Jatropha Genome Database
- JcCA0311291.30
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0311291.30 - phase: 0 /partial
(1341 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00709 2393 0.0
>KJC_c00709
Length = 1639
Score = 2393 bits (1207), Expect = 0.0
Identities = 1214/1215 (99%), Gaps = 1/1215 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 attcctaatctggttgttcttgatgctaatgggaaggtttcttgtgatcgaggtgtcgac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1215 attcctaatctggttgttcttgatgctaatgggaaggtttcttgtgatcgaggtgtcgac 1156
Query: 61 atcattaggaactatggagcagaaggttatccgtttaccccagaaaaacttgactatctt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1155 atcattaggaactatggagcagaaggttatccgtttaccccagaaaaacttgactatctt 1096
Query: 121 agacaggaagaagagaatgctaagaataatcagacgataagctctatcctggtttcaagc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1095 agacaggaagaagagaatgctaagaataatcagacgataagctctatcctggtttcaagc 1036
Query: 181 tctcgcgattatctgatatcaaatgagggaactaagatcccagtgtctgatcttcaaggg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1035 tctcgcgattatctgatatcaaatgagggaactaagatcccagtgtctgatcttcaaggg 976
Query: 241 aaaatggtaggtttgtatttctcggcatatcctcatcggctatgtctagaatttactcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 975 aaaatggtaggtttgtatttctcggcatatcctcatcggctatgtctagaatttactcct 916
Query: 301 aaacttgttgaaatatataaaaagctcaaggaaaaaggagagaactttgagattgtactg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 915 aaacttgttgaaatatataaaaagctcaaggaaaaaggagagaactttgagattgtactg 856
Query: 361 atatcgatagactatgacgagaaggacttcaaacaaagttttgaaaaaatgccttggcta 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 855 atatcgatagactatgacgagaaggacttcaaacaaagttttgaaaaaatgccttggcta 796
Query: 421 gcattgccatttcaggacaaaggccgtgaaaaattagcacgttattttgagcttagtgcc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 795 gcattgccatttcaggacaaaggccgtgaaaaattagcacgttattttgagcttagtgcc 736
Query: 481 cttccttctctggttataatcggagaagatgggaagactttgaaccaaaatgtagctgaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 735 cttccttctctggttataatcggagaagatgggaagactttgaaccaaaatgtagctgaa 676
Query: 541 cttattgaagatcatggtattgaagcctacccatttactccagataagcttgatgagctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 675 cttattgaagatcatggtattgaagcctacccatttactccagataagcttgatgagctt 616
Query: 601 gctgagattgagaaggctagacttgaagcacagacactagagtctgttttggttcatggt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 615 gctgagattgagaaggctagacttgaagcacagacactagagtctgttttggttcatggt 556
Query: 661 gataaagattttgtgatcgaaaaaactggttcgaaggtcccagtgtctgaattagctgga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 555 gataaagattttgtgatcgaaaaaactggttcgaaggtcccagtgtctgaattagctgga 496
Query: 721 aggaacgttcttctctatttctcagctaaatggtgccctccttgccgtgcttttttaccc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 495 aggaacgttcttctctatttctcagctaaatggtgccctccttgccgtgcttttttaccc 436
Query: 781 aagctaattgaagcatacaaagaaattaaagaaaaggacagtagatttgagataattttc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 aagctaattgaagcatacaaagaaattaaagaaaaggacagtagatttgagataattttc 376
Query: 841 gtctcaagtgatcgcgatcaatcctcattcgaagaattcta-ttcgggtatgccttggtt 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 375 gtctcaagtgatcgcgatcaatcctcattcgaagaattctacttcgggtatgccttggtt 316
Query: 900 agcccttccatttggcgatgaaaggaaaacaatcctgcaaaagaaattcaaaatcaaagg 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 agcccttccatttggcgatgaaaggaaaacaatcctgcaaaagaaattcaaaatcaaagg 256
Query: 960 cattcctgcagccatagccattagttcaagcggcaagacagtaactaaagaagctaaaga 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 cattcctgcagccatagccattagttcaagcggcaagacagtaactaaagaagctaaaga 196
Query: 1020 acacttaacagcttatggtgcagacgcatatccattcactgaacaacatttaaagcaatt 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 acacttaacagcttatggtgcagacgcatatccattcactgaacaacatttaaagcaatt 136
Query: 1080 aaaagaaaagcttgaggaaatagcaaaggggtggcctgagaaactgaaacacgaactcca 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 aaaagaaaagcttgaggaaatagcaaaggggtggcctgagaaactgaaacacgaactcca 76
Query: 1140 caaagagcatgagcttgtacgcattaaacgcaagggatttgtctgcaatgggtgtagaga 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 caaagagcatgagcttgtacgcattaaacgcaagggatttgtctgcaatgggtgtagaga 16
Query: 1200 gatgggacatggctg 1214
|||||||||||||||
Sbjct: 15 gatgggacatggctg 1