Jatropha Genome Database
- JcCA0316451.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0316451.10 - phase: 0
(1386 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00759 2458 0.0
KJC_s13189 297 4e-80
>KJC_c00759
Length = 1544
Score = 2458 bits (1240), Expect = 0.0
Identities = 1247/1248 (99%), Gaps = 1/1248 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 140 ctatggagtctgaatttgatactaaggcttttaggcataatttgactcgaagcaagaatt 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1542 ctatggagtctgaatttgatactaaggcttttaggcataatttgactcgaagcaagaatt 1483
Query: 200 ataatcgg-agagggtttggatacaaggaggagactcttgaactcatgagccaagaatat 258
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1482 ataatcgggagagggtttggatacaaggaggagactcttgaactcatgagccaagaatat 1423
Query: 259 actagtgatattattaagactttgaaggaaaatggaaatcagtatacgtggggaaatatt 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1422 actagtgatattattaagactttgaaggaaaatggaaatcagtatacgtggggaaatatt 1363
Query: 319 accgttaaattggctgaagcttatggattttgctggggggttgagcgggctgtccagatt 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1362 accgttaaattggctgaagcttatggattttgctggggggttgagcgggctgtccagatt 1303
Query: 379 gcttatgaagctagaaaacagttcccagatgaaaatatttggcttaccaatgaggttatt 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1302 gcttatgaagctagaaaacagttcccagatgaaaatatttggcttaccaatgaggttatt 1243
Query: 439 cacaatccaactgtcaatcagcgtctagaagagatgaatgttcaaattattcctgttgag 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1242 cacaatccaactgtcaatcagcgtctagaagagatgaatgttcaaattattcctgttgag 1183
Query: 499 gaagggaggaaacagtttgaagttgtggacagtggtgatgtggtgattttgcctgctttt 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1182 gaagggaggaaacagtttgaagttgtggacagtggtgatgtggtgattttgcctgctttt 1123
Query: 559 ggagctgctgtggaagagatgttgactttgagcgacaaaaaagtgcaaattgttgataca 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1122 ggagctgctgtggaagagatgttgactttgagcgacaaaaaagtgcaaattgttgataca 1063
Query: 619 acttgcccttgggtgtccaaggtttggaataccgttgagaagcacaagaaaggagactac 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1062 acttgcccttgggtgtccaaggtttggaataccgttgagaagcacaagaaaggagactac 1003
Query: 679 acttcaatcattcatggtaaatactctcatgaggaaaccgtagctactgcttcttttgca 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1002 acttcaatcattcatggtaaatactctcatgaggaaaccgtagctactgcttcttttgca 943
Query: 739 ggaaaatacattattgtgaagaatatgaaagaggcacagtatgtgtgtgattacattctt 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 942 ggaaaatacattattgtgaagaatatgaaagaggcacagtatgtgtgtgattacattctt 883
Query: 799 ggtggtcaacttgatggatctagctcaacgagagaggcgtttctggagaaatttaaaaat 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 882 ggtggtcaacttgatggatctagctcaacgagagaggcgtttctggagaaatttaaaaat 823
Query: 859 gcagtttccgagggatttgatccagatgttgatctggtcaaagttggtattgcaaatcaa 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 822 gcagtttccgagggatttgatccagatgttgatctggtcaaagttggtattgcaaatcaa 763
Query: 919 actacaatgcttaagggagaaacagaagagattgggaaactagttgagaaaaccatgatg 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 762 actacaatgcttaagggagaaacagaagagattgggaaactagttgagaaaaccatgatg 703
Query: 979 cgtaaatttggagtggaaaatgttaatgatcacttcattagcttcaataccatttgtgat 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 702 cgtaaatttggagtggaaaatgttaatgatcacttcattagcttcaataccatttgtgat 643
Query: 1039 gctactcaagagaggcaagatgctatgtttaagttggtggaggagaagttggatcttatt 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 642 gctactcaagagaggcaagatgctatgtttaagttggtggaggagaagttggatcttatt 583
Query: 1099 ttagtcgttggtgggtggaactcgagtaatacctcacacctccaagaaattgcagagctc 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 ttagtcgttggtgggtggaactcgagtaatacctcacacctccaagaaattgcagagctc 523
Query: 1159 cgtggaattccttcatattggattgatagtgaacagaggataggcccaggaaacagaata 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 cgtggaattccttcatattggattgatagtgaacagaggataggcccaggaaacagaata 463
Query: 1219 gcttataagttgaatcatggggagttggttgtgaaagagaacttcctacctgaaggtccc 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 gcttataagttgaatcatggggagttggttgtgaaagagaacttcctacctgaaggtccc 403
Query: 1279 attacaattggtgtaacatctggtgcctctactccggacaaggttgttgaagatgccctt 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 attacaattggtgtaacatctggtgcctctactccggacaaggttgttgaagatgccctt 343
Query: 1339 gtcaaggtattcaacatcaaacgcgaagaatcattgcaagtagcataa 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 gtcaaggtattcaacatcaaacgcgaagaatcattgcaagtagcataa 295
>KJC_s13189
Length = 178
Score = 297 bits (150), Expect = 4e-80
Identities = 150/150 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 703 tctcatgaggaaaccgtagctactgcttcttttgcaggaaaatacattattgtgaagaat 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 tctcatgaggaaaccgtagctactgcttcttttgcaggaaaatacattattgtgaagaat 88
Query: 763 atgaaagaggcacagtatgtgtgtgattacattcttggtggtcaacttgatggatctagc 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 89 atgaaagaggcacagtatgtgtgtgattacattcttggtggtcaacttgatggatctagc 148
Query: 823 tcaacgagagaggcgtttctggagaaattt 852
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 149 tcaacgagagaggcgtttctggagaaattt 178
Score = 63.9 bits (32), Expect = 1e-09
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 671 gagactacacttcaatcattcatggtaaatac 702
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32 gagactacacttcaatcattcatggtaaatac 1