcgtgctgttgttgcagaagttcatttatacggcgatgtcgttttg 987
Query: 541 agatacattagttattacaactcaaaccctaatgatgatcatgattggtttctgccaaaa 600
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Sbjct: 986 agatacattagttattacaactcaaaccctaatgatgatcatgattggtttctgccaaaa 927
Query: 601 tttgaagcaatggatgaatcgtcatcattttcgttggattacggtattcggcgattagac 660
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Query: 661 catgccgtcgggaacgtaccggaattagcccccgctgtttcttatgtgaaagcgttcacc 720
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Query: 721 ggtttccatgaatttgctgagttcacggcggaggatgtagggactaatgaaagcggattg 780
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Sbjct: 806 ggtttccatgaatttgctgagttcacggcggaggatgtagggactaatgaaagcggattg 747
Query: 781 aactcggtggtgttggcgaataacgaggagacggtattgctaccgctgaatgagcctgtg 840
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Sbjct: 746 aactcggtggtgttggcgaataacgaggagacggtattgctaccgctgaatgagcctgtg 687
Query: 841 tttggcaccaagaggaagagtcagatacagacatacttagagcataacgaaggtgcagga 900
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Sbjct: 686 tttggcaccaagaggaagagtcagatacagacatacttagagcataacgaaggtgcagga 627
Query: 901 gtacaacatttggcgcttgccagtgaaaatatattcagaaccttgagagaaatgaggaag 960
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Sbjct: 626 gtacaacatttggcgcttgccagtgaaaatatattcagaaccttgagagaaatgaggaag 567
Query: 961 aggagctgtattggaggctttgagtttatgccatctccacctccaacatattataagaat 1020
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Sbjct: 566 aggagctgtattggaggctttgagtttatgccatctccacctccaacatattataagaat 507
Query: 1021 ttaaagaacagggtaggagatgttttgactgatgatcagattaaggagtgtgaggaattg 1080
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Sbjct: 506 ttaaagaacagggtaggagatgttttgactgatgatcagattaaggagtgtgaggaattg 447
Query: 1081 gggattttggtggatagggatgatcatgggaccttgctccagattttcactaagcctctg 1140
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Sbjct: 446 gggattttggtggatagggatgatcatgggaccttgctccagattttcactaagcctctg 387
Query: 1141 ggtgataggccaaccatctttatagagataattcagagagtagggtgcatgctcaaggat 1200
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Sbjct: 386 ggtgataggccaaccatctttatagagataattcagagagtagggtgcatgctcaaggat 327
Query: 1201 gaggcagggaaagaatatcagaagggtggatgtgggggatttgggaagggaaacttttcg 1260
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Sbjct: 326 gaggcagggaaagaatatcagaagggtggatgtgggggatttgggaagggaaacttttcg 267
Query: 1261 gagctattcaagtccattgaggagtacgagaagacacttgaagccaagcggattgcagaa 1320
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Sbjct: 266 gagctattcaagtccattgaggagtacgagaagacacttgaagccaagcggattgcagaa 207
Query: 1321 gcagcttaa 1329
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Sbjct: 206 gcagcttaa 198
>KJC_s17101
Length = 420
Score = 797 bits (402), Expect = 0.0
Identities = 416/420 (99%), Gaps = 3/420 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 772 agcggattgaactcggtggtgttggcgaataacgaggagacggtattgctaccgctgaat 831
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Sbjct: 1 agcggattgaactcggtggtgttggcgaataacgaggagacggtattgctaccgctgaat 60
Query: 832 gagcctgtgtttggcaccaagaggaagagtcagatacagacatacttagagcataacgaa 891
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Sbjct: 61 gagcctgtgtttggcaccaagaggaagagtcagatacagacatacttagagcataacgaa 120
Query: 892 ggtgcaggagtacaacatttggcgcttg---ccagtgaaaatatattcagaaccttgaga 948
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Sbjct: 121 ggtgcaggagtacaacatttggcgcttggggccagtgaaaatatattcagaaccctgaga 180
Query: 949 gaaatgaggaagaggagctgtattggaggctttgagtttatgccatctccacctccaaca 1008
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Sbjct: 181 gaaatgaggaagaggagctgtattggaggctttgagtttatgccatctccacctccaaca 240
Query: 1009 tattataagaatttaaagaacagggtaggagatgttttgactgatgatcagattaaggag 1068
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Sbjct: 241 tattataagaatttaaagaacagggtaggagatgttttgactgatgatcagattaaggag 300
Query: 1069 tgtgaggaattggggattttggtggatagggatgatcatgggaccttgctccagattttc 1128
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Sbjct: 301 tgtgaggaattggggattttggtggatagggatgatcatgggaccttgctccagattttc 360
Query: 1129 actaagcctctgggtgataggccaaccatctttatagagataattcagagagtagggtgc 1188
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Sbjct: 361 actaagcctctgggtgataggccaaccatctttatagagataattcagagagtagggtgc 420
>KJC_s14077
Length = 481
Score = 694 bits (350), Expect = 0.0
Identities = 378/382 (98%), Gaps = 4/382 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 255 cgacctcaacttcttgtttactgctccctactctccgtcaattgctgccatggagaattt 314
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Sbjct: 481 cgacctcaacttcttgtt-actgctccctactctccgtcaattgctgccatggagaatt- 424
Query: 315 atcaaacactgccacggcatcaatccccaccttcaatcacgaagattgccgcaatttcac 374
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Sbjct: 423 atcaaacactgccacggcatcaatccc-accttcaatcacgaagattgccgcaatt-cac 366
Query: 375 cgccaagcatgggcttgcagtccgagccatcgcattagaagtggaagacgctgtaattgc 434
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Sbjct: 365 cgccaagcatgggcttgcagtccgagccatcgcattagaagtggaagacgctgtaattgc 306
Query: 435 attcaacactagtgtggctcacggtgcccaaccctcggcagaacctatagcactggataa 494
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Sbjct: 305 attcaacactagtgtggctcacggtgcccaaccctcggcagaacctatagcactggataa 246
Query: 495 tcgtgctgttgttgcagaagttcatttatacggcgatgtcgttttgagatacattagtta 554
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Sbjct: 245 tcgtgctgttgttgcagaagttcatttatacggcgatgtcgttttgagatacattagtta 186
Query: 555 ttacaactcaaaccctaatgatgatcatgattggtttctgccaaaatttgaagcaatgga 614
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Sbjct: 185 ttacaactcaaaccctaatgatgatcatgattggtttctgccaaaatttgaagcaatgga 126
Query: 615 tgaatcgtcatcattttcgttg 636
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Sbjct: 125 tgaatcgtcatcattttcgttg 104
Score = 204 bits (103), Expect = 4e-52
Identities = 103/103 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 864 gatacagacatacttagagcataacgaaggtgcaggagtacaacatttggcgcttgccag 923
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Sbjct: 104 gatacagacatacttagagcataacgaaggtgcaggagtacaacatttggcgcttgccag 45
Query: 924 tgaaaatatattcagaaccttgagagaaatgaggaagaggagc 966
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Sbjct: 44 tgaaaatatattcagaaccttgagagaaatgaggaagaggagc 2