Jatropha Genome Database
- JcCA0314481.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0314481.20 - phase: 1 /partial
(1517 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01685 1976 0.0
KJC_c01333 404 e-112
>KJC_c01685
Length = 1331
Score = 1976 bits (997), Expect = 0.0
Identities = 1018/1026 (99%), Gaps = 1/1026 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 493 atattacaattctcggtgagatgggcatggaccctggcatagatcatatgatggcaatga 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1331 atattacaattctcggtgagatgggcatggaccctggcatagatcatatgatggcaatga 1272
Query: 553 agatgattaatcaagctcatgttcggaagggcagattaaagtcttttacatcttattgtg 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1271 agatgattaatcaagctcatgttcggaagggcagattaaagtcttttacatcttattgtg 1212
Query: 613 gggcacttccatctcctgcagctgcaaataacccactagcatataagttcagttggagtc 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1211 gggcacttccatctcctgcagctgcaaataacccactagcatataagttcagttggagtc 1152
Query: 673 ctgctggagtcataagagctgggcgcaatcctgccacatacagacttaatggtgaaattg 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1151 ctgctggagtcataagagctgggcgcaatcctgccacatacagacttaatggtgaaattg 1092
Query: 733 tacacattgatggtgatagcctttatgattcagctttcaaacttcggattccacatcttc 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1091 tacacattgatggtgatagcctttatgattcagctttcaaacttcggattccacatcttc 1032
Query: 793 ctgcttttgcattggaatgccttccaaatcgtgattctttagtttacgaaaaagtctatg 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1031 ctgcttttgcattggaatgccttccaaatcgtgattctttagtttacgaaaaagtctatg 972
Query: 853 gaatagaagaagcatcaacgatctttcgtggaaccctccgctatgaagggtttggcgaaa 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 971 gaatagaagaagcatcaacgatctttcgtggaaccctccgctatgaagggtttggcgaaa 912
Query: 913 tcatggggatacttgcaagaattggnnnnnnncgtaccgaacctcatccagttcttagat 972
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 911 tcatggggatacttgcaagaattggtttttttcgtaccgaacctcatccagttcttagat 852
Query: 973 gtgaacggagacccacattcaaaacattcctttgtgaactactaaagattcctggtgaaa 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 851 gtgaacggagacccacattcaaaacattcctttgtgaactactaaagattcctggtgaaa 792
Query: 1033 atctatcaggggagaaagacatcactgaaaatatagttacacttggtcattgcaaggaaa 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 atctatcaggggagaaagacatcactgaaaatatagttacacttggtcattgcaaggaaa 732
Query: 1093 aaggaaccgctgaaaaggcagccaaaactatcatatttctgggatttgatgagcaaacgg 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 aaggaaccgctgaaaaggcagccaaaactatcatatttctgggatttgatgagcaaacgg 672
Query: 1153 aaattcctgcctcctgccgaagtgcatttgatgtcacctgttaccggatggaagaaaggt 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 aaattcctgcctcctgccgaagtgcatttgatgtcacctgttaccggatggaagaaaggt 612
Query: 1213 tggtgtattccagtacggaacaggatatggttcttttgcatcacgaaattgtggttgaat 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 tggtgtattccagtacggaacaggatatggttcttttgcatcacgaaattgtggttgaat 552
Query: 1273 tccctgatggccaacggccagagcgtcattcggccactttattggaatttgggacgtc-a 1331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 551 tccctgatggccaacggccagagcgtcattcggccactttattggaatttgggacgtcaa 492
Query: 1332 aaaaatggaaaaacagttaccgcaatggctctgaccgttggtattccagcagccatcggt 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 aaaaatggaaaaacagttaccgcaatggctctgaccgttggtattccagcagccatcggt 432
Query: 1392 gcactgctcttactagagaacaagatcaagtcaagaggtgttctgagacctactgaacca 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 gcactgctcttactagagaacaagatcaagtcaagaggtgttctgagacctactgaacca 372
Query: 1452 gaagtatacatgccagcactggaaattttacaagcccatggtataaagttgattgagaag 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 gaagtatacatgccagcactggaaattttacaagcccatggtataaagttgattgagaag 312
Query: 1512 gtcgag 1517
||||||
Sbjct: 311 gtcgag 306
>KJC_c01333
Length = 2002
Score = 404 bits (204), Expect = e-112
Identities = 224/228 (98%), Gaps = 2/228 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ggattgtaaataaagaagcaaataaaatttccttgaaagtgggtaaaatccaagagaatg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1777 ggattgtaaataaagaagcaaataaaatttccttgaaagttggtaaaatccaagagaatg 1836
Query: 61 acgtcaagaaggactgtgatacaaaaaggaagactggagttctaattattggtgcaggcc 120
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1837 acgtcaagaaggactgtgatacaaaaagga-gactggagttctaattattggtgcaggcc 1895
Query: 121 gtgtctgtcgacctgctgttgagttcctagcatcaatcggaagcatttcatctcatgaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1896 gtgtctgtcgacctgctgttgagttcctagcatcaatcggaagcatttcatctcatgaat 1955
Query: 181 gttataaagcttgtcttgatactgatttcgaagagcagaatgatgtcc 228
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1956 gttat-aagcttgtcttgatactgatttcgaagagccgaatgatgtcc 2002