Jatropha Genome Database
- JcCB0065721.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0065721.20 - phase: 0
(1878 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c09963 1409 0.0
>KJC_c09963
Length = 740
Score = 1409 bits (711), Expect = 0.0
Identities = 725/727 (99%), Gaps = 2/727 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 ctggtatcgatttgattttgctctatcaacaaagctagcagattacatgggcaaggaggg 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 ctggtatcgatttgattttgctctatcaacaaagctagcagattacatgggcaaggaggg 75
Query: 75 aaagtttgcaaagtgcagagagttatttgatgatattattaatcaggggcgtgtgcctag 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76 aaagtttgcaaagtgcagagagttatttgatgatattattaatcaggggcgtgtgcctag 135
Query: 135 tgagtccacttttcacattttggtcattgcatatcttagtgcaccagttcaaggttgcct 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 tgagtccacttttcacattttggtcattgcatatcttagtgcaccagttcaaggttgcct 195
Query: 195 tgacgaagcatgtagcatatacaatcgtatgattcagttgggaggttacaagccacgact 254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgacgaagcatgtagcatatacaatcgtatgattcagttgggaggttacaagccacgact 255
Query: 255 tagtttgcacaattctctctttagagctcttgtgaccaaaccagcagacacttctaaacg 314
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 tagtttgcacaattctctctttagagctct-gtgaccaaaccagcagacacttctaaacg 314
Query: 315 ttatctcaagcaggctgagtttatttttcataatttggtgacatctggacttgagataca 374
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 ttatctcaagcaggctgagtttatttt-cataatttggtgacatctggacttgagataca 373
Query: 375 gaagcatatctatggtggcctaatatggctgcatagctatcaggacaacatagatagagc 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374 gaagcatatctatggtggcctaatatggctgcatagctatcaggacaacatagatagagc 433
Query: 435 aagaattgcatcactaagggaagagatgaagctagcaggaatagaagagggcagggatgt 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 434 aagaattgcatcactaagggaagagatgaagctagcaggaatagaagagggcagggatgt 493
Query: 495 gcttctgtcaattttgagggcttgctcaaaggatggtgatgtggaggaagcagaagcaac 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 494 gcttctgtcaattttgagggcttgctcaaaggatggtgatgtggaggaagcagaagcaac 553
Query: 555 ttggctcaaactcctcagaattgatggtggtcctcccacacaagcttttgtgtatagaat 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 ttggctcaaactcctcagaattgatggtggtcctcccacacaagcttttgtgtatagaat 613
Query: 615 ggaagtctttgctaaggttggagaacatatgaaatctttggagatattcagggaaatgaa 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 614 ggaagtctttgctaaggttggagaacatatgaaatctttggagatattcagggaaatgaa 673
Query: 675 ggaacgtttgggctctgttagtgtcacaggatatcataaaatcatagaggtgttatgtcg 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 674 ggaacgtttgggctctgttagtgtcacaggatatcataaaatcatagaggtgttatgtcg 733
Query: 735 agctcag 741
|||||||
Sbjct: 734 agctcag 740