Jatropha Genome Database
- JcCB0011311.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0011311.10 + phase: 0 /pseudo/partial
(1425 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00851 2759 0.0
KJC_c04838 133 1e-30
>KJC_c00851
Length = 3075
Score = 2759 bits (1392), Expect = 0.0
Identities = 1416/1420 (99%), Gaps = 3/1420 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6 gtggatttgagtataaaaggcaattgtagattccatagtcattctcatcagtgatatccc 65
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1772 gtggatttgagtataaaaggcaattgtagattccatagtcattctcatcagtgatatccc 1713
Query: 66 tgaagctaaggaaagtgggttgcttcatttgtgtgagttcattgaagattgtgaatttac 125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1712 tgaagctaaggaaagtgggttgcttcatttgtgtgagttcattgaagattgtgaatttac 1653
Query: 126 atatctttcgacacagatactccattttcttgggattgaagggccaaagacctcggatcc 185
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 1652 atatctttcgacacagatactccattt-cttgggattgaagggccaa-gacctcg-atcc 1596
Query: 186 cagcaaatacatacgctacatctacaatcgcgtacatcttgagaatgcaaccgttcgggc 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1595 cagcaaatacatacgctacatctacaatcgcgtacatcttgagaatgcaaccgttcgggc 1536
Query: 246 tgctgccgtgagcacgttagcccagtttggtgctttggttgacacattgaagcctcgcat 305
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1535 tgctgccgtgagcacgttagccaagtttggtgctttggttgacacattgaagcctcgcat 1476
Query: 306 ttttgttctgctgagacgttgtctttttgacagtgatgatgaggttcgcgatagggcaac 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1475 ttttgttctgctgagacgttgtctttttgacagtgatgatgaggttcgcgatagggcaac 1416
Query: 366 actttatcttaatactcttggtggcgacggtgaagtagttgaaactgataaagatgtaca 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 actttatcttaatactcttggtggcgacggtgaagtagttgaaactgataaagatgtaca 1356
Query: 426 agcttttctttttggtccactagatatcccactatttaacttggagacaagtttgaaaaa 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 agcttttctttttggtccactagatatcccactatttaacttggagacaagtttgaaaaa 1296
Query: 486 ttatgagccatcagaagagccttttgatattcattctgtgccaaaggaagttaagtctca 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1295 ttatgagccatcagaagagccttttgatattcattctgtgccaaaggaagttaagtctca 1236
Query: 546 gccacttgcagagaagaaagccccaggcaagaagccaactggtctcggttctcctccagc 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 gccacttgcagagaagaaagccccaggcaagaagccaactggtctcggttctcctccagc 1176
Query: 606 tggtcccccatctactgttgatgcctatgaaaagcttatttcctccatcccagagttctc 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 tggtcccccatctactgttgatgcctatgaaaagcttatttcctccatcccagagttctc 1116
Query: 666 gaactttgggaagctcttcaagtcatcggcacctgtggaacttacagaagcagagacaga 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 gaactttgggaagctcttcaagtcatcggcacctgtggaacttacagaagcagagacaga 1056
Query: 726 atatgctgttaatgctgttaagcatatttttgatgggcatgttgtcttccagtacaattg 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 atatgctgttaatgctgttaagcatatttttgatgggcatgttgtcttccagtacaattg 996
Query: 786 caccaatacaataccagagcaattactggaaaatgttatggttattgtagatgcttcaga 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 caccaatacaataccagagcaattactggaaaatgttatggttattgtagatgcttcaga 936
Query: 846 agcagaggaattttcagaggtagcatccaagcctttaagatctctcccttacgattcacc 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 935 agcagaggaattttcagaggtagcatccaagcctttaagatctctcccttacgattcacc 876
Query: 906 tggacaaacttttgtggcttttgagaagccagagggagtccctgcagtcgggaagttttc 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 875 tggacaaacttttgtggcttttgagaagccagagggagtccctgcagtcgggaagttttc 816
Query: 966 aaatatgttgagattcattgttaaagaggttgatccaactactggtgaagcagatgaaga 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 815 aaatatgttgagattcattgttaaagaggttgatccaactactggtgaagcagatgaaga 756
Query: 1026 tggtgtggaggatgaataccaacttgaggaactggaggtcgttgcagcagattacatgat 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 tggtgtggaggatgaataccaacttgaggaactggaggtcgttgcagcagattacatgat 696
Query: 1086 gaaagttggggtatccaatttcaggaatgcatgggaaagcatgggccctgattgtgaacg 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 gaaagttggggtatccaatttcaggaatgcatgggaaagcatgggccctgattgtgaacg 636
Query: 1146 agtggatgaatatggccttggccctagagagagcttgtctgaagctgttagtgctgtcat 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 agtggatgaatatggccttggccctagagagagcttgtctgaagctgttagtgctgtcat 576
Query: 1206 caaccttcttggcatgcagccttgtgagggcacagaggttgtcgcaagcaattcacggtc 1265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 caaccttcttggcatgcagccttgtgagggcacagaggttgtcgcaagcaattcacggtc 516
Query: 1266 gcatacctgcctactatctggtgttttcattggcaatgtgagggttctcgtgcgattgca 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 gcatacctgcctactatctggtgttttcattggcaatgtgagggttctcgtgcgattgca 456
Query: 1326 atttggaattgatggtgcaagggatgttgcgatgaaactggctgtcagatctgaagatga 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 atttggaattgatggtgcaagggatgttgcgatgaaactggctgtcagatctgaagatga 396
Query: 1386 atctgtcagtgatgccattcacgagattgtagcaagcggc 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 atctgtcagtgatgccattcacgagattgtagcaagcggc 356
>KJC_c04838
Length = 469
Score = 133 bits (67), Expect = 1e-30
Identities = 67/67 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1359 gaaactggctgtcagatctgaagatgaatctgtcagtgatgccattcacgagattgtagc 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 105 gaaactggctgtcagatctgaagatgaatctgtcagtgatgccattcacgagattgtagc 46
Query: 1419 aagcggc 1425
|||||||
Sbjct: 45 aagcggc 39