Jatropha Genome Database
- JcCB0022671.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0022671.20 - phase: 0
(1563 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04620 1756 0.0
KJC_c09711 876 0.0
KJC_c01697 107 8e-23
>KJC_c04620
Length = 975
Score = 1756 bits (886), Expect = 0.0
Identities = 955/968 (98%), Gaps = 10/968 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 601 gccgaacagatttttatgcatgagcc--aacagttcttcaattgaaagctccagttaaag 658
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 975 gccgaacagatttttatgcatgagacctaacagttcttcaattgaa-gctccagttaag- 918
Query: 659 tttttggtgatcttcatggacagtttggtgatttgatgcgtctattcgatgaatatggat 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 917 -ttttggtgatcttcatggacagtttggtgatttgatgcgtctattcgatgaatatggat 859
Query: 719 ttccatccactgcaggagacatcacttacattgactatttgttcttgggagactacgttg 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 858 ttccatccactgcaggagacatcacttacattgactatttgttcttgggagactacgttg 799
Query: 779 atcgaggacagcacagtttagagactataactttgcttcttgctcttaagattgaatatc 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 798 atcgaggacagcacagtttagagactataactttgcttcttgctcttaagattgaatatc 739
Query: 839 ctgagaatgttcatttgatacgtggaaaccatgaagctgctgacataaatgcactgtttg 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 ctgagaatgttcatttgatacgtggaaaccatgaagctgctgacataaatgcactgtttg 679
Query: 899 gatttcgtatcgagtgcattgagagaatgggagagagtgatgggatatgggcatggactc 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 gatttcgtatcgagtgcattgagagaatgggagagagtgatgggatatgggcatggactc 619
Query: 959 gtttcaatcaacttttcaactttcttccacttgctgcacttattgagaagaaaattattt 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 618 gtttcaatcaacttttcaactttcttccacttgctgcacttattgagaagaaa-ttattt 560
Query: 1019 gtatgcatggtggcattgggagatctattcattcggtggagcagatagagaagattgaaa 1078
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 559 gtatgcatggtggcatcgggagatctattcattcggtggagcagatagagaagattgaaa 500
Query: 1079 ggcccataacgatggatgctggatctataattctaatggatcttttatggtctgatccga 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 499 ggcccataacgatggatgctggatctataattctaatggatcttt-atggtctgatccga 441
Query: 1139 cagaaaatgatagcatagaaggtttgagaccaaatgctagaggccctggtcttgtcactt 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cagaaaatgatagcatagaaggtttgagaccaaatgctagaggccctggtcttgtcactt 381
Query: 1199 ttgggcctgaccgcgtgacggacttctgtaagaaaaataagttacagctgatcataaggg 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 ttgggcctgaccgcgtgacggacttctgtaagaaaaataagttacagctgatcataaggg 321
Query: 1259 cacatgaatgcgttatggatgggtttgaacggtttgcacaaggtcaattgattacgctct 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 cacatgaatgcgttatggatgggtttgaacggtttgcacaaggtcaattgattacgctct 261
Query: 1319 tttctgcaactaactattgcgggactgcgaacaatgctggagctatactagtggttggca 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 tttctgcaactaactattgcgggactgcgaacaatgctggagctatactagtggttggca 201
Query: 1379 ggggtttggttgtggttccaaagttgattcatcccttgccacctccacttcagtcgccag 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 ggggtttggttgtggttccaaagttgattcatcccttgccacctccacttcagtcgccag 141
Query: 1439 agacatctccagagcgcgtcatggatgatacatggatgcaggagctcaacatacaaagac 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 agacatctccagagcgcgtcatggatgatacatggatgcaggagctcaacatacaaagac 81
Query: 1499 cgcccaccccaactcggggtcgcccgcaa-cccgacctt-gacagga-gctcactggctt 1555
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct: 80 cgcccaccccaactcggggtcgcccgcaaccccgaccttcgacaggacgctcactggctt 21
Query: 1556 atatatga 1563
||||||||
Sbjct: 20 atatatga 13
>KJC_c09711
Length = 592
Score = 876 bits (442), Expect = 0.0
Identities = 442/442 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgaattctcctgtattaacatctgagagagcctcaactataacaagtcccagattgaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 atgaattctcctgtattaacatctgagagagcctcaactataacaagtcccagattgaat 383
Query: 61 cattctaatttaaatccttatgaaacaatgtcagatggtgggttggagatcccttcatct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 cattctaatttaaatccttatgaaacaatgtcagatggtgggttggagatcccttcatct 323
Query: 121 ggttctatcagttttatggacaaaaattctatggagaaacttagggaggcttctgctgct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 ggttctatcagttttatggacaaaaattctatggagaaacttagggaggcttctgctgct 263
Query: 181 gaagctcaggccgctagtgctgtctggcaagctgctcaggcagcaactacctattctgct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 gaagctcaggccgctagtgctgtctggcaagctgctcaggcagcaactacctattctgct 203
Query: 241 gaagtgacatctgtgtctgatgacaattcacaagctgcagaagctacttcagatggtagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gaagtgacatctgtgtctgatgacaattcacaagctgcagaagctacttcagatggtagt 143
Query: 301 gacactgaggctgatgttcgcctgcatccaagagctgttgtggtagctaaagaggctgtg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 gacactgaggctgatgttcgcctgcatccaagagctgttgtggtagctaaagaggctgtg 83
Query: 361 gggaatctcggtgggatggtgaggcaattgtcactagatcaatttgaaaatgaaagcaga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82 gggaatctcggtgggatggtgaggcaattgtcactagatcaatttgaaaatgaaagcaga 23
Query: 421 cgaatggttcctgtgaacaacg 442
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22 cgaatggttcctgtgaacaacg 1
>KJC_c01697
Length = 1644
Score = 107 bits (54), Expect = 8e-23
Identities = 222/278 (79%)
Strand = Plus / Minus
Query: 760 ttcttgggagactacgttgatcgaggacagcacagtttagagactataactttgcttctt 819
||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | || |||
Sbjct: 1114 ttcttaggagattatgttgatcgaggacagcacagcttggagactattacgcttctgctt 1055
Query: 820 gctcttaagattgaatatcctgagaatgttcatttgatacgtggaaaccatgaagctgct 879
||| | ||| |||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1054 gctttgaaggttgagtatccccataatgttcatttaattcgtgggaaccatgaagctgca 995
Query: 880 gacataaatgcactgtttggatttcgtatcgagtgcattgagagaatgggagagagtgat 939
|| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||| || || |||
Sbjct: 994 gatatcaatgccctttttggctttcggattgagtgcattgagcgcatgggggaaagagat 935
Query: 940 gggatatgggcatggactcgtttcaatcaacttttcaactttcttccacttgctgcactt 999
|| || |||| ||| ||| | |||| | ||||| | ||||| | || |||||
Sbjct: 934 ggaatttgggtttggcatcggataaatcggttgttcaattggcttcctttggcagcacta 875
Query: 1000 attgagaagaaaattatttgtatgcatggtggcattgg 1037
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 874 attgaaaagaaaattatttgtatgcatggtggtattgg 837