Jatropha Genome Database
- JcCB0088661.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0088661.10 + phase: 0 /partial
(2315 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c09758 2012 0.0
>KJC_c09758
Length = 1058
Score = 2012 bits (1015), Expect = 0.0
Identities = 1052/1061 (99%), Gaps = 3/1061 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 559 tatcctcatgccgtatcatactttgctcatgctagacattgtcctcctaattccatgcaa 618
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1058 tatcctcatnccgtatcanactttgctcatgctagacattgtctccctaattccatgcaa 999
Query: 619 ttgaatcatcaactgtctaatacaacactgaatgctactaagtctcaaatttatatgtgg 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 998 ttgaatcatcaactgtctaatacaacactgaatgctactaagtctcaaatttatatgtgg 939
Query: 679 ccatacaggactcatagaactgatggtgcacacttggtgaaattagcaccagacttgccc 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 938 ccatacaggactcatagaactgatggtgcacacttggtgaaattagcaccagacttgccc 879
Query: 739 cctgtaaatcttccaccatctgttcgtgtaatttctcaggcagctttcaaaagcaaccag 798
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 878 cccgtaaatcttccaccatctgttcgtgtaatttctcaggcagctttcaaaagcaaccag 819
Query: 799 tgcagattgcctatgaagatacctacctcaggaggtagtggtgttgaggctggaagagaa 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818 tgcagattgcctatgaagatacctacctcaggaggtagtggtgttgaggctggaagagaa 759
Query: 859 agagaaaacatagttcctcagcttctgcaagttgtgaattcaagagcgaccagtttggct 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758 agagaaaacatagttcctcagcttctgcaagttgtgaattcaagagcgaccagtttggct 699
Query: 919 aaagctaaaagggataaaaccaatcaggtgacagataatatcacaaatgcatgctcagaa 978
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 aaagctaaaaaggataaaaccaatcaggtgacagataatatcacaaatgcatgctcagaa 639
Query: 979 gagcttacagctacgtgtgcagaagaatctgcagttcaaaatgatgtatgtgttgctgaa 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 gagcttacagctacgtgtgcagaagaatctgcagttcaaaatgatgtatgtgttgctgaa 579
Query: 1039 gagagaggcaatgattcagatcttcagatgcatcctttactttttcaggcccctgaagat 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 gagagaggcaatgattcagatcttcagatgcatcctttactttttcaggcccctgaagat 519
Query: 1099 ggatgtttgtcatattacccacccagctgcagcactgctactcctagttcttttgctttc 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 518 ggatgtttgtcatattacccacccagctgcagcactgctactcctag-tcttttgctttc 460
Query: 1159 tttgcaggaaatcagcctcagttgaatctgagtctctttcatgctccacatcaagcaaat 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 459 tttgcaggaaatcagcctcagttgaatctgagtctctttcatgctccacatcaagcaaat 400
Query: 1219 caaatttctgattgtttgaataaatcttcaaagacaaaggaatccatttcagcatcatgt 1278
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 399 caaatttctga-tgtttgaataaatcttcaaag-caaaggaatccatttcagcatcatgt 342
Query: 1279 gggattgacttccatccacttttgcaaagaactggggaagaaagtagtgaattagctaca 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341 gggattgacttccatccacttttgcaaagaactggggaagaaagtagtgaattagctaca 282
Query: 1339 gcatgttccaatacacatcagtttgtttgtttgggaggcaaatctgctcaatttcaaaat 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 281 gcatgttccaatacacatcagtttgtttgtttgggaggcaaatctgctcaatttcaaaat 222
Query: 1399 ccttcagatgttgttcagaccaaattaccagtcaatagcccatctgctactgcgtcaaaa 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 221 ccttcagatgttgttcagaccaaattaccagtcaatagcccatctgctactgcgtcaaaa 162
Query: 1459 ccctctggtcccaacgagaaatctaacgagctggacttggaaattcatctaagttctaca 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161 ccctctggtcccaacgagaaatctaacgagctggacttggaaattcatctaagttctaca 102
Query: 1519 tccacaaaagaaaaaacaaagggaactagagacagtgcttcaaattatcaaccaaagttg 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 101 tccacaaaagaaaaaacaaagggaactagagacagtgcttcaaattatcaaccaaagttg 42
Query: 1579 atgataagtgcaccaaatcctgtaaatacaattgaaaagca 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 41 atgataagtgcaccaaatcctgtaaatacaattgaaaagca 1