Jatropha Genome Database
- JcCB0044641.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0044641.10 + phase: 0 /partial
(1828 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00350 2506 0.0
KJC_s14684 406 e-113
KJC_s13495 258 4e-68
KJC_c07455 90 2e-17
KJC_c00488 60 2e-08
KJC_c00685 52 5e-06
>KJC_c00350
Length = 3598
Score = 2506 bits (1264), Expect = 0.0
Identities = 1271/1272 (99%), Gaps = 1/1272 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggtgtcaagatcatactcaaatcttttagagcttgcttctggtgagtctccatcattt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2840 atggtgtcaagatcatactcaaatcttttagagcttgcttctggtgagtctccatcattt 2781
Query: 61 ggccgcatgagccgccgaatcccgcggattatgacggtagccggaataatttctgaccta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2780 ggccgcatgagccgccgaatcccgcggattatgacggtagccggaataatttctgaccta 2721
Query: 121 gatgatgacccatctgaaagtgtatgctctgacccatcatcttcttcagtccagaaagac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2720 gatgatgacccatctgaaagtgtatgctctgacccatcatcttcttcagtccagaaagac 2661
Query: 181 agaataattattgtagccaatcagctgccaatcagggcacaaagaaaatcggatggcagc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2660 agaataattattgtagccaatcagctgccaatcagggcacaaagaaaatcggatggcagc 2601
Query: 241 aagtcttggattttcacttgggatgagaattcacttctcctccagttgaaagatggatta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2600 aagtcttggattttcacttgggatgagaattcacttctcctccagttgaaagatggatta 2541
Query: 301 ggagatgatgagattgaagttatttatgttggttgtttgagagaagaaattcaccctagc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2540 ggagatgatgagattgaagttatttatgttggttgtttgagagaagaaattcaccctagc 2481
Query: 361 gaacaagatgaggtctcacaaatacttttggagaccttcaaatgtgtgcctacatttctc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2480 gaacaagatgaggtctcacaaatacttttggagaccttcaaatgtgtgcctacatttctc 2421
Query: 421 cctcctgatcttttt-agcaggtactatcacgggttttgtaagcaacagttatggccttt 479
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2420 cctcctgatcttttttagcaggtactatcacgggttttgtaagcaacagttatggccttt 2361
Query: 480 gtttcattacatgttgcctttgtcaccggaccttggtggtaggtttaatagatcattatg 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2360 gtttcattacatgttgcctttgtcaccggaccttggtggtaggtttaatagatcattatg 2301
Query: 540 gcaagcatatgtctctgcaaataaaatttttgctgataggattatggaggtaattaaccc 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2300 gcaagcatatgtctctgcaaataaaatttttgctgataggattatggaggtaattaaccc 2241
Query: 600 ggaagatgatttcgtgtgggtgcatgactatcatcttatggtgctgccaacttttcttag 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2240 ggaagatgatttcgtgtgggtgcatgactatcatcttatggtgctgccaacttttcttag 2181
Query: 660 gaagaggtttaatagggtaaagcttggcttttttctccacagtcctttcccttcatcaga 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2180 gaagaggtttaatagggtaaagcttggcttttttctccacagtcctttcccttcatcaga 2121
Query: 720 gatttataagacattgcctattagagaagagattcttcgagctctgttaaattctgattt 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2120 gatttataagacattgcctattagagaagagattcttcgagctctgttaaattctgattt 2061
Query: 780 gattggtttccatacttttgactatgcaaggcatttcttgtcttgctgtagtagaatgct 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2060 gattggtttccatacttttgactatgcaaggcatttcttgtcttgctgtagtagaatgct 2001
Query: 840 tggtcttacctatgaatccaaaaggggatatataggccttgagtattgtggtaggactgt 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2000 tggtcttacctatgaatccaaaaggggatatataggccttgagtattgtggtaggactgt 1941
Query: 900 aagcataaaaattctgcctgttggtattcatatgggtcagcttcagtcagttttgagact 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1940 aagcataaaaattctgcctgttggtattcatatgggtcagcttcagtcagttttgagact 1881
Query: 960 tccagagactgaagcgaaagttagggagcttattaagcagttctatgatcagggtcggat 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1880 tccagagactgaagcgaaagttagggagcttattaagcagttctatgatcagggtcggat 1821
Query: 1020 aatgttgctgggggtggatgatatggatatttttaagggtataagtttgaagctgctggc 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1820 aatgttgctgggggtggatgatatggatatttttaagggtataagtttgaagctgctggc 1761
Query: 1080 aatggaacagttacttatgcagcacccagagtggcgaggcaaggtagtgttggtgcaaat 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1760 aatggaacagttacttatgcagcacccagagtggcgaggcaaggtagtgttggtgcaaat 1701
Query: 1140 agcaaaccctgcaaggggtaaaggaaaagatgtgaaagaagttcaagctgagacttattc 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1700 agcaaaccctgcaaggggtaaaggaaaagatgtgaaagaagttcaagctgagacttattc 1641
Query: 1200 cacggtgaagaggattaatgaagcatttggaaggccaggatatgatcctgtagtcttaat 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1640 cacggtgaagaggattaatgaagcatttggaaggccaggatatgatcctgtagtcttaat 1581
Query: 1260 tgatgcaccgct 1271
||||||||||||
Sbjct: 1580 tgatgcaccgct 1569
Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0
Identities = 560/560 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1269 gctaacacgagatgcagagtgggaaacatgtgcccctgtagcagacacttcttggaagca 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 836 gctaacacgagatgcagagtgggaaacatgtgcccctgtagcagacacttcttggaagca 777
Query: 1329 gattgcagaacctgtgatgcagctttatactgaaacaactgatggttccactattgagga 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 776 gattgcagaacctgtgatgcagctttatactgaaacaactgatggttccactattgagga 717
Query: 1389 caaggaaactgcactagtgtggtgctatgaggatgcagatccggactttggttcatgcca 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 caaggaaactgcactagtgtggtgctatgaggatgcagatccggactttggttcatgcca 657
Query: 1449 agctaaagaacttcttgatcatcttgaaagtgtcttagccaatgaacctgtaacagtcaa 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 agctaaagaacttcttgatcatcttgaaagtgtcttagccaatgaacctgtaacagtcaa 597
Query: 1509 gagtggacaaaatactgtggaggttaaacctcagggtgtaagcaaggggctcgtagccaa 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 gagtggacaaaatactgtggaggttaaacctcagggtgtaagcaaggggctcgtagccaa 537
Query: 1569 atgcctactttcgacaatgcaagaaaggggaatgtcaccagattttgttttgtgcattgg 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 atgcctactttcgacaatgcaagaaaggggaatgtcaccagattttgttttgtgcattgg 477
Query: 1629 agatgaccggtccgatgaagatatgttcgaggtaattgcaagttccatggcagccccatc 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 agatgaccggtccgatgaagatatgttcgaggtaattgcaagttccatggcagccccatc 417
Query: 1689 tattgctcctagggcagaagtgtttgcttgtactgttggtaaaaaaccaagcaaagctaa 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 tattgctcctagggcagaagtgtttgcttgtactgttggtaaaaaaccaagcaaagctaa 357
Query: 1749 atattatctggatgatacagcagagatagttagattgatgcaaggtttggcttcggtttc 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 atattatctggatgatacagcagagatagttagattgatgcaaggtttggcttcggtttc 297
Query: 1809 agaacaaacagttacaatac 1828
||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 agaacaaacagttacaatac 277
>KJC_s14684
Length = 453
Score = 406 bits (205), Expect = e-113
Identities = 235/241 (97%), Gaps = 3/241 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1589 aagaaaggggaatgtcaccagattttgttttgtgcattggagatgaccggtccgatgaag 1648
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 aagaaaggggaatgtcaccagattttgttt-gtgcattggagatgaccggtccgatgaag 395
Query: 1649 atatgttcgaggtaattgcaagttccatggcagccccatctattgctcctagggcagaag 1708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 atatgttcgaggtaattgcaagttccatggcagccc-atctattgctcctagggcagaag 336
Query: 1709 tgtttgcttgtactgttggtaaaaaaccaag-caaagctaaatattatctggatgataca 1767
||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 tgtttgcttgtactgttaggtaaaaaccaagacaaagctaaatattatctggatgataca 276
Query: 1768 gcagagatagttagattgatgcaaggtttggcttcggtttcagaacaaacagttacaata 1827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 gcagagatagttagattgatgcaaggtttggcttcggtttcagaacaaacagttacaata 216
Query: 1828 c 1828
|
Sbjct: 215 c 215
>KJC_s13495
Length = 220
Score = 258 bits (130), Expect = 4e-68
Identities = 130/130 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 979 gttagggagcttattaagcagttctatgatcagggtcggataatgttgctgggggtggat 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 91 gttagggagcttattaagcagttctatgatcagggtcggataatgttgctgggggtggat 150
Query: 1039 gatatggatatttttaagggtataagtttgaagctgctggcaatggaacagttacttatg 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 151 gatatggatatttttaagggtataagtttgaagctgctggcaatggaacagttacttatg 210
Query: 1099 cagcacccag 1108
||||||||||
Sbjct: 211 cagcacccag 220
Score = 178 bits (90), Expect = 3e-44
Identities = 90/90 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1180 gttcaagctgagacttattccacggtgaagaggattaatgaagcatttggaaggccagga 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttcaagctgagacttattccacggtgaagaggattaatgaagcatttggaaggccagga 60
Query: 1240 tatgatcctgtagtcttaattgatgcaccg 1269
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tatgatcctgtagtcttaattgatgcaccg 90
>KJC_c07455
Length = 700
Score = 89.7 bits (45), Expect = 2e-17
Identities = 100/117 (85%), Gaps = 1/117 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 538 tggcaagcatatgtctctgcaaataaaatttttgctgataggattatggaggtaattaac 597
||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||
Sbjct: 421 tggcaggcctatgtctctgctaataaaatttttgcagataaggtcatggaggttattaac 362
Query: 598 ccggaagatgatttcgtgtgggtgcatgactatcatcttatggtgctgccaactttt 654
|| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||
Sbjct: 361 cctgaagatgattacgtttgggt-catgactatcacctaatggttcttcctactttt 306
>KJC_c00488
Length = 2467
Score = 60.0 bits (30), Expect = 2e-08
Identities = 36/38 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 616 tgggtgcatgactatcatcttatggtgctgccaacttt 653
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct: 756 tgggtgcatgactatcatcttatggtgttgcctacttt 793
Score = 58.0 bits (29), Expect = 8e-08
Identities = 41/45 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 790 catacttttgactatgcaaggcatttcttgtcttgctgtagtaga 834
||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 930 catacttttgattatgcacgacatttcttgtcttgttgtagtaga 974
Score = 56.0 bits (28), Expect = 3e-07
Identities = 43/48 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 451 gggttttgtaagcaacagttatggcctttgtttcattacatgttgcct 498
|||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 591 gggttttgcaagcactatttatggcctctgtttcattacatgttgcct 638
>KJC_c00685
Length = 3018
Score = 52.0 bits (26), Expect = 5e-06
Identities = 51/58 (87%), Gaps = 1/58 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1711 tttgcttgtactgttggtaaaaaaccaa-gcaaagctaaatattatctggatgataca 1767
||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 407 tttgcctgtactgttggacaaaaaccaaagcaaagcaaaatactatttggatgataca 350