Jatropha Genome Database
- JcCA0315891.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0315891.20 + phase: 0
(2100 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00960 2601 0.0
KJC_c00657 1205 0.0
KJC_s20303 442 e-123
KJC_s17281 115 4e-25
KJC_c10766 52 6e-06
>KJC_c00960
Length = 1365
Score = 2601 bits (1312), Expect = 0.0
Identities = 1312/1312 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 789 agaatgtgctgtgttgaacaaagggccagttatccctgaaaataaaactgaagctacaga 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1365 agaatgtgctgtgttgaacaaagggccagttatccctgaaaataaaactgaagctacaga 1306
Query: 849 ctggtcaaccagattgggaccaatgagtgcatcgtgcaatggagcttataatcaaactac 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1305 ctggtcaaccagattgggaccaatgagtgcatcgtgcaatggagcttataatcaaactac 1246
Query: 909 tctgaaactgggagaacatgcatcttctgccatggaagtgattcaagctgaaagtttgag 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1245 tctgaaactgggagaacatgcatcttctgccatggaagtgattcaagctgaaagtttgag 1186
Query: 969 accagaaaatgagaggggaaattctaataccactcagggccacaatgatgatctagttga 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1185 accagaaaatgagaggggaaattctaataccactcagggccacaatgatgatctagttga 1126
Query: 1029 atcttccagtggagctattgatttgattggtacatttgataatggcccaaagcacacata 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1125 atcttccagtggagctattgatttgattggtacatttgataatggcccaaagcacacata 1066
Query: 1089 tgtagacacaaatataaaggatggtaccaacaagtttgaattcactccactggaactttc 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1065 tgtagacacaaatataaaggatggtaccaacaagtttgaattcactccactggaactttc 1006
Query: 1149 tctaagaagattttttcccaatagctcaaagaatcaaggcattgaggataggcatgcact 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1005 tctaagaagattttttcccaatagctcaaagaatcaaggcattgaggataggcatgcact 946
Query: 1209 aaaccattctaatgcctctgctttttcatggtataacaataagatattgcaacctctttt 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 945 aaaccattctaatgcctctgctttttcatggtataacaataagatattgcaacctctttt 886
Query: 1269 tccaacatcaaccagtaattgtattgagttcagggaagatactagtaagtctccagagat 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 885 tccaacatcaaccagtaattgtattgagttcagggaagatactagtaagtctccagagat 826
Query: 1329 gtcatccaatgaacgttctcaaaagatcaatggtttttctcaacaacatggtcccaattt 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 825 gtcatccaatgaacgttctcaaaagatcaatggtttttctcaacaacatggtcccaattt 766
Query: 1389 gaatggtggtcaagaaattatgaccacactagttattggtcaatctaggcaagctgaact 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 765 gaatggtggtcaagaaattatgaccacactagttattggtcaatctaggcaagctgaact 706
Query: 1449 agcatatccaaatcccattcctatcccaggggtcagagttgacaacatcagcacaggata 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705 agcatatccaaatcccattcctatcccaggggtcagagttgacaacatcagcacaggata 646
Query: 1509 tggccatgtttttccttctctatatggacaaaaaggtgtatcacctgcatggaatcctaa 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645 tggccatgtttttccttctctatatggacaaaaaggtgtatcacctgcatggaatcctaa 586
Query: 1569 actgtccagccagcgagaccagtctccatttgcaactagcacctctattcattcaaatcc 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 585 actgtccagccagcgagaccagtctccatttgcaactagcacctctattcattcaaatcc 526
Query: 1629 tgaaattcatgactctgagcagaataatagacaatccgatgacattaccatcaattctgt 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 525 tgaaattcatgactctgagcagaataatagacaatccgatgacattaccatcaattctgt 466
Query: 1689 ggaccaaaatttgtataagcacgataatatggagcaggtggaggaactgagacatagttc 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 465 ggaccaaaatttgtataagcacgataatatggagcaggtggaggaactgagacatagttc 406
Query: 1749 acctgctgccggtcaaagtactagcagtagcatgtgtaatggcattgcagatcacaataa 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 405 acctgctgccggtcaaagtactagcagtagcatgtgtaatggcattgcagatcacaataa 346
Query: 1809 aagcagtgcatatggaagctcttgcagtagaagtgatggaaatactactttggctgcagc 1868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345 aagcagtgcatatggaagctcttgcagtagaagtgatggaaatactactttggctgcagc 286
Query: 1869 acctgaggaggtcgtgaaaccagagagcttgaaagatggggggatcccctttcgctccag 1928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285 acctgaggaggtcgtgaaaccagagagcttgaaagatggggggatcccctttcgctccag 226
Query: 1929 ccaaagagaagctgctctgacaaagttcaggctgaagcgaaaagatcgatgctatgagca 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 225 ccaaagagaagctgctctgacaaagttcaggctgaagcgaaaagatcgatgctatgagca 166
Query: 1989 aaaggttcggtaccaaagccgaaaaagactagcggagcagcgtcctagagtgaaagggca 2048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 165 aaaggttcggtaccaaagccgaaaaagactagcggagcagcgtcctagagtgaaagggca 106
Query: 2049 gtttgttcgtcaagtacaaaacaacgctccagcggctggtgataataattga 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 105 gtttgttcgtcaagtacaaaacaacgctccagcggctggtgataataattga 54
>KJC_c00657
Length = 940
Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0
Identities = 608/608 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 71 agaaaaagacgcaaaatgagacagttaatgaggatgcctcatcggaggtggttcgatggg 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 213 agaaaaagacgcaaaatgagacagttaatgaggatgcctcatcggaggtggttcgatggg 272
Query: 131 aaaagtttcttccaaggatggtacttagagttctgttagttgaggccgatgactctacgc 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 273 aaaagtttcttccaaggatggtacttagagttctgttagttgaggccgatgactctacgc 332
Query: 191 gccagattatcgctgctcttcttcgaaaatgcagttacagagttgctgctgttcctgatg 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 333 gccagattatcgctgctcttcttcgaaaatgcagttacagagttgctgctgttcctgatg 392
Query: 251 gattaatggcatgggagaccttaaagggtaggccccatagcatagatctcattttaacag 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 393 gattaatggcatgggagaccttaaagggtaggccccatagcatagatctcattttaacag 452
Query: 311 aagtagagttgccatcaatatcgggatacgcactgcttactttggtcatggagcatgaca 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 aagtagagttgccatcaatatcgggatacgcactgcttactttggtcatggagcatgaca 512
Query: 371 tttgcaaaaatattcctgtcataatgatgtcgtcgcatgattcaattagcatggttttga 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 513 tttgcaaaaatattcctgtcataatgatgtcgtcgcatgattcaattagcatggttttga 572
Query: 431 agtgcatgttgaagggtgcagctgactttctcattaagcctgttaggagaaatgagctga 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 573 agtgcatgttgaagggtgcagctgactttctcattaagcctgttaggagaaatgagctga 632
Query: 491 ggaacctctggcggcatgtttggaggaggcaaaatctaactgctggacatattcctcaaa 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 633 ggaacctctggcggcatgtttggaggaggcaaaatctaactgctggacatattcctcaaa 692
Query: 551 gttcacctgatgcacagcataaagttgaagctgcctctgaaaacaattcagctagtgatc 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 693 gttcacctgatgcacagcataaagttgaagctgcctctgaaaacaattcagctagtgatc 752
Query: 611 actcaagtgattgtgcaacttcatcacataaaagaaaggaatgcagtgagaaagggaatg 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 753 actcaagtgattgtgcaacttcatcacataaaagaaaggaatgcagtgagaaagggaatg 812
Query: 671 ataaccaa 678
||||||||
Sbjct: 813 ataaccaa 820
Score = 210 bits (106), Expect = 1e-53
Identities = 106/106 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 736 ggtatttcacagccaaagcttaggagtgcttcaaatctgagcaatatggaggaagaatgt 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 821 ggtatttcacagccaaagcttaggagtgcttcaaatctgagcaatatggaggaagaatgt 880
Query: 796 gctgtgttgaacaaagggccagttatccctgaaaataaaactgaag 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 881 gctgtgttgaacaaagggccagttatccctgaaaataaaactgaag 926
>KJC_s20303
Length = 245
Score = 442 bits (223), Expect = e-123
Identities = 241/245 (98%), Gaps = 4/245 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ggaaaagtttcttccaaggatggtacttagagttctgttagttgaggccgatgactctac 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggaaaagtttcttccaaggatggtacttagagttctgttagttgaggccgatgactctac 60
Query: 189 gcgccagattatcgctgctcttcttcgaaaatgcagttacag---agttgctgctgttcc 245
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 gcgccagattatcgctgctcttcttcgaaaatgcagttacagagcagttgctgctgttcc 120
Query: 246 tgatggattaatggcatgggagacctt-aaagggtaggccccatagcatagatctcattt 304
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgatggattaatggcatgggagaccttaaaagggtaggccccatagcatagatctcattt 180
Query: 305 taacagaagtagagttgccatcaatatcgggatacgcactgcttactttggtcatggagc 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taacagaagtagagttgccatcaatatcgggatacgcactgcttactttggtcatggagc 240
Query: 365 atgac 369
|||||
Sbjct: 241 atgac 245
>KJC_s17281
Length = 82
Score = 115 bits (58), Expect = 4e-25
Identities = 72/74 (97%), Gaps = 2/74 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 434 gcatgttgaagggtgcagctgacttt-ctcattaagcctgttaggagaaa-tgagctgag 491
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 82 gcatgttgaagggtgcagctgacttttctcattaagcctgttaggagaaaatgagctgag 23
Query: 492 gaacctctggcggc 505
||||||||||||||
Sbjct: 22 gaacctctggcggc 9
>KJC_c10766
Length = 323
Score = 52.0 bits (26), Expect = 6e-06
Identities = 32/34 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 383 ttcctgtcataatgatgtcgtcgcatgattcaat 416
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 250 ttcctgtcatcatgatgtcgtctcatgattcaat 283