Jatropha Genome Database
- JcCA0316111.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0316111.10 - phase: 0 /pseudo/partial
(3087 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04187 1586 0.0
KJC_c05274 1239 0.0
>KJC_c04187
Length = 825
Score = 1586 bits (800), Expect = 0.0
Identities = 824/828 (99%), Gaps = 3/828 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1474 gagcagatgcataacatagaaactgcaagtgtgttataccgtctcatagtgtttaagtat 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gagcagatgcataacatagaaactgcaagtgtgttataccgtctcatagtgtttaagtat 60
Query: 1534 ccagactatgtggatgcttatctaaggctggctgccattgcaaaagctcgaaataatctc 1593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ccagactatgtggatgcttatctaaggctggctgccattgcaaaagctcgaaataatctc 120
Query: 1594 caactgagcattgaactggttaatgaggctcttaaggtgaatgataagtgcccaaatgca 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caactgagcattgaactggttaatgaggctcttaaggtgaatgataagtgcccaaatgca 180
Query: 1654 ttatctatgcttggtgatctggagctgaaaaatgatgactgggttaaggcaaaagaaacc 1713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttatctatgcttggtgatctggagctgaaaaatgatgactgggttaaggcaaaagaaacc 240
Query: 1714 ttacgtgctgctagtgaagcaactgacgggaaggattcttatgcgaccctctctctgggg 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttacgtgctgctagtgaagcaactgacgggaaggattcttatgcgaccctctctctgggg 300
Query: 1774 aactggaactactttgctgcaatacgcaatgagaaaaggaatcccaagttggaggctacc 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aactggaactactttgctgcaatacgcaatgagaaaaggaatcccaagttggaggctacc 360
Query: 1834 cacttggagaaggccaaggaactgtacaccagagttctggttcagcatacagctaattta 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cacttggagaaggccaaggaactgtacaccagagttctggttcagcatacagctaattta 420
Query: 1894 tatgctgccaatggtgctggagtagtgttagcagaaaaagggcattttgatgtatctaaa 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tatgctgccaatggtgctggagtagtgttagcagaaaaagggcattttgatgtatctaaa 480
Query: 1954 gatctttttacgcaggtccaagaggctgcaagcggaaacatttttgtccagatgccagat 2013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatctttttacgcaggtccaagaggctgcaagcggaaacatttttgtccagatgccagat 540
Query: 2014 gtgtggataaacttagcacatgtttattttgctcaaggcaattttgctttggctgttaag 2073
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtgtggataaacttagcacatgttta-tttgctcaaggc-attttgctttggctgttaag 598
Query: 2074 atgtatcaaaattgtttgcggaagttttattataatacagactctcaaattctcctgtat 2133
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 atgtatcaaaattg-ttgcggaagttttattataatacagactctcaaattctcctgtat 657
Query: 2134 ttggcccgtacacattatgaagctgaacagtggcaggactgcaagaaaactttactgaga 2193
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 ttggcccgtacacattatgaagctgaacagtgtcaggactgcaagaaaactttactgaga 717
Query: 2194 gccatccacttggcaccttcaaattacatattaagatttgatgcaggtgtggcgatgcaa 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 gccatccacttggcaccttcaaattacatattaagatttgatgcaggtgtggcgatgcaa 777
Query: 2254 aagttttcagcatcaacgctacaaaagacaaagagaactgtagatgag 2301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 aagttttcagcatcaacgctacaaaagacaaagagaactgtagatgag 825
>KJC_c05274
Length = 667
Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0
Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 328 gtactggagggagatcgtgataatgttgctgctcttttgggtcaggcttgtgttgagtac 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtactggagggagatcgtgataatgttgctgctcttttgggtcaggcttgtgttgagtac 60
Query: 388 aatcgtggtcattacattgagtctttggcaagatacaagagggcattgcaagtttatcct 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aatcgtggtcattacattgagtctttggcaagatacaagagggcattgcaagtttatcct 120
Query: 448 aattgtcctggggctgtgaggcttggaataggtcactgccactataaattgggccatttt 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aattgtcctggggctgtgaggcttggaataggtcactgccactataaattgggccatttt 180
Query: 508 aaaaaagcttggcaggcatttgaacgggttttgcagttggatccagaaaatgttgaagct 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aaaaaagcttggcaggcatttgaacgggttttgcagttggatccagaaaatgttgaagct 240
Query: 568 cttgtagcccttgcaattttggatttgcaaacaaatgaagctgctggaataaggagagga 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cttgtagcccttgcaattttggatttgcaaacaaatgaagctgctggaataaggagagga 300
Query: 628 atggaaaaaatgcagaaagcttttgagatatacccctattgcgcaatggcattgaattat 687
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atgg-aaaaatgcagaaagcttttgagatatacccctattgcgcaatggcattgaattat 359
Query: 688 ctagcgaatcacnnnnnnnncactggtcaacattttttagtagagcaacttactgagact 747
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 ctagcgaatcacttttttttcactggtcaacattttttagtagagcaacttactgagact 419
Query: 748 gcacttgctgtgaccaatcatggaccaacaaagtcacactcttactacaacttggcacgt 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 gcacttgctgtgaccaatcatggaccaacaaagtcacactcttactacaacttggcacgt 479
Query: 808 tcctatcacagcaagggggactatgaaacagcttcaagatactactgggcatctgtcaaa 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 tcctatcacagcaagggggactatgaaacagcttcaagatactactgggcatctgtcaaa 539
Query: 868 gaaattaataagcccagtgaatttgtgtttccatattatggattgggacaagtacaactg 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 gaaattaataagcccagtgaatttgtgtttccatattatggattgggacaagtacaactg 599
Query: 928 aaattaggagatattaaaaatgcactgtcaaattttgaaaaggttttggaggtctatcca 987
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 600 aaattaggagatattaaaaatgcactgtcaaa-tttgaaaaggtttaggaggtctatcca 658
Query: 988 gataattgt 996
|||||||||
Sbjct: 659 gataattgt 667