Jatropha Genome Database
- JcCA0312961.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0312961.10 - phase: 0 /partial
(1206 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02746 1364 0.0
KJC_c06880 670 0.0
>KJC_c02746
Length = 998
Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0
Identities = 688/688 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcaactaccttgcatttttgtggtggcaaagttgcttattcagttttgctaaagaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 atggcaactaccttgcatttttgtggtggcaaagttgcttattcagttttgctaaagaga 630
Query: 61 ccattgcattgcccagccttgttgtcacagcaacgccttgattttgcggactctgtggct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 629 ccattgcattgcccagccttgttgtcacagcaacgccttgattttgcggactctgtggct 570
Query: 121 aagagttctggattttgtgcgagagtaaaattttcttgtacgagtaatagacttttgaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 569 aagagttctggattttgtgcgagagtaaaattttcttgtacgagtaatagacttttgaaa 510
Query: 181 attagttgtgagagacgaactgttgatgtccttgaaaggaataaaactgagtattttagc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 attagttgtgagagacgaactgttgatgtccttgaaaggaataaaactgagtattttagc 450
Query: 241 gatgttagtaccgaacctgataaacaattaacttgtgtaatgaaatttggtggctcgtcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 gatgttagtaccgaacctgataaacaattaacttgtgtaatgaaatttggtggctcgtcc 390
Query: 301 gttgcatctgctgagaggatgaaagaagttgctgaccttatacttagcttcccaaatgag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 gttgcatctgctgagaggatgaaagaagttgctgaccttatacttagcttcccaaatgag 330
Query: 361 agacctgtcattgttctatcagcaatgggaaagacaactaacaaacttttgctggctgga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 agacctgtcattgttctatcagcaatgggaaagacaactaacaaacttttgctggctgga 270
Query: 421 gaaagggctgtttcctgtggtgtaactaatgtagagactattgatgaactgagcttcatc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 gaaagggctgtttcctgtggtgtaactaatgtagagactattgatgaactgagcttcatc 210
Query: 481 aaggaattgcacctaaggacagtagatgagctggaagtagacaagtcagttatcgaacct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 aaggaattgcacctaaggacagtagatgagctggaagtagacaagtcagttatcgaacct 150
Query: 541 cacctagaagaactggagcaacttttgaagggagttgctatgatgaaagagctgactcct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 149 cacctagaagaactggagcaacttttgaagggagttgctatgatgaaagagctgactcct 90
Query: 601 cgaacaagagactacttggtttcatttggcgaatgcatgtccacaaggatatttgctgcg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 89 cgaacaagagactacttggtttcatttggcgaatgcatgtccacaaggatatttgctgcg 30
Query: 661 tatttgaataaaattggtgcaaaagccc 688
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 tatttgaataaaattggtgcaaaagccc 2
>KJC_c06880
Length = 979
Score = 670 bits (338), Expect = 0.0
Identities = 355/358 (99%), Gaps = 2/358 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 702 cttcgatattggttttatcaccacagatgactt-cacgaatgcagacattcttgaagcaa 760
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cttcgatattggttttatcaccacagatgactttcacgaatgcagacattcttgaagcaa 60
Query: 761 cttatccagcagttgcaaagaggctatatggggattggatcagtgatccagcaattccaa 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61 cttatccagcagttgcaaagaggctatatggggattggatcagtgatccagcaattctaa 120
Query: 821 ttgttactggtttccttgggaagggctggagatcttgtgccattactacattgggcaggg 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttgttactggtttccttgggaagggctggagatcttgtgccattactacattgggcaggg 180
Query: 881 gtggtagtgatttgacagccacaacaattggaaaagcattgagtttgcgagagattcagg 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gtggtagtgatttgacagccacaacaattggaaaagcattgagtttgcgagagattcagg 240
Query: 941 tgtggaaagatgttgacggtgttttaacatgtgatcctaatatatatccagctgcggaac 1000
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgtggaaagatgttgacggtg-tttaacatgtgatcctaatatatatccagctgcggaac 299
Query: 1001 ctgtgccatacttgacatttgatgaggcagctgaacttgcatattttggagcacaggt 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ctgtgccatacttgacatttgatgaggcagctgaacttgcatattttggagcacaggt 357