Jatropha Genome Database
- JcCB0005881.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0005881.10 - phase: 0
(1290 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03970 2373 0.0
KJC_s15785 583 e-166
>KJC_c03970
Length = 1540
Score = 2373 bits (1197), Expect = 0.0
Identities = 1231/1237 (99%), Gaps = 4/1237 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ccgctgtcaggactcgccagacttctttaacgaatcagcggctcagaaacagaattgggt 115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccgctgtcaggactcgccagacttctttaacgaatcagcggctcagaaacagaattgggt 60
Query: 116 cgttgcgtgtggtggctgatgctgg-cgctaaa-ggagagcccgatttgagtgtcactgt 173
|||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cgttgcgtgtggtggctgatactggacgctaaaaggagagcccgatttgagtgtcactgt 120
Query: 174 taatgggttgcaaatgcctaacccatttgttatcggctctggtccacctggtaccaacta 233
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 taatgggttgcaaatgcctaacccatttgt-atcggctctggtccacctggtaccaacta 179
Query: 234 tacggtcatgaagcgtgcctttgacgaaggctggggtgctgtgatcgccaaaacagtgtc 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 tacggtcatgaagcgtgcctttgacgaaggctggggtgctgtgatcgccaaaacagtgtc 239
Query: 294 acttgatgcatcaaaagttataaatgtaactcctagatatgccaggctaagagcaggtgc 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 acttgatgcatcaaaagttataaatgtaactcctagatatgccaggctaagagcaggtgc 299
Query: 354 aaatggctcagctaaagggcagataattgggtgggagaatatagaacttataagtgatag 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 aaatggctcagctaaagggcagataattgggtgggagaatatagaacttataagtgatag 359
Query: 414 acctcttgaaactatgctcagtgaattcaagcgattaaaagaagaatacccagaaaggat 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 acctcttgaaactatgctcagtgaattcaagcgattaaaagaagaatacccagaaaggat 419
Query: 474 tcttattgcttctatcatggaggagtatgataaagctgcctgggaagaacttatagatag 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 tcttattgcttctatcatggaggagtatgataaagctgcctgggaagaacttatagatag 479
Query: 534 agttgaacaaactggcatcgatgccattgaagtcaatttctcatgtccccatggtatgcc 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 agttgaacaaactggcatcgatgccattgaagtcaatttctcatgtccccatggtatgcc 539
Query: 594 tgaacggaaaatgggcgcagcagttgggcaagattgtgtccttttggaagaggtttgtgg 653
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 tgaacggaaa-tgggcgcagcagttgggcaagattgtgtccttttggaagaggtttgtgg 598
Query: 654 atgggtaaatgctaaagctacagtaccagtttgggcaaagatgactccaaatatcacaga 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 atgggtaaatgctaaagctacagtaccagtttgggcaaagatgactccaaatatcacaga 658
Query: 714 cataacacagccagctcgggtggcactaagctcagggtgtgagggagtagctgctattaa 773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 cataacacagccagctcgggtggcactaagctcagggtgtgagggagtagctgctattaa 718
Query: 774 caccatcatgagtgtaatgggcatcaatctgaaaaccttacgaccggagccctgtgttga 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 caccatcatgagtgtaatgggcatcaatctgaaaaccttacgaccggagccctgtgttga 778
Query: 834 gggatactcaactcctgggggttattcttccaaagcagtccatcctattgcacttggcaa 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 gggatactcaactcctgggggttattcttccaaagcagtccatcctattgcacttggcaa 838
Query: 894 agtcatgaatattgccaaaatgatgaagtcggagtttaaccttgagcagtactcactttc 953
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 agtcatgaatattgccaaattgatgaagtcggagtttaaccttgagcagtactcactttc 898
Query: 954 tggtattggaggtgtggaaaccggtaatgatgctgctgagtttattcttcttggagcaag 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 tggtattggaggtgtggaaaccggtaatgatgctgctgagtttattcttcttggagcaag 958
Query: 1014 tacagttcaggtatgcactggggttatgatgcatggatatggccttgtgaagaagctttg 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 tacagttcaggtatgcactggggttatgatgcatggatatggccttgtgaagaagctttg 1018
Query: 1074 tgaggaactgaaggattttatgaaaatgcacaacttctcatcaatagaagactttagagg 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 tgaggaactgaaggattttatgaaaatgcacaacttctcatcaatagaagactttagagg 1078
Query: 1134 ggcctctctcgattactttacaactcacacagatttggtacgacgacagaaagaagcaat 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 ggcctctctcgattactttacaactcacacagatttggtacgacgacagaaagaagcaat 1138
Query: 1194 cgaacttaggaaagctgtcaaaaaaggtttgcagtctgataaagattggacaggagatgg 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 cgaacttaggaaagctgtcaaaaaaggtttgcagtctgataaagattggacaggagatgg 1198
Query: 1254 ctttgtgaaggagacagagagcatggtttccaactaa 1290
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 ctttgtgaaggagacagagagcatggtttccaactaa 1235
>KJC_s15785
Length = 347
Score = 583 bits (294), Expect = e-166
Identities = 333/347 (95%), Gaps = 13/347 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 374 agataattgggtgggagaatatagaacttataagtgatagacctcttgaaactatgctca 433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agataattgggtgggagaatatagaacttataagtgatagacctcttgaaactatgctca 60
Query: 434 gtgaattcaagcgattaaaa-gaagaatacccagaaaggattcttattgcttctatcatg 492
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtgaattcaagcgattaaaaagaagaatacccagaaaggattcttattgcttctatcatg 120
Query: 493 gaggagtatgataaagctgcctgggaagaacttata------------gatagagttgaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 121 gaggagtatgataaagctgcctgggaagaacttatcatactcctccatgatagagttgaa 180
Query: 541 caaactggcatcgatgccattgaagtcaatttctcatgtccccatggtatgcctgaacgg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caaactggcatcgatgccattgaagtcaatttctcatgtccccatggtatgcctgaacgg 240
Query: 601 aaaatgggcgcagcagttgggcaagattgtgtccttttggaagaggtttgtggatgggta 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaatgggcgcagcagttgggcaagattgtgtccttttggaagaggtttgtggatgggta 300
Query: 661 aatgctaaagctacagtaccagtttgggcaaagatgactccaaatat 707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aatgctaaagctacagtaccagtttgggcaaagatgactccaaatat 347