Jatropha Genome Database
- JcCB0004411.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0004411.10 + phase: 0
(1254 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03318 1852 0.0
>KJC_c03318
Length = 1019
Score = 1852 bits (934), Expect = 0.0
Identities = 948/950 (99%), Gaps = 2/950 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 305 gtttggtttgtgggtattcttcatttgatgctattatagggagtagtaatttgaatggtt 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 gtttggtttgtgggtattcttcatttgatgctattatagggagtagtaatttgaatggtt 960
Query: 365 ttgttgctgggccatcgttgaagaacttccacaccttgtcttctgctaaattgtctgctg 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 ttgttgctgggccatcgttgaagaacttccacaccttgtcttctgctaaattgtctgctg 900
Query: 425 gagctgctcgtgatgtgtcgtttgacggaaattctcgtgaggaacaactgggaaactcca 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 899 gagctgctcgtgatgtgtcgtttgacggaaattctcgtgaggaacaactgggaaa-tcca 841
Query: 485 ctatggtgtctggccaaaccctgaagctgctctcaggatcatgttacttgccacatcctg 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 ctatggtgtctggccaaaccctgaagctgctctcaggatcatgttacttgccacatcctg 781
Query: 545 ataaggaagaaacaggtggggaagatgctcactttatatgtgctgatgaacaagtcattg 604
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 ataaggaagaaacag-tggggaagatgctcactttatatgtgctgatgaacaagtcattg 722
Query: 605 gtgtagcagatggagtaggaggctgggcggatgtaggaatcaatgcaggattatattctc 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtgtagcagatggagtaggaggctgggcggatgtaggaatcaatgcaggattatattctc 662
Query: 665 gggagctcatgtcaaattctgtaagtgcaataaaggatgagcctgtgggttcaattgatc 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gggagctcatgtcaaattctgtaagtgcaataaaggatgagcctgtgggttcaattgatc 602
Query: 725 ctgctagggtgctagagaaggcacactccaacacaaaagccaagggttcgtcaacagctt 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ctgctagggtgctagagaaggcacactccaacacaaaagccaagggttcgtcaacagctt 542
Query: 785 gcatagttgcccttacaaatgagggtatacgtgctattaatctaggagacagtggattca 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gcatagttgcccttacaaatgagggtatacgtgctattaatctaggagacagtggattca 482
Query: 845 tggtggtcagagatggatccacggtgttccaatccccagtacagcagcatggcttcaatt 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tggtggtcagagatggatccacggtgttccaatccccagtacagcagcatggcttcaatt 422
Query: 905 ttacataccaactagaaagtgggaatcacggtgatcaaccaagctccagccaggtattca 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttacataccaactagaaagtgggaatcacggtgatcaaccaagctccagccaggtattca 362
Query: 965 tatttcctgtttctcctggtgatgtaattgttgctggaacggatggattatttgacaact 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tatttcctgtttctcctggtgatgtaattgttgctggaacggatggattatttgacaact 302
Query: 1025 tatataacaatgaggttactgctgctgttgttcatgcggcaagagctggcttagggcccc 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tatataacaatgaggttactgctgctgttgttcatgcggcaagagctggcttagggcccc 242
Query: 1085 aagcaacagctcagaagattgcagatttggcacgtcaacgggcactggataggaaccgac 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagcaacagctcagaagattgcagatttggcacgtcaacgggcactggataggaaccgac 182
Query: 1145 agacacccttttctgctgctgctcaagatgctgggttccgctactatggtggtaaacttg 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 agacacccttttctgctgctgctcaagatgctgggttccgctactatggtggtaaacttg 122
Query: 1205 atgacataactgttgtagtgtcatacgtaatgagctccaacaatttgtga 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atgacataactgttgtagtgtcatacgtaatgagctccaacaatttgtga 72