Jatropha Genome Database
- JcCB0027041.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0027041.20 - phase: 0
(1818 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c07709 1604 0.0
KJC_c11908 652 0.0
KJC_c11219 404 e-112
>KJC_c07709
Length = 872
Score = 1604 bits (809), Expect = 0.0
Identities = 851/857 (99%), Gaps = 6/857 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 305 gaggacttcccccggccatggctgcaagagggcaccgggtgatgacagtctctcctcgct 364
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17 gaggacttcccc-ggccatggctgcaagagggcaccgggtgatgacagtctctcctcgct 75
Query: 365 atgaccagtacagggacgcatgggacaccagtgtattggtgcagattaaa-gttggggat 423
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 76 atgaccagtacagggacgcatgggacaccagtgtattggtgcagattaaaagttggggat 135
Query: 424 aaaa-ttgaaactgtccgcttcttccactgctacaagcgaggagttgatcgtgtgttcgt 482
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aaaaattgaaactgtccgcttcttccactgctacaagcgaggagttgatcgtgtgttcgt 195
Query: 483 ggatcacccaattttccttgagaaggtttggggcaaaactgggtccaaaatctatggccc 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 ggatcacccaattttccttgagaaggtttggggcaaaactgggtccaaaatctatggccc 255
Query: 543 cagagcaggaatcgattacaaggacaaccaaatgcgatttagcttgttgtgcctagctgc 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 cagagcaggaatcgattacaaggacaaccaaatgcgatttagcttgttgtgcctagctgc 315
Query: 603 tcttgaggcaccaagaattctgaacttgaacagcaacaaatatttctcaggaccatatgg 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 tcttgaggcaccaagaattctgaacttgaacagcaacaaatatttctcaggaccatatgg 375
Query: 663 agaggatgttatcttcattgccaatgattggcacgctgctattcttccatgttacctaaa 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 agaggatgttatcttcattgccaatgattggcacgctgctattcttccatgttacctaaa 435
Query: 723 atccatttacaaacctatgggaatttaccagagtgccaaggttgccttttgcatccacaa 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 436 atccatttacaaacctatgggaatttaccagagtgccaaggttgccttttgcatccacaa 495
Query: 783 cattgcatatcagggcagatttgccttctcagacttctcacttctcaacttgccagatca 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cattgcatatcagggcagatttgccttctcagacttctcacttctcaacttgccagatca 555
Query: 843 atataagggctcctttgactttatcgatggatataataagcctgtcaagggaaggaaaat 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 556 atataagggctcctttgactttatcgatggatataataagcctgtcaagggaaggaaaat 615
Query: 903 caattggatgaaggctggaatcttggaatcagacagggttttgactgtgagcccatacta 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 616 caattggatgaaggctggaatcttggaatcagacagggttttgactgtgagcccatacta 675
Query: 963 tgcccaggaacttgtttctggagaagatagaggtgtggagctggataatatcattcgcaa 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 676 tgcccaggaacttgtttctggagaagatagaggtgtggagctggataatatcattcgcaa 735
Query: 1023 aactggcattactggtattgtaaatggtatggatgtccaggagtggaatcctgctactga 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 736 aactggcattactggtattgtaaatggtatggatgtccaggagtggaatcctgctactga 795
Query: 1083 caaatat-atagatatcaactatgatgc-aacaactgttatggatgcaaag-cctttatt 1139
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 796 caaatataatagatatcaactatgatgcaaacaactgttatggatgcaaagacctttatt 855
Query: 1140 aaaggaagctcttcaag 1156
|||||||||||||||||
Sbjct: 856 aaaggaagctcttcaag 872
>KJC_c11908
Length = 329
Score = 652 bits (329), Expect = 0.0
Identities = 329/329 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1309 ggctttgaaaagcaaattcgacagctggaggtattgtacccagataaggctagaggagtt 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggctttgaaaagcaaattcgacagctggaggtattgtacccagataaggctagaggagtt 60
Query: 1369 gcaaaattcaatgtcccgttggcccatatgatcatagctggttctgattttatgttgata 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gcaaaattcaatgtcccgttggcccatatgatcatagctggttctgattttatgttgata 120
Query: 1429 ccaagtagatttgagccctgtggtctcattcaattgcatgctatgcgatatggaacggtg 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccaagtagatttgagccctgtggtctcattcaattgcatgctatgcgatatggaacggtg 180
Query: 1489 cccattgttgcttccactggtggtcttgttgacactgttaaagaaggttacacaggattc 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cccattgttgcttccactggtggtcttgttgacactgttaaagaaggttacacaggattc 240
Query: 1549 caaatgggggccttccacgttgaatgtgacagagttgatccggctgatgtagctgcagtg 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caaatgggggccttccacgttgaatgtgacagagttgatccggctgatgtagctgcagtg 300
Query: 1609 gttacagctgttgtaagagctcttgccac 1637
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gttacagctgttgtaagagctcttgccac 329
>KJC_c11219
Length = 233
Score = 404 bits (204), Expect = e-112
Identities = 204/204 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 32 cgaggagcagccatggatcagaagcaaagcctcagattggactcaggactcaaaccatga 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cgaggagcagccatggatcagaagcaaagcctcagattggactcaggactcaaaccatga 60
Query: 92 cttaccatggcttaaggtctctcaacatggtggataagctgcaaatgagaaaacaatcca 151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cttaccatggcttaaggtctctcaacatggtggataagctgcaaatgagaaaacaatcca 120
Query: 152 aggcagtggctaccaaagctgggaaaaaagtgtctgcaacaaagaatgatagaccttccg 211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aggcagtggctaccaaagctgggaaaaaagtgtctgcaacaaagaatgatagaccttccg 180
Query: 212 gcaatatcatttgtgggcaaggca 235
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcaatatcatttgtgggcaaggca 204