Jatropha Genome Database
- JcCB0011311.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0011311.20 - phase: 0 /partial
(930 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01751 1816 0.0
KJC_c10380 141 3e-33
KJC_c02282 98 5e-20
>KJC_c01751
Length = 1155
Score = 1816 bits (916), Expect = 0.0
Identities = 930/932 (99%), Gaps = 2/932 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gtgtattcattggattggacttctgaaagaaatcgaattgttagtgcatctcaagatggg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 gtgtattcattggattggacttctgaaagaaatcgaattgttagtgcatctcaagatggg 877
Query: 61 cggttgatagtgtggaatgctctaacaagccagaaaactcatgccatcaagttgccctgt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 cggttgatagtgtggaatgctctaacaagccagaaaactcatgccatcaagttgccctgt 817
Query: 121 gcatgggttatgacttgtgctttctctccaactggtcagtctgttgcttgtggtggtctt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 gcatgggttatgacttgtgctttctctccaactggtcagtctgttgcttgtggtggtctt 757
Query: 181 gatagtgtttgctctattttcaaccttaattcaccaactgatagggatgggaacctgcct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 gatagtgtttgctctattttcaaccttaattcaccaactgatagggatgggaacctgcct 697
Query: 241 gtatcaaagatgcttagtgggcacaagggttatgtttcctcgtgtcagtatgtaccagat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 gtatcaaagatgcttagtgggcacaagggttatgtttcctcgtgtcagtatgtaccagat 637
Query: 301 gaggacactcacctaattacaagttcgggtgatcagacttgtgttttgtgggatattacc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 gaggacactcacctaattacaagttcgggtgatcagacttgtgttttgtgggatattacc 577
Query: 361 acgggccttaggacttctgtgtttggaggagagtttcagtctggacacacagcagatgta 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 acgggccttaggacttctgtgtttggaggagagtttcagtctggacacacagcagatgta 517
Query: 421 ctgagcatctcaatcaatgggtcaagctcaagaatgttcgtatctggctcctgtgactca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 ctgagcatctcaatcaatgggtcaagctcaagaatgttcgtatctggctcctgtgactca 457
Query: 481 accgcccgattgtgggatactcgcgttgctagtcgagctgtgcgtacttttcatgggcat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 accgcccgattgtgggatactcgcgttgctagtcgagctgtgcgtacttttcatgggcat 397
Query: 541 gagggagatgttaatgctgtgaagttctttccagatggcaatagatttggaactggatct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 gagggagatgttaatgctgtgaagttctttccagatggcaatagatttggaactggatct 337
Query: 601 gacgatggaacttgtagattgtttgacatcagaactgggcatcaactccaagtatactat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 gacgatggaacttgtagattgtttgacatcagaactgggcatcaactccaagtatactat 277
Query: 661 caacagcatggtgacaatgaagtccctcatgtgacctctattgcattctccatatcagga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 caacagcatggtgacaatgaagtccctcatgtgacctctattgcattctccatatcagga 217
Query: 721 agacttctctttgctggatattcaaatggtgattgctatgtttgggatactttattagcg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 agacttctctttgctggatattcaaatggtgattgctatgtttgggatactttattagcg 157
Query: 781 caggttgttttaaacttgggatctctgcagaattcgcatgagggtcggataagctgtttg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 caggttgttttaaacttgggatctctgcagaattcgcatgagggtcggataagctgtttg 97
Query: 841 ggcttgtcagcagatgggagtgccttgtgtacaggaagttatgatacaaacctaaag-at 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 96 ggcttgtcagcagatgggagtgccttgtgtacaggaagttatgatacaaacctaaagtat 37
Query: 900 ttgggcgttcggaggcca-taggaaggtgatt 930
|||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 36 ttgggcgttcggaggccagtaggaaggtgatt 5
>KJC_c10380
Length = 92
Score = 141 bits (71), Expect = 3e-33
Identities = 71/71 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 860 gtgccttgtgtacaggaagttatgatacaaacctaaagatttgggcgttcggaggccata 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 80 gtgccttgtgtacaggaagttatgatacaaacctaaagatttgggcgttcggaggccata 21
Query: 920 ggaaggtgatt 930
|||||||||||
Sbjct: 20 ggaaggtgatt 10
>KJC_c02282
Length = 1403
Score = 97.6 bits (49), Expect = 5e-20
Identities = 122/144 (84%), Gaps = 3/144 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 636 tgggcatcaact--ccaagtatactatcaacagcatggtgacaatgaagtccctcatgtg 693
|||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||
Sbjct: 210 tgggcatcaactatccaagcatactgttaacagcatggtgtcagtgaagttcctcatgta 151
Query: 694 acctctattgcattctccatatcaggaagacttctctttgctggatattc-aaatggtga 752
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| | |
Sbjct: 150 acctctattgcattctccatacgaggaagactcttctttagtggacattcaaaattgcaa 91
Query: 753 ttgctatgtttgggatactttatt 776
|||||||||||| |||| ||||||
Sbjct: 90 ttgctatgtttgagatattttatt 67