Jatropha Genome Database
- JcCB0041771.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0041771.10 + phase: 0
(507 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00269 993 0.0
KJC_s16561 906 0.0
>KJC_c00269
Length = 2004
Score = 993 bits (501), Expect = 0.0
Identities = 501/501 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagaggagagtcaggacagcaaactcaatagaatgagttgcagcagtggcatgccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150 atggaagaggagagtcaggacagcaaactcaatagaatgagttgcagcagtggcatgccc 209
Query: 61 gatgtcgttttagaatgtgtgatgccgtacatagatgacccacgagaccgcgacgctgtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210 gatgtcgttttagaatgtgtgatgccgtacatagatgacccacgagaccgcgacgctgtt 269
Query: 121 tcactggtttgtcgtcgctggtatgagcttgacgccttaacgcgaaagcatataacgatc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270 tcactggtttgtcgtcgctggtatgagcttgacgccttaacgcgaaagcatataacgatc 329
Query: 181 gctttatgctataccactagtccggatcggttacgacgtcgttttaagcaccttgaatcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 gctttatgctataccactagtccggatcggttacgacgtcgttttaagcaccttgaatcc 389
Query: 241 ctaaagctgaaagggaaaccaagagctgctatgtttaatttgataccggaggattgggga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390 ctaaagctgaaagggaaaccaagagctgctatgtttaatttgataccggaggattgggga 449
Query: 301 gggtttgtgacgccgtgggttaatgaaattgccgactcgtttgattgcttgaaatctgtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450 gggtttgtgacgccgtgggttaatgaaattgccgactcgtttgattgcttgaaatctgtt 509
Query: 361 cacttcagacgaatgattgtgaaggactcggatctggagcttctcgctaagtctcgtggt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510 cacttcagacgaatgattgtgaaggactcggatctggagcttctcgctaagtctcgtggt 569
Query: 421 cgggtcttgcaggtcttgaaacttgataagtgttctggattctctaccgatgggctttta 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 570 cgggtcttgcaggtcttgaaacttgataagtgttctggattctctaccgatgggctttta 629
Query: 481 catgtcggtcgcttgtgcagg 501
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 630 catgtcggtcgcttgtgcagg 650
>KJC_s16561
Length = 509
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 464/465 (99%), Gaps = 1/465 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggaagaggagagtcaggacagcaaactcaatagaatgagttgcagcagtggcatgccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 465 atggaagaggagagtcaggacagcaaactcaatagaatgagttgcagcagtggcatgccc 406
Query: 61 gatgtcgttttagaatgtgtgatgccgtacatagatgacccacgagaccgcgacgctgtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 405 gatgtcgttttagaatgtgtgatgccgtacatagatgacccacgagaccgcgacgctgtt 346
Query: 121 tcactggtttgtcgtcgctggtatgagcttgacgccttaacgcgaaagcatataacgatc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345 tcactggtttgtcgtcgctggtatgagcttgacgccttaacgcgaaagcatataacgatc 286
Query: 181 gctttatgctataccactagtccggatcggttacgacgtcgttttaagcaccttgaatcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285 gctttatgctataccactagtccggatcggttacgacgtcgttttaagcaccttgaatcc 226
Query: 241 ct-aaagctgaaagggaaaccaagagctgctatgtttaatttgataccggaggattgggg 299
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 225 ctaaaagctgaaagggaaaccaagagctgctatgtttaatttgataccggaggattgggg 166
Query: 300 agggtttgtgacgccgtgggttaatgaaattgccgactcgtttgattgcttgaaatctgt 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 165 agggtttgtgacgccgtgggttaatgaaattgccgactcgtttgattgcttgaaatctgt 106
Query: 360 tcacttcagacgaatgattgtgaaggactcggatctggagcttctcgctaagtctcgtgg 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 105 tcacttcagacgaatgattgtgaaggactcggatctggagcttctcgctaagtctcgtgg 46
Query: 420 tcgggtcttgcaggtcttgaaacttgataagtgttctggattctc 464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 45 tcgggtcttgcaggtcttgaaacttgataagtgttctggattctc 1