Jatropha Genome Database
- JcCB0024801.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0024801.10 - phase: 0
(1542 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03518 2456 0.0
KJC_s15463 587 e-167
>KJC_c03518
Length = 1268
Score = 2456 bits (1239), Expect = 0.0
Identities = 1260/1268 (99%), Gaps = 1/1268 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 178 gagattgctgacatcattgagcttgagaaagcgcgccaatggaagggacttgaactcatc 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gagattgctgacatcattgagcttgagaaagcgcgccaatggaagggacttgaactcatc 60
Query: 238 ccttcagagaacttcacttctgtatcggtgatgcaagctgttggatctgtaatgactaac 297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ccttcagagaacttcacttctgtatcggtgatgcaagctgttggatctgtaatgactaac 120
Query: 298 aaatacagtgaaggatatcccggagcaagatactatggaggaaatgagtatattgacatg 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaatacagtgaaggatatcccggagcaagatactatggaggaaatgagtatattgacatg 180
Query: 358 gctgaaaccttgtgtcagaagcgtgcattggaagcatttcgattggatcctgcaaaatgg 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gctgaaaccttgtgtcagaagcgtgcattggaagcatttcgattggatcctgcaaaatgg 240
Query: 418 ggagtgaatgtgcagtctctatctgggtccccagcaaattttcaagtctacactgctttg 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ggagtgaatgtgcagtctctatctgggtccccagcaaattttcaagtctacactgctttg 300
Query: 478 ttaaaacctcatgatagaatcatggcacttgatcttcctcatggagggcatctttctcat 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttaaaacctcatgatagaatcatggcacttgatcttcctcatggagggcatctttctcat 360
Query: 538 ggctatcagacggacaccnnnnnnntatctgcagtgtcgatattttttgagacaatgcca 597
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ggctatcagacggacaccaaaaaaatatctgcagtgtcgatattttttgagacaatgcca 420
Query: 598 tacagattgaatgaaagcactggctatattgactatgaccagctggagaaaagtgccacc 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tacagattgaatgaaagcactggctatattgactatgaccagctggagaaaagtgccacc 480
Query: 658 cttttcagaccaaagttaatagttgctggtgctagtgcttatgctcgtctttatgattat 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 cttttcagaccaaagttaatagttgctggtgctagtgcttatgctcgtctttatgattat 540
Query: 718 tcacgcattcgcaaggtttgcgacaaacaaaa-agctatattgttagcagatatggcaca 776
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tcacgcattcgcaaggtttgcgacaaacaaaaaagctatattgttagcagatatggcaca 600
Query: 777 cattagtgggttggttgcagctggtgtcatcccatcaccttttgagtatgcagatgtagt 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 cattagtgggttggttgcagctggtgtcatcccatcaccttttgagtatgcagatgtagt 660
Query: 837 gaccaccacaactcacaagtcacttcgtgggccacgtggagccatgattttctacaggaa 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gaccaccacaactcacaagtcacttcgtgggccacgtggagccatgattttctacaggaa 720
Query: 897 gggggtaaaagagattaacaaacaaggccaacaggtgttgtatgactttgaagacaaaat 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gggggtaaaagagattaacaaacaaggccaacaggtgttgtatgactttgaagacaaaat 780
Query: 957 caatcaagctgtttttcctggactccaagggggcccgcacaaccacacaattacaggttt 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 caatcaagctgtttttcctggactccaagggggcccgcacaaccacacaattacaggttt 840
Query: 1017 agcagttgcactgaaacaggccacaactccagaatataaagcctatcaggagcaagttct 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 agcagttgcactgaaacaggccacaactccagaatataaagcctatcaggagcaagttct 900
Query: 1077 cagtaattgctcaaaatttgccgagactttagtggagaagggatatgatctcgtgtctgg 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 cagtaattgctcaaaatttgccgagactttagtggagaagggatatgatctcgtgtctgg 960
Query: 1137 tggaactgaaaaccatttagttttagtgaatttgaagaacaagggtattgatggatccag 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 tggaactgaaaaccatttagttttagtgaatttgaagaacaagggtattgatggatccag 1020
Query: 1197 agttgaaaaggttctggaagctgttcacattgctgcaaacaaaaataccgttcctggaga 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 agttgaaaaggttctggaagctgttcacattgctgcaaacaaaaataccgttcctggaga 1080
Query: 1257 tgtatctgccatggttcctggtggcataaggatgggaacccctgctcttacgtctagggg 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tgtatctgccatggttcctggtggcataaggatgggaacccctgctcttacgtctagggg 1140
Query: 1317 atttgttgaggaggattttgctaaagtagcagaattctttgatgctgctgtgaagttggc 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 atttgttgaggaggattttgctaaagtagcagaattctttgatgctgctgtgaagttggc 1200
Query: 1377 agtgaaaatcaaggctgcaaccaaagggacaaagttgaaggacttcttggctgcacttcc 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 agtgaaaatcaaggctgcaaccaaagggacaaagttgaaggacttcttggctgcacttcc 1260
Query: 1437 taacttcc 1444
||||||||
Sbjct: 1261 taacttcc 1268
>KJC_s15463
Length = 551
Score = 587 bits (296), Expect = e-167
Identities = 303/304 (99%), Gaps = 1/304 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 874 ggagccatgattttctacaggaagggggtaaaagagattaacaaacaaggccaacaggtg 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggagccatgattttctacaggaagggggtaaaagagattaacaaacaaggccaacaggtg 60
Query: 934 ttgtatgactttgaagacaaaatcaatcaagctgtttttcctggactccaagggggcccg 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttgtatgactttgaagacaaaatcaatcaagctgtttttcctggactccaagggggcccg 120
Query: 994 cacaaccacacaattacaggtttagcagttgcactgaaacaggccacaactccagaatat 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cacaaccacacaattacaggtttagcagttgcactgaaacaggccacaactccagaatat 180
Query: 1054 aaagcctatcaggagcaagttctcagtaattgctcaaaatttgccgagactttagtggag 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aaagcctatcaggagcaagttctcagtaattgctcaaaatttgccgagactttagtggag 240
Query: 1114 aagggatatgatctcgtgtctggtggaactgaaaaccatttagttttagtgaatttgaag 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagggatatgatctcgtgtctggtggaactgaaaaccatttag-tttagtgaatttgaag 299
Query: 1174 aaca 1177
||||
Sbjct: 300 aaca 303