Jatropha Genome Database
- JcCA0313071.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0313071.10 + phase: 0
(1098 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04204 1982 0.0
KJC_c02525 309 8e-84
KJC_s19960 186 8e-47
>KJC_c04204
Length = 1232
Score = 1982 bits (1000), Expect = 0.0
Identities = 1021/1024 (99%), Gaps = 3/1024 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 71 gaaatcttgatttcttggagatgtggagggcattttttgagccataccacttgatcatag 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 gaaatcttgatttcttggagatgtggagggcattttttgagccataccacttgatcatag 1173
Query: 131 tccaagatggtgacccatcaaagaccattaaggttcctgatggttttgactatgaacttt 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 tccaagatggtgacccatcaaagaccattaaggttcctgatggttttgactatgaacttt 1113
Query: 191 acaacagaaatgatattaataggattttgggtcctaaggcctcttgcatttccttcaagg 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 acaacagaaatgatattaataggattttgggtcctaaggcctcttgcatttccttcaagg 1053
Query: 251 actctgcttgtcgttgctttggttacatggtctcgaagaagaagtatatcttcactatcg 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 actctgcttgtcgttgctttggttacatggtctcgaagaagaagtatatcttcactatcg 993
Query: 311 atgatgattgctttgttgccaaagacccatcaggcaaagagattaatgcacttgaacagc 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 atgatgattgctttgttgccaaagacccatcaggcaaagagattaatgcacttgaacagc 933
Query: 371 acatcaaaaaccttttaagtccatcgactccgcatttcttcaatactctttatgatccat 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 acatcaaaaaccttttaagtccatcgactccgcatttcttcaatactctttatgatccat 873
Query: 431 acagagacggtgcagactttgtccgtggatatcctttcagtctccgagagggtgttataa 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 acagagacggtgcagactttgtccgtggatatcctttcagtctccgagagggtgttataa 813
Query: 491 ctgctgtttctcatggcctctggcttaacatccctgattatgatgctcccacacagctcg 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 ctgctgtttctcatggcctctggcttaacatccctgattatgatgctcccacacagctcg 753
Query: 551 tgaagcctcttgagagaaatacaaggtatgtcgatgctgttatgacagtacccaaaggaa 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 tgaagcctcttgagagaaatacaaggtatgtcgatgctgttatgacagtacccaaaggaa 693
Query: 611 cccttttcccaatgtgtggcatgaacttggcatttaaccgtgagttgattggaccggcaa 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 cccttttcccaatgtgtggcatgaacttggcatttaaccgtgagttgattggaccggcaa 633
Query: 671 tgtattttgggctcatgggtgatggtcagccagttggacgctatgacgatatgtgggctg 730
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 tgta-tttgggctcatgggtgatggtcagccagttggacgctatgacgatatgtgggctg 574
Query: 731 gctggtgcatgaaggtgatatgcgaccatatgggatggggagttaaaaccggtttgccct 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 573 gctggtgcatgaaggtgatatgcgaccatatgggatggggagttaaaaccggtttgccct 514
Query: 791 atatatggcacagcaaagctagcaacccatttgttaacctgaaaaaagagtacaagggca 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 513 atatatggcacagcaaagctagcaacccatttgttaacctgaaaaaagagtacaagggca 454
Query: 851 tattttggcaggaacaactgatcccattcttccaatctgttgtgcttccaaaggaatgca 910
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 453 tattttggcaggaacaactgatcccattcttccaatctgttgtgcttccaaagg-atgca 395
Query: 911 ccaccgtccagaaatgctatatcgaacttgccaagcaggttaaggagaagtttgcggatg 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 ccaccgtccagaaatgctatatcgaacttgccaagcaggttaaggagaagtttgcggatg 335
Query: 971 aagatccctactttgttaaactagcagatgccatggttacttggattgaagcttggaatg 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 aagatccctactttgttaaactagcagatgccatggttacttggattgaagcttggaatg 275
Query: 1031 aacttaactctcctgaaggaaaatctgcaactggaagtgcaaagctactcaatggcactg 1090
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 aacttaactctcctgaagg-aaatctgcaactggaagtgcaaagctactcaatggcactg 216
Query: 1091 caaa 1094
||||
Sbjct: 215 caaa 212
>KJC_c02525
Length = 800
Score = 309 bits (156), Expect = 8e-84
Identities = 375/448 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 508 ctctggcttaacatccctgattatgatgctcccacacagctcgtgaagcctcttgagaga 567
|||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||||||
Sbjct: 798 ctctggctcaacatccctgactatgatgccccaacccaacttgtcaagcctcttgagagg 739
Query: 568 aatacaaggtatgtcgatgctgttatgacagtacccaaaggaacccttttcccaatgtgt 627
|| || |||||||| |||||||| |||||| | || || ||||| | ||||| |||||
Sbjct: 738 aacactaggtatgtggatgctgtaatgacaattccaaagggaactttattccctatgtgc 679
Query: 628 ggcatgaacttggcatttaaccgtgagttgattggaccggcaatgtattttgggctcatg 687
|| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||
Sbjct: 678 ggaatgaatctggcattcaaccgtgaattgattggtcctgcaatgtacttcggtctcatg 619
Query: 688 ggtgatggtcagccagttggacgctatgacgatatgtgggctggctggtgcatgaaggtg 747
|||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 ggtgatggtcagccgattggtcgctatgatgatatgtgggctggctggtgcatgaaggtt 559
Query: 748 atatgcgaccatatgggatggggagttaaaaccggtttgccctatatatggcacagcaaa 807
|||||||| ||| |||| | ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||
Sbjct: 558 atatgcgatcatttgggtttaggagtcaaaacaggattgccttacatttggcacagcaaa 499
Query: 808 gctagcaacccatttgttaacctgaaaaaagagtacaagggcatattttggcaggaacaa 867
|| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| |
Sbjct: 498 gcaagcaacccatttgtgaaccttaaaaaggaatacaaaggaatctactggcaggaagag 439
Query: 868 ctgatcccattcttccaatctgttgtgcttccaaaggaatgcaccaccgtccagaaatgc 927
||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||
Sbjct: 438 ctgattccatttttccaatctgctgttcttccaaaggactgcaccagtgtccagaagtgc 379
Query: 928 tatatcgaacttgccaagcaggttaagg 955
||| | ||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 378 tatcttgaactgtccaagcaagttaagg 351
>KJC_s19960
Length = 438
Score = 186 bits (94), Expect = 8e-47
Identities = 218/258 (84%), Gaps = 1/258 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 508 ctctggcttaacatccctgattatgatgctcccacacagc-tcgtgaagcctcttgagag 566
|||||||| ||||||||||| |||||||| || || || | | || ||||||||||||||
Sbjct: 434 ctctggctcaacatccctgactatgatgccccaacccaaccttgtcaagcctcttgagag 375
Query: 567 aaatacaaggtatgtcgatgctgttatgacagtacccaaaggaacccttttcccaatgtg 626
|| || |||||||| |||||||| |||||| | || || ||||| | ||||| |||||
Sbjct: 374 gaacactaggtatgtggatgctgtaatgacaattccaaagggaactttattccctatgtg 315
Query: 627 tggcatgaacttggcatttaaccgtgagttgattggaccggcaatgtattttgggctcat 686
|| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||
Sbjct: 314 cggaatgaatctggcattcaaccgtgaattgattggtcctgcaatgtacttcggtctcat 255
Query: 687 gggtgatggtcagccagttggacgctatgacgatatgtgggctggctggtgcatgaaggt 746
||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 254 gggtgatggtcagccgattggtcgctatgatgatatgtgggctggctggtgcatgaaggt 195
Query: 747 gatatgcgaccatatggg 764
|||||||| ||| ||||
Sbjct: 194 tatatgcgatcatttggg 177
Score = 107 bits (54), Expect = 6e-23
Identities = 129/154 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 802 agcaaagctagcaacccatttgttaacctgaaaaaagagtacaagggcatattttggcag 861
|||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||
Sbjct: 1 agcaaagcaagcaacccatttgtgaaccttaaaaaggaatacaaaggaatctactggcag 60
Query: 862 gaacaactgatcccattcttccaatctgttgtgcttccaaaggaatgcaccaccgtccag 921
||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct: 61 gaagagctgattccatttttccaatctgctgttcttccaaaggactgcaccagtgtccag 120
Query: 922 aaatgctatatcgaacttgccaagcaggttaagg 955
|| |||||| | ||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 121 aagtgctatcttgaactgtccaagcaagttaagg 154