Jatropha Genome Database
- JcCB0013521.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0013521.20 - phase: 0
(1458 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00617 2859 0.0
>KJC_c00617
Length = 1663
Score = 2859 bits (1442), Expect = 0.0
Identities = 1456/1458 (99%), Gaps = 2/1458 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcgttacagagccaattcttgaagagaactgtagaagaagccaaatccaagctcttt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1652 atggcgttacagagccaattcttgaagagaactgtagaagaagccaaatccaagctcttt 1593
Query: 61 ctttacaataaaagatttatctgcagttctttctctaccgttccttcatcttctgcaacc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1592 ctttacaataaaagatttatctgcagttctttctctaccgttccttcatcttctgcaacc 1533
Query: 121 gccgcagccgatgctcctccgcctcgtctcccgctgttcgattaccagcctaagccgtat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1532 gccgcagccgatgctcctccgcctcgtctcccgctgttcgattaccagcctaagccgtat 1473
Query: 181 aaaggaccgttggctgatgagattctacagaaacgaaagaagtatctaggtccttctctc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1472 aaaggaccgttggctgatgagattctacagaaacgaaagaagtatctaggtccttctctc 1413
Query: 241 ttctactactatcagaaacctctgaatattgtagaagggaagatgcagtacttgtttgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1412 ttctactactatcagaaacctctgaatattgtagaagggaagatgcagtacttgtttgat 1353
Query: 301 gaaagtgggcgaaggtacttagacgcatttgccgggattgtaacggtgtcgtgtgggcat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1352 gaaagtgggcgaaggtacttagacgcatttgccgggattgtaacggtgtcgtgtgggcat 1293
Query: 361 tgccatcctgaagttttaaatgctatcaatgagcagaacaaacttctccaacatgctact 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 tgccatcctgaagttttaaatgctatcaatgagcagaacaaacttctccaacatgctact 1233
Query: 421 accatctacttgcaccatgccattgctgattttgcagaggcattagctgctaagatgcct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 accatctacttgcaccatgccattgctgattttgcagaggcattagctgctaagatgcct 1173
Query: 481 ggaaatcttaaggtagtgtattttgtaaattctgggtcagaagcaaatgaattagctatg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 ggaaatcttaaggtagtgtattttgtaaattctgggtcagaagcaaatgaattagctatg 1113
Query: 541 ctgatggccagactatatagtggtaatcttgagatgatttcgttgagaaatgcatatcac 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 ctgatggccagactatatagtggtaatcttgagatgatttcgttgagaaatgcatatcac 1053
Query: 601 ggtggaagctctaatacaattggactaactgctttaaacacgtggaagtaccctattcca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 ggtggaagctctaatacaattggactaactgctttaaacacgtggaagtaccctattcca 993
Query: 661 cagggtgaaatccaccatgtcatgaacccagatccgtaccgagggctctttggttctgat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 cagggtgaaatccaccatgtcatgaacccagatccgtaccgagggctctttggttctgat 933
Query: 721 ccagctggttatgccaaagatgtgcaagatcatattgaatatggtacttcaggaaaagtt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 ccagctggttatgccaaagatgtgcaagatcatattgaatatggtacttcaggaaaagtt 873
Query: 781 gctggatttatatctgaaacaattcagggagttggaggagcagttgaattagcccctgga 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 gctggatttatatctgaaacaattcagggagttggaggagcagttgaattagcccctgga 813
Query: 841 tacttaaaaatggtttatgacattgtacgcaaagctggtggtgtctgcattgctgatgaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 tacttaaaaatggtttatgacattgtacgcaaagctggtggtgtctgcattgctgatgaa 753
Query: 901 gtgcaaactggatttggtcgcacaggaagccattattggggttttgaaacacaaggagtc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 gtgcaaactggatttggtcgcacaggaagccattattggggttttgaaacacaaggagtc 693
Query: 961 attcccgacattgttaccatggcaaagggtattggcaatggtttgccactaggagcagtg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 attcccgacattgttaccatggcaaagggtattggcaatggtttgccactaggagcagtg 633
Query: 1021 gtgacaacaccagagatagcaaatgtgatggcgcaaaaaattcaatttaatactttcggt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 gtgacaacaccagagatagcaaatgtgatggcgcaaaaaattcaatttaatactttcggt 573
Query: 1081 ggcaacccagtctgttctgctggtggacttgcagttctgagagttattgacaaagaaagg 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct: 572 ggcaacccagtctgttctgctggtggacttgcagttctgagagtta-tgacaaag-aagg 515
Query: 1141 cgtcaagaacattgtgccaatgttggttcccacctgattggccgcttgagagatctacag 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 cgtcaagaacattgtgccaatgttggttcccacctgattggccgcttgagagatctacag 455
Query: 1201 caaagacatgacatcatcggagatgtaagagggaggggtctaatggtggggatagaactt 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 caaagacatgacatcatcggagatgtaagagggaggggtctaatggtggggatagaactt 395
Query: 1261 gtaactgacaggaaggagaagacgcctgccaaggcagaaactgcaattttgtttgagaaa 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 gtaactgacaggaaggagaagacgcctgccaaggcagaaactgcaattttgtttgagaaa 335
Query: 1321 cttagagagctcggcattcttgttgggaaaggtggactccatggaaatgtttttcgagta 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 cttagagagctcggcattcttgttgggaaaggtggactccatggaaatgtttttcgagta 275
Query: 1381 aagccacctatgtgtttcactaaagatgacgcagattttcttgtggatgctttggactat 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 aagccacctatgtgtttcactaaagatgacgcagattttcttgtggatgctttggactat 215
Query: 1441 tctatgtcaaggttatga 1458
||||||||||||||||||
Sbjct: 214 tctatgtcaaggttatga 197