Jatropha Genome Database
- JcCA0315371.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0315371.10 - phase: 0
(891 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03775 1513 0.0
>KJC_c03775
Length = 978
Score = 1513 bits (763), Expect = 0.0
Identities = 789/794 (99%), Gaps = 4/794 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggctacctcaattcagtcctgtcatcttcaaaccaggtttatgctgatgatgcacct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 atgggctacctcaattcagtcctgtcatcttcaaaccaggtttatgctgatgatgcacct 248
Query: 61 gtgagtggtggtggtctgagtcagaatggaaaattcagctatggatatgcaagctctccc 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 gtgagtggtggtggtctgagtcagaatggaaaattcagctatggatatgcaagctctccg 308
Query: 121 gggaaaagatcttccatggaagatttttatgagacaaggattgatggtgttgatggagag 180
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 gg--aaagatcttccatgga-gatttttatgagacaaggattgatggtgttgatggagag 365
Query: 181 atagttggcctgtttggagtatttgatggccacggaggtgcacgtgctgctgaatatgtg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 atagttggcctgtttggagtatttgatggccacggaggtgcacgtgctgctgaatatgtg 425
Query: 241 aaacaaaaccttttcagcaatctgatcaggcatccaaagttcatttctgataccaaatca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426 aaacaaaaccttttcagcaatctgatcaggcatccaaagttcatttctgataccaaatca 485
Query: 301 gctatagccgatgcatacaatcacacagactctgaatttctgaaatcagaaaataatcag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 486 gctatagccgatgcatacaatcacacagactctgaatttctgaaatcagaaaataatcag 545
Query: 361 aaccgagatgctgggtcaactgcttccacagcaattcttgttggtgaccgtttacttgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 546 aaccgagatgctgggtcaactgcttccacagcaattcttgttggtgaccgtttacttgtt 605
Query: 421 gcaaatgttggagactctagagctgtcatatgtcgaggtggcaatgctattgctgtttct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 606 gcaaatgttggagactctagagctgtcatatgtcgaggtggcaatgctattgctgtttct 665
Query: 481 cgagatcataagccagaccaaactgatgagcgccaacggattgaggatgctggagggttt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 666 cgagatcataagccagaccaaactgatgagcgccaacggattgaggatgctggagggttt 725
Query: 541 gtgatgtgggcagggacgtggagagtcggtggggttcttgctgtctctcgtgcatttggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 726 gtgatgtgggcagggacgtggagagtcggtggggttcttgctgtctctcgtgcatttggt 785
Query: 601 gataggctcttgaagcagtatgttgttgctgatccagaaattcaggaggagaaagttgac 660
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 786 gataggctcttgaagcagtatgttgttgctg-tccagaaattcaggaggagaaagttgac 844
Query: 661 agttcacttgagtttcttatcctagcaagtgatggactgtgggatgttgtcacaaatgag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 845 agttcacttgagtttcttatcctagcaagtgatggactgtgggatgttgtcacaaatgag 904
Query: 721 gaagctgttgaaatgactaaaccaattgcagacccagaggaggcagcaaggaggttgttg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 905 gaagctgttgaaatgactaaaccaattgcagacccagaggaggcagcaaggaggttgttg 964
Query: 781 caagaggcatacca 794
||||||||||||||
Sbjct: 965 caagaggcatacca 978