Jatropha Genome Database
- JcCB0058331.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0058331.20 - phase: 0
(945 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00485 1857 0.0
KJC_c03948 64 7e-10
>KJC_c00485
Length = 1321
Score = 1857 bits (937), Expect = 0.0
Identities = 944/945 (99%), Gaps = 1/945 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagaattttggtcactggaggagctggatttattggctctcatctggttgacaagttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 atgagaattttggtcactggaggagctggatttattggctctcatctggttgacaagttg 259
Query: 61 atggaaaatgaaaagaatgaggtgattgttgtggacaacttctttactggttcaaaggat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 atggaaaatgaaaagaatgaggtgattgttgtggacaacttctttactggttcaaaggat 319
Query: 121 aatataaggaaatggattggtcatccaagatttgaactgattcgccatgatgtcaccgag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 aatataaggaaatggattggtcatccaagatttgaactgattcgccatgatgtcaccgag 379
Query: 181 ccattgctcattgaggttgaccaaatttaccaccttgcttgccctgcttctccaatcttc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 ccattgctcattgaggttgaccaaatttaccaccttgcttgccctgcttctccaatcttc 439
Query: 241 tacaaatacaatcctgtaaagactataaagacaaatgtgattggtacattgaacatgttg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 tacaaatacaatcctgtaaagactataaagacaaatgtgattggtacattgaacatgttg 499
Query: 301 gggcttgccaagcgtgttggtgcaaggattttgctgacatcaacttcggaggtgtatggc 360
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 gg-cttgccaagcgtgttggtgcaaggattttgctgacatcaacttcggaggtgtatggc 558
Query: 361 gatccgcttgaacaccctcagactgagagctactggggaaatgtcaatccaattggagtc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 559 gatccgcttgaacaccctcagactgagagctactggggaaatgtcaatccaattggagtc 618
Query: 421 agaagttgctatgacgagggaaagcgagtagctgaaactttgatgtttgattatcataga 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 619 agaagttgctatgacgagggaaagcgagtagctgaaactttgatgtttgattatcataga 678
Query: 481 caacatggcattgagatacgaattgccagaatttttaacacttatggaccccggatgaac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 679 caacatggcattgagatacgaattgccagaatttttaacacttatggaccccggatgaac 738
Query: 541 attgatgatgggcgagttgttagcaatttcatagcccaagcagtgcgtaatgagcctttg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 739 attgatgatgggcgagttgttagcaatttcatagcccaagcagtgcgtaatgagcctttg 798
Query: 601 actgttcaagcaccaggaacacaaaccaggagtttctgttatgtttctgacatggttgat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 799 actgttcaagcaccaggaacacaaaccaggagtttctgttatgtttctgacatggttgat 858
Query: 661 ggtcttattcggttgatggaaggggaaaacactgggcctattaatattggaaatccaggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 859 ggtcttattcggttgatggaaggggaaaacactgggcctattaatattggaaatccaggt 918
Query: 721 gaatttacaatgcttgaacttgcggagactgttaaggagctcatcaatcctgatgtggag 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 919 gaatttacaatgcttgaacttgcggagactgttaaggagctcatcaatcctgatgtggag 978
Query: 781 atcataagggtcgaaaatacaccagatgatcctcgtcaaaggaagccagacatcacaaaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 979 atcataagggtcgaaaatacaccagatgatcctcgtcaaaggaagccagacatcacaaaa 1038
Query: 841 gcaaaggagttgctaggatgggaacctaaggtgaagttgcgcgatggtcttccactcatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1039 gcaaaggagttgctaggatgggaacctaaggtgaagttgcgcgatggtcttccactcatg 1098
Query: 901 gaggaggatttccgacaaaggcttggggtcccaagaaagaagtga 945
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1099 gaggaggatttccgacaaaggcttggggtcccaagaaagaagtga 1143
>KJC_c03948
Length = 890
Score = 63.9 bits (32), Expect = 7e-10
Identities = 41/44 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 244 aaatacaatcctgtaaagactataaagacaaatgtgattggtac 287
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct: 581 aaatacaatcctgtcaagactatcaagacaaatgtgatgggtac 538
Score = 52.0 bits (26), Expect = 2e-06
Identities = 38/42 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 621 acaaaccaggagtttctgttatgtttctgacatggttgatgg 662
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 204 acaaaccaggagtttccaatatgtttctgacttggttgatgg 163