Jatropha Genome Database
- JcCB0075281.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0075281.20 - phase: 0 /TE/partial
(1905 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c05766 2074 0.0
KJC_c11714 1068 0.0
KJC_c09568 56 3e-07
KJC_c11415 54 1e-06
>KJC_c05766
Length = 1098
Score = 2074 bits (1046), Expect = 0.0
Identities = 1095/1102 (99%), Gaps = 7/1102 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 487 gaacctcaaatcactcgaattgtccaaaatattcgcccagatcgtcaaactgtactcttt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gaacctcaaatcactcgaattgtccaaaatattcgcccagatcgtcaaactgtactcttt 60
Query: 547 tctgctactttccctcgtcaggttgagatttt-ggcccgtaaggtattgaacaaacctgt 605
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tctgctactttccctcgtcaggttgagatttttggcccgtaaggtattgaacaaacctgt 120
Query: 606 ggaaatccaggttggtggaaggagtgtggtgaacaaggacataactcagttagttgaggt 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggaaatccaggttggtggaaggagtgtggtgaacaaggacataactcagttagttgaggt 180
Query: 666 aaggccagaaaatgaaagattcttgagactgttagaactacttggtgaatggtatgagaa 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aaggccagaaaatgaaagattcttgagactgttagaactacttggtgaatggtatgagaa 240
Query: 726 aggaaaaattttgatattcgtccagtcacaggacaaatgtgatgctttgtttagggattt 785
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 -ggaaaaattttgatattcgtccagtcacaggacaaatgtgatgctttgtttagggattt 299
Query: 786 actcaagcatggttatccttgcctttcacttcatggggctaaggatcagacagaccgtga 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 actcaagcatggttatccttgcctttcacttcatggggctaaggatcagacagaccgtga 359
Query: 846 gtctaccatttctgatttcaagagcaatgtctgcaatttattgattgccacaagtattgc 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 gtctaccatttctgatttcaagagcaatgtctgcaatttattgattgccacaagtattgc 419
Query: 906 agccagaggtttagatgtgaaagagcttgaactggtgatcaattttgatgttccaaatca 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 agccagaggtttagatgtgaaagagcttgaactggtgatcaattttgatgttccaaatca 479
Query: 966 ctatgaggattatgtgcaccgtgttggacgaacgggccgagctggtcgcaaaggctgtgc 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 ctatgaggattatgtgcaccgtgttggacgaacgggccgagctggtcgcaaaggctgtgc 539
Query: 1026 catcacatttatttctgaggaggatgcaagatacgcaccagatcttgcaaaagcattgga 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 catcacatttatttctgaggaggatgcaagatacgcaccagatcttgcaaaagcattgga 599
Query: 1086 actctctgagcaagttgttcccgacgaccttaaagctcttgctgatgggtttatggcaaa 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 actctctgagcaagttgttcccgacgaccttaaagctcttgctgatgggtttatggcaaa 659
Query: 1146 agtgaaccagggccttgagcaagcccatggaactggttatggtggtagtggttttaaatt 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 agtgaaccagggccttgagcaagcccatggaactggttatggtggtagtggttttaaatt 719
Query: 1206 caatgaagaggaggatgaaaagaggatagcagcaaagaaagcacaagcaaaagaatatgg 1265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 720 caatgaagaggaggatgaaaagaggatagcagcaaagaaagcacaagc-aaagaatatgg 778
Query: 1266 ctttgaagaagacaagtcagattcagaagatgaagacgacggagttcgaaaagctggagg 1325
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 ctttgaagaagacaag-cagattcagaagatgaagacgacggagttcgaaaagctggagg 837
Query: 1326 cgacatctcacggcaggctgcatttgctcaacaattatttgccattactgctgcctccaa 1385
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 838 cgacatctcacggcaggctgcatttgctc-acaattatttgccattactgctgcctccaa 896
Query: 1386 aagcagtaca-ttgg-caactccacctcccttgctcccccctggtggacttcctgtttct 1443
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 897 aagcagtacacttggccaactccacctcccttgctcccccctggtggacttcctgtttct 956
Query: 1444 ctgccaagtgtcatgggcctaactattccaggtgcagcaacagctgtacctggtgctgga 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 957 ctgccaagtgtcatgggcctaactattccaggtgcagcaacagctgtacctggtgctgga 1016
Query: 1504 ctacctgttgttggtaatgataacacagctaaggcacttgccgctgccatcaacttgcag 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1017 ctacctgttgttggtaatgataacacagctaaggcacttgccgctgccatcaacttgcag 1076
Query: 1564 cataacctggcaaagattcaag 1585
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1077 cataacctggcaaagattcaag 1098
>KJC_c11714
Length = 577
Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0
Identities = 572/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1237 gcaaagaaag-cacaagcaaaagaatatggctttgaagaagacaagtcagattcagaaga 1295
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 577 gcaaagaaagacacaagacaaagaatatggctttgaagaagacaagtcagat-cagaaga 519
Query: 1296 tgaagacgacggagttcgaaaagctggaggcgacatctcacggcaggctgcatttgctca 1355
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 tgaagacgacggagt-cgaaagactggaggcgacatctcacggcaggctgcatttgctca 460
Query: 1356 acaattatttgccattactgctgcctccaaaagcagtacattggcaactccacctccctt 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 459 acaattatttgccattactgctgcctccaaaagcagtacattggcaactccacctccctt 400
Query: 1416 gctcccccctggtggacttcctgtttctctgccaagtgtcatgggcctaactattccagg 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 399 gctcccccctggtggacttcctgtttctctgccaagtgtcatgggcctaactattccagg 340
Query: 1476 tgcagcaacagctgtacctggtgctggactacctgttgttggtaatgataacacagctaa 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 339 tgcagcaacagctgtacctggtgctggactacctgttgttggtaatgataacacagctaa 280
Query: 1536 ggcacttgccgctgccatcaacttgcagcataacctggcaaagattcaagctgatgcaat 1595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 279 ggcacttgccgctgccatcaacttgcagcataacctggcaaagattcaagctgatgcaat 220
Query: 1596 gccggagcattatgaagcagagctggagattaatgatttcccccaaaatgctcggtggaa 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 219 gccggagcattatgaagcagagctggagattaatgatttcccccaaaatgctcggtggaa 160
Query: 1656 ggttacacacaaggaaacattgggcccaatttcagaatggactggcgctgccatcactac 1715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 159 ggttacacacaaggaaacattgggcccaatttcagaatggactggcgctgccatcactac 100
Query: 1716 caggggacagtatttccctccgggcaggattccagggccaggcgaacgcaagctctactt 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 99 caggggacagtatttccctccgggcaggattccagggccaggcgaacgcaagctctactt 40
Query: 1776 gttcattgagggccctagtgaaacatctgttaagaaagc 1814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39 gttcattgagggccctagtgaaacatctgttaagaaagc 1
>KJC_c09568
Length = 643
Score = 56.0 bits (28), Expect = 3e-07
Identities = 40/44 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 454 gatgaagctgatcggatgtttgatatgggctttgaacctcaaat 497
||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 560 gatgaggctgatcgaatgcttgatatgggttttgaacctcaaat 517
>KJC_c11415
Length = 562
Score = 54.0 bits (27), Expect = 1e-06
Identities = 57/67 (85%)
Strand = Plus / Minus
Query: 428 tgcgtagagtcacttatctagttatggatgaagctgatcggatgtttgatatgggctttg 487
|||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||
Sbjct: 249 tgcgaagagtcacttaccttgtcttggatgaggctgatcggatgttggacatgggatttg 190
Query: 488 aacctca 494
| |||||
Sbjct: 189 agcctca 183