Jatropha Genome Database
- JcCB0039021.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0039021.10 - phase: 0 /partial
(1537 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c06508 1540 0.0
KJC_c09610 618 e-177
>KJC_c06508
Length = 805
Score = 1540 bits (777), Expect = 0.0
Identities = 805/809 (99%), Gaps = 4/809 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 726 gttattggtgggtgtaaggcgtgcaaatcgtcaacaaacaacattgccatcatctgtcct 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805 gttattggtgggtgtaaggcgtgcaaatcgtcaacaaacaacattgccatcatctgtcct 746
Query: 786 atctgctgatagcatgcatattggtgtccttgctgctgcagctcatgctgctgccaatcg 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745 atctgctgatagcatgcatattggtgtccttgctgctgcagctcatgctgctgccaatcg 686
Query: 846 gagtccattcaccattttttacaacccaagggcatgcccctcagagtttgtcattccttt 905
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 gagtccattcaccattttt-acaacccaagggcatgcccctcagagtttgtcattcctt- 628
Query: 906 aaccaagtatagaaaagctatatatggaactcaagtttcagttggaatgaggtttggaat 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 aaccaagtatagaaaagctatatatggaactcaagtttcagttggaatgaggtttggaat 568
Query: 966 gatgtttgagacagaggaatcaggcaaacgcagatatatgggcacaatagttggtattag 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 gatgtttgagacagaggaatcaggcaaacgcagatatatgggcacaatagttggtattag 508
Query: 1026 tgacttagatccgctgaggtggcctggctccaagtggcgaaatcttcaggtcgagtggga 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 tgacttagatccgctgaggtggcctggctccaagtggcgaaatcttcaggtcgagtggga 448
Query: 1086 tgagtcagggtgttccgataagcagaatagggtcagttcatgggaaattgagactcctga 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 tgagtcagggtgttccgataagcagaatagggtcagttcatgggaaattgagactcctga 388
Query: 1146 aagcctcttcatttttccttctctgacttcaggtctcaaacgacccttgcattcagggat 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 aagcctcttcatttttccttctctgacttcaggtctcaaacgacccttgcattcagggat 328
Query: 1206 gttaggaggagaaactgaatggagtaacttgataaaaagacccctcatctggcttcctga 1265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 gttaggaggagaaactgaatggagtaacttgataaaaagacccctcatctggcttcctga 268
Query: 1266 acatggaaatgggaattttccatattcttcaattccaaacctgtattctgagagacttta 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 acatggaaatgggaattttccatattcttcaattccaaacctgtattctgagagacttta 208
Query: 1326 caagatgctaatgaaacctcaggttaactatcctggaatctgtgagtctgccctccaaga 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 caagatgctaatgaaacctcaggttaactatcctggaatctgtgagtctgccctccaaga 148
Query: 1386 actctgtgctgctaaagcaactcctgttgatgatgtgaagaccatgcagggaccaatcaa 1445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 actctgtgctgctaaagcaactcctgttgatgatgtgaagaccatgcagggaccaatcaa 88
Query: 1446 tcagcttaaccagtcagtaggtatgtcagtagaaaaccaaaattattctcaattctgtgc 1505
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 87 tcagc-taaccagtcagtaggtatgtcagtagaaaacc-aaattattctcaattctgtgc 30
Query: 1506 caaccaatctgacgtaattaacccatctg 1534
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 caaccaatctgacgtaattaacccatctg 1
>KJC_c09610
Length = 611
Score = 618 bits (312), Expect = e-177
Identities = 333/336 (99%), Gaps = 3/336 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgatgatgggttctgttgaagagaaaatcaaagcaggaggtttggtcaatggagcacaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 333 atgatgatgggttctgttgaagagaaaatcaaagcaggaggtttggtcaatggagcacaa 274
Query: 61 accaatttactcgaggaaatgaagttgttaaaagaaattcaagaccattcagggactcgt 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 273 accaatttactcgaggaaatgaagttgttaaa-gaaattcaagaccattcagggactcgt 215
Query: 121 aagacgataaattcggagttgtggtacgcatgtgctggtccgcttgtttccttgcctcaa 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct: 214 aagacgataaattcggagttgtggtacgcatgtgctggtc-gcttgtt-ccttgcctcaa 157
Query: 181 gttggaagtcttgtgtattatttccctcaagggcacagtgaacaggtggcagtctccact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 gttggaagtcttgtgtattatttccctcaagggcacagtgaacaggtggcagtctccact 97
Query: 241 aaaagatcggcaacttcacaaattcctaactacccaaatctcccttctcagctattgtgc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 aaaagatcggcaacttcacaaattcctaactacccaaatctcccttctcagctattgtgc 37
Query: 301 caagttcacaatgttactctacatgcggataaagac 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 36 caagttcacaatgttactctacatgcggataaagac 1