Jatropha Genome Database
- JcCB0037771.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0037771.10 + phase: 0
(1407 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01155 1871 0.0
KJC_c03762 1021 0.0
>KJC_c01155
Length = 1185
Score = 1871 bits (944), Expect = 0.0
Identities = 944/944 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 313 ggatttgttctcgatatgttctgtgcgccggtgatagatgtggccaacgagtttggtgtc 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ggatttgttctcgatatgttctgtgcgccggtgatagatgtggccaacgagtttggtgtc 301
Query: 373 ccgtcttatattttctatacttcaagtgctgcttctcttggattttggctttatgtgcag 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ccgtcttatattttctatacttcaagtgctgcttctcttggattttggctttatgtgcag 361
Query: 433 tttattcatgatgagcaacatgtggaccttacccagttcaaggattccaacactgagttg 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tttattcatgatgagcaacatgtggaccttacccagttcaaggattccaacactgagttg 421
Query: 493 gtcgtgccgacttcggtgaactcagttcccggaagggttttcccttcatcgttctttgaa 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 gtcgtgccgacttcggtgaactcagttcccggaagggttttcccttcatcgttctttgaa 481
Query: 553 aaggagcggctcgttcctcttcttgcccatggaagaaggtttcgagaatctaaaggtatt 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 aaggagcggctcgttcctcttcttgcccatggaagaaggtttcgagaatctaaaggtatt 541
Query: 613 atggtaaattcattcatggaactagaatctcacgcgttcaactactttgggcacagtgaa 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 atggtaaattcattcatggaactagaatctcacgcgttcaactactttgggcacagtgaa 601
Query: 673 agtagtaaaactcctccggtgtatccggtggggcccattttgggccttgaaggcgacgtt 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 agtagtaaaactcctccggtgtatccggtggggcccattttgggccttgaaggcgacgtt 661
Query: 733 gtgtcagacggaagcatcggagataaggaaatcatgaaatggcttgatgatcaagctcca 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gtgtcagacggaagcatcggagataaggaaatcatgaaatggcttgatgatcaagctcca 721
Query: 793 gagtctgtggtgttcctttgctttgggagcggtggaggctttcctgaggatcaagtgaaa 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 gagtctgtggtgttcctttgctttgggagcggtggaggctttcctgaggatcaagtgaaa 781
Query: 853 gaaattgcttgtgcattagagcatacaggataccgattcttatggtccctacgacagctt 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 gaaattgcttgtgcattagagcatacaggataccgattcttatggtccctacgacagctt 841
Query: 913 ccacccaagggtaaaatgggacctccaagtgattatgaagatcttgcacaagttctacca 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 ccacccaagggtaaaatgggacctccaagtgattatgaagatcttgcacaagttctacca 901
Query: 973 acaggattcttagatcgcacggatggaattggcaaaataattgggtgggctccacagact 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 acaggattcttagatcgcacggatggaattggcaaaataattgggtgggctccacagact 961
Query: 1033 gctattttgggccacccagcgattggaggctttgtctcacactgtggatggaattctatt 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 gctattttgggccacccagcgattggaggctttgtctcacactgtggatggaattctatt 1021
Query: 1093 ctagagagcctatggtttggtgttccaatcgccacgtggccaatgtacgcagagcaacaa 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 ctagagagcctatggtttggtgttccaatcgccacgtggccaatgtacgcagagcaacaa 1081
Query: 1153 tttaatgcttttgcaatggtgattgagctgggattagcggtagaaataaaaatggattat 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 tttaatgcttttgcaatggtgattgagctgggattagcggtagaaataaaaatggattat 1141
Query: 1213 aagaaagatagtgagataattgtaagtgctaaggacatagagaa 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 aagaaagatagtgagataattgtaagtgctaaggacatagagaa 1185
>KJC_c03762
Length = 548
Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 547/553 (98%), Gaps = 5/553 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 25 gtgccttctccaggcgtcggtcatcttgcatcgacattaaaggcagccaaccttctcctt 84
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtgccttctccaggcgtcggtcatcttgcatcgacattaaaggcagccaaccttctcctt 60
Query: 85 ggccgccatgaacgaatttccatcactgtctttgtcatcaaactttcttctgatcttaag 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ggccgccatgaacgaatttccatcactgtctttgtcatcaaactttcttctgatcttaag 120
Query: 145 atcgctaaatatatcgattctcttcctacatctgatcgtatcagattcatccacctacga 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atcgctaaatatatcgattctcttcctacatctgatcgtatcagattcatccacctacga 180
Query: 205 cctaatgatgactctaacgattcacctctcacttttattgaaaaatataaaccccatatc 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cctaatgatgactctaacgattcacctctcacttttattgaaaaatataaaccccatatc 240
Query: 265 aaagaagccgtttctaaacttacggcgaactccgattcctctctcgcaggatttgttctc 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaagaagccgtttctaaacttacggcgaactccgattcctctctcgcaggatttgttctc 300
Query: 325 gatatgttctgtgcgccggtgatagatgtggccaacgagtttggtgtcccgtcttatatt 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatgttctgtgcgccggtgatagatgtggccaacgagtttggtgtcccgtcttatatt 360
Query: 385 ttctatacttcaagtgctgcttctcttggattttggctttatgtgcagtttattcatgat 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttctatacttcaagtgctgcttctcttggattttggctttatgtgcagtttattcatgat 420
Query: 445 gagcaacatgtggaccttacccagttcaaggattccaacactgagttggtcgtgccgact 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagcaacatgtggaccttacccagttcaaggattccaacactgagttggtcgtgccgact 480
Query: 505 tcggtgaactcagttcccggaagggttttcccttcatcgttctttgaaaaggagcggctc 564
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||
Sbjct: 481 tcggtgaactcagttcccggaa-ggttttccc-tcatcgttc-ttgaaa--gngcggctc 535
Query: 565 gttcctcttcttg 577
|||||||||||||
Sbjct: 536 gttcctcttcttg 548