Jatropha Genome Database
- JcCA0312531.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0312531.10 - phase: 0
(1464 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c05207 1479 0.0
KJC_c06990 1065 0.0
KJC_c09881 74 1e-12
>KJC_c05207
Length = 1309
Score = 1479 bits (746), Expect = 0.0
Identities = 753/754 (99%), Gaps = 1/754 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgaagtttatgaagttgggttcgaagcctgatgcttttcaagctgaaggaaaatccatc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 atgaagtttatgaagttgggttcgaagcctgatgcttttcaagctgaaggaaaatccatc 696
Query: 61 aggtacgtgtcatccgagctggctacagatgtcaccataaatataggtgaagttaagttt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 aggtacgtgtcatccgagctggctacagatgtcaccataaatataggtgaagttaagttt 636
Query: 121 taccttcacaagttccctctcttgtcaaagagtaatcgattgcaaaaactagtattgaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 taccttcacaagttccctctcttgtcaaagagtaatcgattgcaaaaactagtattgaaa 576
Query: 181 gccagtgaggagaattccgatgaaattaatatgcttgattttcctggtgggcataaggcc 240
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 gccagtgaggagaattccgatgaaatta-tatgcttgattttcctggtgggcataaggcc 517
Query: 241 tttgaaatttgtgcaaaattctgctacgggatgattgttactctcaatgcttacaatgta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 tttgaaatttgtgcaaaattctgctacgggatgattgttactctcaatgcttacaatgta 457
Query: 301 gtagctgctcgttgtgcagctgagtaccttgagatgactgaggatgttgatcgaggaaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 gtagctgctcgttgtgcagctgagtaccttgagatgactgaggatgttgatcgaggaaat 397
Query: 361 ctcattttcaaaattgaggtatttctaaactcgagcatcttccgtagctggaaggattcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 ctcattttcaaaattgaggtatttctaaactcgagcatcttccgtagctggaaggattcc 337
Query: 421 atcattgttcttcaaaccaccaaatcccttctgccctggtctgaagatttgaagattgtg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 atcattgttcttcaaaccaccaaatcccttctgccctggtctgaagatttgaagattgtg 277
Query: 481 ggaaggtgtgttgattctattgcatctaaaacctctgtggatcctgcaaacattacttgg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 ggaaggtgtgttgattctattgcatctaaaacctctgtggatcctgcaaacattacttgg 217
Query: 541 tcatacacttacaacagaaaattatcagtgcgtgataaaatagttgaagatggtatgaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 tcatacacttacaacagaaaattatcagtgcgtgataaaatagttgaagatggtatgaag 157
Query: 601 tttcgagagaaagtcgactctgttccaaaggattggtgggttgaagatatatgtgaactg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 tttcgagagaaagtcgactctgttccaaaggattggtgggttgaagatatatgtgaactg 97
Query: 661 gatattgatctctacaagcgagtcatgattgctgttaaatcaaagggaagaatggatggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 gatattgatctctacaagcgagtcatgattgctgttaaatcaaagggaagaatggatggt 37
Query: 721 acagttatcggggaggcacttaaaacttatgcag 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 36 acagttatcggggaggcacttaaaacttatgcag 3
>KJC_c06990
Length = 1095
Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0
Identities = 557/561 (99%), Gaps = 2/561 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 753 agtcagatggcttccggatgcatttgatgatttgacttctgatggtcgttcctggaggta 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1095 agtcagatggcttccggatgcatttgatgatttgacttctgatggtcgttcctggaggta 1036
Query: 813 caaatatctggtagaaacacttgtttgttt-gttgccttcggataagggtttgggttgtt 871
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1035 caaatatctggtagaaacacttgtttgttttgttgccttcggataagggtttgggttgtt 976
Query: 872 catgtggtttcttgctgaaattgttgaaagttgccatttctgttggagtagatgattcac 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 975 catgtggtttcttgctgaaattgttgaaagttgccatttctgttggagtggatgattcac 916
Query: 932 ctagggaagaattggagaaaaggatcagtttaaagttgcatgaggcttctgtgaaggatt 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 915 ctagggaagaattggagaaaaggatcagtttaaagttgcatgaggcttctgtgaaggatt 856
Query: 992 tactgatcccagcaaggtccccgcagaccacattatatgatgtggagttggtacaatctc 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 855 tactgatcccagcaaggtccccgcagaccacattatatgatgtggagttggtacaatctc 796
Query: 1052 ttgtgaattgttatgtgactcatgaaaagtacagtcaggatttgagtgttgagaagaatg 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 795 ttgtgaattgttatgtgactcatgaaaagtacagtcaggatttgagtgttgagaagaatg 736
Query: 1112 atgaaactgatgattttgttttgcggcgcggtcatggatacatgttgaatgttggaaaaa 1171
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 735 atgaaactgatgattttg-tttgcggcgcggtcatggatacatgttgaacgttggaaaaa 677
Query: 1172 tagttgatggatatctctcagaaattgcacgggacccaaatctcaccctcgccagtttca 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 676 tagttgatggatatctctcagaaattgcacgggacccaaatctcaccctcgccagtttca 617
Query: 1232 ttgacttgtcacagtcaattccagagtctgccagaccaaatcatgatggactgtacaaag 1291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 616 ttgacttgtcacagtcaattccagagtctgccagaccaaatcatgatggactgtacaaag 557
Query: 1292 ccattgacacctatctgaagg 1312
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 556 ccattgacacctatctgaagg 536
>KJC_c09881
Length = 561
Score = 73.8 bits (37), Expect = 1e-12
Identities = 52/57 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 280 actctcaatgcttacaatgtagtagctgctcgttgtgcagctgagtaccttgagatg 336
||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 69 actctcaatgcgtacaatgtggttgcagctcgttgtgcagcagagtaccttgagatg 13