Jatropha Genome Database
- JcCB0036391.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0036391.10 + phase: 0 /pseudo
(1383 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02355 2444 0.0
KJC_c08637 60 2e-08
>KJC_c02355
Length = 1592
Score = 2444 bits (1233), Expect = 0.0
Identities = 1270/1281 (99%), Gaps = 10/1281 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcttccatttctaaccttttcgtcaaaaccccttctatttctcactctcttcccaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1550 atggcttccatttctaaccttttcgtcaaaaccccttctatttctcactctcttcccaaa 1491
Query: 61 tccttcaacaaccatttcgctcctccactgagagtatctttctctccaaaacttcactcg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1490 tccttcaacaaccatttcgctcctccactgagagtatctttctctccaaaacttcactcg 1431
Query: 121 aaaaggttggcccgtattcgagcggggttgatcgaaccggacggtggcaagcttgtcgaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1430 aaaaggttggcccgtattcgagcggggttgatcgaaccggacggtggcaagcttgtcgaa 1371
Query: 181 ctcttcgtcgacaagtctcagaaggatgttagaaggaaagaggcgatttcattgcctaag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1370 ctcttcgtcgacaagtctcagaaggatgttagaaggaaagaggcgatttcattgcctaag 1311
Query: 241 attacgttgacgaagattgatagacaatgggttcatgtattgagcgnaggttgggcaagt 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1310 attacgttgacgaagattgatagacaatgggttcatgtattgagcgaaggttgggcaagt 1251
Query: 301 ccactttctggattcatgagagaatcccgagttcctccaaaactcttcattttaatgcca 360
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1250 ccactttctggattcatgagagaatcc-gagttcctccaaa-ctcttcattttaatgcca 1193
Query: 361 tccgtctcgaagacgggtcggttgttaacatgtcggtgccgattgtgctcgccatcgacg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1192 tccgtctcgaagacgggtcggttgttaacatgtcggtgccgattgtgctcgccatcgacg 1133
Query: 421 atttgcagaagcaacggatcggcgagtccaaaagggtcgctctcgtcgattctgacgata 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1132 atttgcagaagcaacggatcggcgagtccaaaagggtcgctctcgtcgattctgacgata 1073
Query: 481 agacgattgcaattttgaacgat--------ctacaagcaccccaaagaagaacgaatag 532
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1072 agacgattgcaattttgaacgatattgagatctacaagcaccccaaagaagaacgaatag 1013
Query: 533 caagaacttggggtactacagcccctggtcttccttatgttgaagaaactataaaaaagt 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1012 caagaacttggggtactacagcccctggtcttccttatgttgaagaaactataaaaaagt 953
Query: 593 ctgggaactggctgattggaggggacttggaggtaattgaaccaatcaagtaccatgatg 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 952 ctgggaactggctgattggaggggacttggaggtaattgaaccaatcaagtaccatgatg 893
Query: 653 gtctggatcgttttcgattgtcaccagcagaactccgcaaggaattcacaaagcggaatg 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 892 gtctggatcgttttcgattgtcaccagcagaactccgcaaggaattcacaaagcggaatg 833
Query: 713 cagatgctgtctttgcttttcagctgagaaatcctgtgcacaatggccatgctttactaa 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 832 cagatgctgtctttgcttttcagctgagaaatcctgtgcacaatggccatgctttactaa 773
Query: 773 tgacagatactcgtaagcggcttcttgagatgggttataagaatcctgtccttttgcttc 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 772 tgacagatactcgtaagcggcttcttgagatgggttataagaatcctgtccttttgcttc 713
Query: 833 atccattaggaggctatacaaaagctgatgatgttccgcttagttggcgaatgaagcaac 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 atccattaggaggctatacaaaagctgatgatgttccgcttagttggcgaatgaagcaac 653
Query: 893 atgagaaggttcttgaagatggtgtgcttgatcctgagacaactgtggtctctatatttc 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 atgagaaggttcttgaagatggtgtgcttgatcctgagacaactgtggtctctatatttc 593
Query: 953 catctcccatgcactatgctggtccaactgaggtgcagtggcatgcaaaagctcggatca 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 catctcccatgcactatgctggtccaactgaggtgcagtggcatgcaaaagctcggatca 533
Query: 1013 atgcaggagctaacttttacattgttggtagggatccagctggaatgagtcatccagttg 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 atgcaggagctaacttttacattgttggtagggatccagctggaatgagtcatccagttg 473
Query: 1073 agaaaagagatttatatgatgcggaccatgggaaaaaggtgctgagtatggctcctggac 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 agaaaagagatttatatgatgcggaccatgggaaaaaggtgctgagtatggctcctggac 413
Query: 1133 tggagcggctaaacatccttccttttaaggttgctgcgtatgataagacgcagggtaaaa 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 tggagcggctaaacatccttccttttaaggttgctgcgtatgataagacgcagggtaaaa 353
Query: 1193 tggcattctttgatcccacaagaccccaagatttcctcttcatatcaggcaccaagatgc 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 tggcattctttgatcccacaagaccccaagatttcctcttcatatcaggcaccaagatgc 293
Query: 1253 gaacacttgcgaagaacaagg 1273
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 gaacacttgcgaagaacaagg 272
>KJC_c08637
Length = 549
Score = 60.0 bits (30), Expect = 2e-08
Identities = 99/122 (81%)
Strand = Plus / Plus
Query: 898 aaggttcttgaagatggtgtgcttgatcctgagacaactgtggtctctatatttccatct 957
||||| || ||||||||||| ||||| ||| | || || | ||| ||||||| || ||
Sbjct: 377 aaggtgctcgaagatggtgttcttgaccctaatactaccattgtcgctatattcccttca 436
Query: 958 cccatgcactatgctggtccaactgaggtgcagtggcatgcaaaagctcggatcaatgca 1017
|| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| ||||||
Sbjct: 437 cctatgcattatgctggtccaactgaagtacagtggcatgccaagggacggataaatgca 496
Query: 1018 gg 1019
||
Sbjct: 497 gg 498