Jatropha Genome Database
- JcCB0084921.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0084921.10 - phase: 1 /pseudo
(1171 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c05194 1905 0.0
>KJC_c05194
Length = 969
Score = 1905 bits (961), Expect = 0.0
Identities = 968/969 (99%), Gaps = 1/969 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 13 ggcttggttgttttccactgaaagaaaagaaaatgtgtttaaggctttcaaatgggttta 72
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969 ggcttggttgttttccactgaaagaaaagaaaatgtgtttaaggctttcaaatgggttta 910
Query: 73 gagcaagagtaaaagctatttcaaatgctaatctgaaagcaattgaaattccagaaaaa- 131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909 gagcaagagtaaaagctatttcaaatgctaatctgaaagcaattgaaattccagaaaaaa 850
Query: 132 tggtataatctaattgctgatcttcctataaaacctcctcctccattgcatcctaaaact 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tggtataatctaattgctgatcttcctataaaacctcctcctccattgcatcctaaaact 790
Query: 192 tttgaacctgtcaaacctgaagatttagccccactctttccagatgagttgattaagcaa 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789 tttgaacctgtcaaacctgaagatttagccccactctttccagatgagttgattaagcaa 730
Query: 252 gaagcgacgaatgaaaagttcatagatatcccagaacaagttcttgacatttacaagctt 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 gaagcgacgaatgaaaagttcatagatatcccagaacaagttcttgacatttacaagctt 670
Query: 312 tggcgcccaactcctttgattagggcaaagagattggagaaacttctcgatacaccagct 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 tggcgcccaactcctttgattagggcaaagagattggagaaacttctcgatacaccagct 610
Query: 372 aaaatttactacaaatatgaaggtgttagccctgctggatcacacaagcctaacacagca 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 aaaatttactacaaatatgaaggtgttagccctgctggatcacacaagcctaacacagca 550
Query: 432 gtcccacaagtcttttataatgcgcagcaaggtatcaagaatcttgtgacagaaacaggt 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 gtcccacaagtcttttataatgcgcagcaaggtatcaagaatcttgtgacagaaacaggt 490
Query: 492 gctggtcaatggggatgttcactggcctttgcttgcagcttatttggtcttggctgtgag 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 gctggtcaatggggatgttcactggcctttgcttgcagcttatttggtcttggctgtgag 430
Query: 552 gtgtggcaagttcgagcttcatatgatcaaaaaccatatcgtaggatgatgatggaaaca 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 gtgtggcaagttcgagcttcatatgatcaaaaaccatatcgtaggatgatgatggaaaca 370
Query: 612 tggggtgcgaaagtacatccatcaccgtcaaatgttactaacgcaggaagagatatcctg 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 tggggtgcgaaagtacatccatcaccgtcaaatgttactaacgcaggaagagatatcctg 310
Query: 672 aagaaggatccttcaaccccaggaagtttaggaatagctatttcagaagctgtggaggtt 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 aagaaggatccttcaaccccaggaagtttaggaatagctatttcagaagctgtggaggtt 250
Query: 732 gcagctacaaatgctgatactaaatattgcttaggcagtgtacttaatcatgttttatta 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 gcagctacaaatgctgatactaaatattgcttaggcagtgtacttaatcatgttttatta 190
Query: 792 caccaaactattatgggtgaggagtgccttaagcaaatggaagctataggtgaaactcct 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 caccaaactattatgggtgaggagtgccttaagcaaatggaagctataggtgaaactcct 130
Query: 852 gatatgataataggatgtacgggtggtgggtctaattttgcaggacttagtttcccattc 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 gatatgataataggatgtacgggtggtgggtctaattttgcaggacttagtttcccattc 70
Query: 912 attagagaaaagcttaatgggaaaataaaccctgttataagagctgttgaacctgcagca 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 attagagaaaagcttaatgggaaaataaaccctgttataagagctgttgaacctgcagca 10
Query: 972 tgtccttcg 980
|||||||||
Sbjct: 9 tgtccttcg 1