Jatropha Genome Database
- JcCB0015511.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0015511.10 + phase: 1 /partial
(1676 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01700 1433 0.0
KJC_c10754 955 0.0
KJC_s16633 252 2e-66
>KJC_c01700
Length = 942
Score = 1433 bits (723), Expect = 0.0
Identities = 723/723 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 380 tggaacgccgttccgtcagctcaccaccaccgctgaccttgctaatcctcttagtgttcc 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 723 tggaacgccgttccgtcagctcaccaccaccgctgaccttgctaatcctcttagtgttcc 664
Query: 440 ttcgaatccgatttctaacactgaaccgcctgtaattaataaaacggtgagctctagagt 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 ttcgaatccgatttctaacactgaaccgcctgtaattaataaaacggtgagctctagagt 604
Query: 500 ggtagttgggcgccatgggatccggatccggccttggcctcacccgaacccgagtgaggt 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 ggtagttgggcgccatgggatccggatccggccttggcctcacccgaacccgagtgaggt 544
Query: 560 gatgagagcgcatcagataattgagagagtgcagagagagcagaggattcagtttggagt 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 gatgagagcgcatcagataattgagagagtgcagagagagcagaggattcagtttggagt 484
Query: 620 gaagagccctaagactgttatcgcggttacgccgacttatgtacggactttccagacgct 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 gaagagccctaagactgttatcgcggttacgccgacttatgtacggactttccagacgct 424
Query: 680 gcatttgactggcgttatgcactcattgatggttgtcccttacgacgtcgtgtggatcgt 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 gcatttgactggcgttatgcactcattgatggttgtcccttacgacgtcgtgtggatcgt 364
Query: 740 tgtagaggccggtggagtcagtaacgaaaccgcttcgattattgcaaagtcgggagttaa 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 tgtagaggccggtggagtcagtaacgaaaccgcttcgattattgcaaagtcgggagttaa 304
Query: 800 gactgttcatatcgggttcaagcagaaaatgccgaattcgtgggagggacggcataagtt 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 gactgttcatatcgggttcaagcagaaaatgccgaattcgtgggagggacggcataagtt 244
Query: 860 ggaggctaaaatgcgacttcacgctttgagagttgtgagagagcagaagctggatgggat 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 ggaggctaaaatgcgacttcacgctttgagagttgtgagagagcagaagctggatgggat 184
Query: 920 agtgatgtttgctgatgatagtaatatgcatagtatggaactctttgatgaaatccaaaa 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 agtgatgtttgctgatgatagtaatatgcatagtatggaactctttgatgaaatccaaaa 124
Query: 980 cgtgaagtggtttggtgctgtttccattgggattctggctcattcaggtggtgctgatga 1039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 cgtgaagtggtttggtgctgtttccattgggattctggctcattcaggtggtgctgatga 64
Query: 1040 gccatcattggctacggttgagaaggagatagagaagagccagtcaatgcctgtgcaggg 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 gccatcattggctacggttgagaaggagatagagaagagccagtcaatgcctgtgcaggg 4
Query: 1100 ccc 1102
|||
Sbjct: 3 ccc 1
Score = 323 bits (163), Expect = 8e-88
Identities = 163/163 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 159 atgaagctctcggcgttgcagcagagctacatgaaccgccggagcactagctttagagga 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 942 atgaagctctcggcgttgcagcagagctacatgaaccgccggagcactagctttagagga 883
Query: 219 tcagctccgttagattcgtcttctgacagcgcgattaaatctcctgcagctatcttttgg 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 882 tcagctccgttagattcgtcttctgacagcgcgattaaatctcctgcagctatcttttgg 823
Query: 279 cttgttctacacggtgtttgctgccttattagtcttgtgctcg 321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 822 cttgttctacacggtgtttgctgccttattagtcttgtgctcg 780
>KJC_c10754
Length = 482
Score = 955 bits (482), Expect = 0.0
Identities = 482/482 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1079 ccagtcaatgcctgtgcagggccctgcttgtaatgcatctaacaagctggctggttggca 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccagtcaatgcctgtgcagggccctgcttgtaatgcatctaacaagctggctggttggca 60
Query: 1139 cacctttaattcactgccatatgagggaaaaaatgcaatttatattgatgacagggcaac 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cacctttaattcactgccatatgagggaaaaaatgcaatttatattgatgacagggcaac 120
Query: 1199 tgtgctgccccagaggctagaatgggctgggtttgtgttgaattctagattgctttggaa 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgtgctgccccagaggctagaatgggctgggtttgtgttgaattctagattgctttggaa 180
Query: 1259 ggaaactgaagataagccagactggataaatgatttagattctgttgatgaggatataga 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggaaactgaagataagccagactggataaatgatttagattctgttgatgaggatataga 240
Query: 1319 gagtcctctacctctgttgaaagacccttctatggtggagccactaggaagctgtgggag 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gagtcctctacctctgttgaaagacccttctatggtggagccactaggaagctgtgggag 300
Query: 1379 acaagttttgctgtggtggcttcgtgttgaagctcgtagtgatagcaaatttcctccagg 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 acaagttttgctgtggtggcttcgtgttgaagctcgtagtgatagcaaatttcctccagg 360
Query: 1439 atggataatcgatcctccattggaaattacggtcccatcaaaacgaacaccatggccaga 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atggataatcgatcctccattggaaattacggtcccatcaaaacgaacaccatggccaga 420
Query: 1499 tgctcctcctgagcttcctgctaatgaaaagccagtgattagcacctcagtctcagagca 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tgctcctcctgagcttcctgctaatgaaaagccagtgattagcacctcagtctcagagca 480
Query: 1559 ga 1560
||
Sbjct: 481 ga 482
>KJC_s16633
Length = 167
Score = 252 bits (127), Expect = 2e-66
Identities = 127/127 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 855 aagttggaggctaaaatgcgacttcacgctttgagagttgtgagagagcagaagctggat 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aagttggaggctaaaatgcgacttcacgctttgagagttgtgagagagcagaagctggat 60
Query: 915 gggatagtgatgtttgctgatgatagtaatatgcatagtatggaactctttgatgaaatc 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gggatagtgatgtttgctgatgatagtaatatgcatagtatggaactctttgatgaaatc 120
Query: 975 caaaacg 981
|||||||
Sbjct: 121 caaaacg 127