Jatropha Genome Database
- JcCB0008631.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0008631.10 - phase: 0
(1341 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03837 2113 0.0
>KJC_c03837
Length = 1075
Score = 2113 bits (1066), Expect = 0.0
Identities = 1073/1074 (99%), Gaps = 1/1074 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 112 cagacaagcaagacagttacagatctaagacaacccttttcttttggagagagaagttgg 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1073 cagacaagcaagacagttacagatctaagacaacccttttcttttggagagagaagttgg 1014
Query: 172 agggttaaagtgagtgctccatatagagtaggagaggaagagaagggaaatgaagaaata 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1013 agggttaaagtgagtgctccatatagagtaggagaggaagagaagggaaatgaagaaata 954
Query: 232 aagggtgctattgggattatagaagaaaaagaaggtaaatttgatccaggagcgccgcca 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 953 aagggtgctattgggattatagaagaaaaagaaggtaaatttgatccaggagcgccgcca 894
Query: 292 ccgtttaaattgtccgatattagggcagctataccaaagcattgttgggttaaggaccca 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 893 ccgtttaaattgtccgatattagggcagctataccaaagcattgttgggttaaggaccca 834
Query: 352 tggaagtcaatgagctatgtagttagagatgtcgctgtggtttttggtttagctgcagct 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 833 tggaagtcaatgagctatgtagttagagatgtcgctgtggtttttggtttagctgcagct 774
Query: 412 gcagcttatcttaacaattgggtggtttggcctctgtattgggctgctcagggaacaatg 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 773 gcagcttatcttaacaattgggtggtttggcctctgtattgggctgctcagggaacaatg 714
Query: 472 ttttgggctctgtttgttcttggccatgattgtgggcatggaagcttttcgaacaatccc 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 713 ttttgggctctgtttgttcttggccatgattgtgggcatggaagcttttcgaacaatccc 654
Query: 532 aagctaaatagtgttgttgggcaccttcttcattcttcaattcttgtaccttatcatgga 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 653 aagctaaatagtgttgttgggcaccttcttcattcttcaattcttgtaccttatcatgga 594
Query: 592 tggagaattagccataggactcatcatcaaaaccatggacacgttgagaatgatgaatca 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 593 tggagaattagccataggactcatcatcaaaaccatggacacgttgagaatgatgaatca 534
Query: 652 tggcatccgctgcctgagaaaatatttaggaatttggacaacattacaagaaaattgcgc 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533 tggcatccgctgcctgagaaaatatttaggaatttggacaacattacaagaaaattgcgc 474
Query: 712 ttcactgttccttttccaatgcttgcctatcctttctatctttggaatagaagcccggga 771
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 473 ttcactg-tccttttccaatgcttgcctatcctttctatctttggaatagaagcccggga 415
Query: 772 aaaactggttcgcactttcatccagacagtgacttgttcttgccgaatgaaaggaaggat 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 414 aaaactggttcgcactttcatccagacagtgacttgttcttgccgaatgaaaggaaggat 355
Query: 832 gtgattacttccaccatatgctggactgcgatggctgctttgcttgtgggcttatctttt 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 354 gtgattacttccaccatatgctggactgcgatggctgctttgcttgtgggcttatctttt 295
Query: 892 gtaatgggtcctattcaattgcttaagctgtatggaatcccatattggggttttgttatg 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 294 gtaatgggtcctattcaattgcttaagctgtatggaatcccatattggggttttgttatg 235
Query: 952 tggctggactttgtaacgtacttgcatcaccatggtcatgaagagaaacttccttggtac 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 234 tggctggactttgtaacgtacttgcatcaccatggtcatgaagagaaacttccttggtac 175
Query: 1012 cgcggaaacgaatggagttatttaaggggaggactgacgacacttgatcgtgattatgga 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 174 cgcggaaacgaatggagttatttaaggggaggactgacgacacttgatcgtgattatgga 115
Query: 1072 tggattaataatatccatcatgacattggaacccatgttattcaccacttatttcctcaa 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 114 tggattaataatatccatcatgacattggaacccatgttattcaccacttatttcctcaa 55
Query: 1132 atccctcattatcacttaattgaagcaactgaggcagccaaacctgtgcttggc 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54 atccctcattatcacttaattgaagcaactgaggcagccaaacctgtgcttggc 1