Jatropha Genome Database
- JcCA0310301.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0310301.10 + phase: 0
(1299 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00897 2359 0.0
KJC_c00527 912 0.0
KJC_c08227 537 e-152
KJC_s18589 131 5e-30
>KJC_c00897
Length = 1428
Score = 2359 bits (1190), Expect = 0.0
Identities = 1190/1190 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 110 agctaaaggaaatggagacctttctattcacctctgagtccgtgaacgagggacaccccg 169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1372 agctaaaggaaatggagacctttctattcacctctgagtccgtgaacgagggacaccccg 1313
Query: 170 acaaactctgtgaccagatctctgatgcggtattagatgcctgccttgagcaagatcctg 229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1312 acaaactctgtgaccagatctctgatgcggtattagatgcctgccttgagcaagatcctg 1253
Query: 230 acagcaaggttgcctgtgaaacatgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggagaga 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1252 acagcaaggttgcctgtgaaacatgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggagaga 1193
Query: 290 ttaccaccaaagccaaggtagactatgagaagatagttcgtcagacatgccgtggaattg 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1192 ttaccaccaaagccaaggtagactatgagaagatagttcgtcagacatgccgtggaattg 1133
Query: 350 gatttatttccgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtccttgttaacattg 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1132 gatttatttccgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtccttgttaacattg 1073
Query: 410 agcaacagagccctgatattgctcagggtgtccatggccacttcaccaagcgcccagaag 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1072 agcaacagagccctgatattgctcagggtgtccatggccacttcaccaagcgcccagaag 1013
Query: 470 agattggtgctggtgatcagggacatatgtttggttatgccactgatgagacccctgagt 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1012 agattggtgctggtgatcagggacatatgtttggttatgccactgatgagacccctgagt 953
Query: 530 atatgcctttgagccatgtccttgcaaccaagctcggggcaaagctaactgaggttagga 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 952 atatgcctttgagccatgtccttgcaaccaagctcggggcaaagctaactgaggttagga 893
Query: 590 agaacggcacctgcccatggctaaggcctgatggcaagactcaggttactgttgagtact 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 892 agaacggcacctgcccatggctaaggcctgatggcaagactcaggttactgttgagtact 833
Query: 650 acaatgacaatggtgccatggtcccagtccgcgtacacactgtcctcatctccacccaac 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 832 acaatgacaatggtgccatggtcccagtccgcgtacacactgtcctcatctccacccaac 773
Query: 710 atgatgagactgtaacaaacgatgaaattgctgctgacctcaaggagcacgtcatcaagc 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 772 atgatgagactgtaacaaacgatgaaattgctgctgacctcaaggagcacgtcatcaagc 713
Query: 770 cggtcatccctgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccacctcaacccatcagggc 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 cggtcatccctgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccacctcaacccatcagggc 653
Query: 830 gttttgtcattggtggtcctcacggtgatgcaggactcactggacgcaagatcattattg 889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 gttttgtcattggtggtcctcacggtgatgcaggactcactggacgcaagatcattattg 593
Query: 890 atacctatggtggatggggagcccatggtggcggtgctttctcaggaaaggacccaacca 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 atacctatggtggatggggagcccatggtggcggtgctttctcaggaaaggacccaacca 533
Query: 950 aggtggacaggagtggtgcttatattgtcaggcaggctgccaagagcattgtagcaaatg 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 aggtggacaggagtggtgcttatattgtcaggcaggctgccaagagcattgtagcaaatg 473
Query: 1010 gtcttgcccgcaggtgcattgtgcaggtctcctacgccattggtgtgcctgagcctttgt 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 gtcttgcccgcaggtgcattgtgcaggtctcctacgccattggtgtgcctgagcctttgt 413
Query: 1070 ctgtctttgtggacagttatggaactggaaagattcctgacaaggagatcctcaagattg 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 ctgtctttgtggacagttatggaactggaaagattcctgacaaggagatcctcaagattg 353
Query: 1130 tgaaggagaacttcgacttcagacccggaatgatgaccatcaacctagatctcaagaggg 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 tgaaggagaacttcgacttcagacccggaatgatgaccatcaacctagatctcaagaggg 293
Query: 1190 gtggcaacaggttcttgaagacagctgcatatggtcactttggaagggacgacccagatt 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 gtggcaacaggttcttgaagacagctgcatatggtcactttggaagggacgacccagatt 233
Query: 1250 tcacctgggaggttgtcaagcccctcaagtgggagaagcctcaagcttag 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 tcacctgggaggttgtcaagcccctcaagtgggagaagcctcaagcttag 183
>KJC_c00527
Length = 1425
Score = 912 bits (460), Expect = 0.0
Identities = 999/1178 (84%), Gaps = 3/1178 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 120 aatggagacctttctattcacctctgagtccgtgaacgagggacaccccgacaaactctg 179
|||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||
Sbjct: 1327 aatggagaccttcctattcacttccgaatctgttaacgagggccatcccgacaagctttg 1268
Query: 180 tgaccagatctctgatgcggtattagatgcctgccttgagcaagatcctgacagcaaggt 239
|| ||| | || ||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1267 cgatcaggtttcagatgccatcctcgatgcttgccttgagcaagatcctgacagcaaggt 1208
Query: 240 tgcctgtgaaacatgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggagagattaccaccaa 299
||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct: 1207 tgcttgcgagacttgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggtgagatcacaaccaa 1148
Query: 300 agccaaggtagactatgagaagatagttcgtcagacatgccgtggaattggatttatttc 359
|||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||| ||||
Sbjct: 1147 agccaatgtagactatgaaaagattgttcgtgacacctgccgttcaattggatttgtttc 1088
Query: 360 cgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtccttgttaacattgagcaacagag 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||
Sbjct: 1087 tgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtcctagtttacattgagcagcagag 1028
Query: 420 ccctgatattgctcagggtgtccatggccacttcaccaagcgcccagaagagattggtgc 479
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||
Sbjct: 1027 ccctgatattgctcagggtgtccatggccatcttaccaagcggcctgaggagattggtgc 968
Query: 480 tggtgatcagggacatatgtttggttatgccactgatgagacccctgagtatatgccttt 539
|||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
Sbjct: 967 tggtgaccaaggtcacatgtttggttatgccactgatgaaacccccgagtttatgcccct 908
Query: 540 gagccatgtccttgcaaccaagctcggggcaaagctaactgaggttaggaagaacggcac 599
|| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || | |||||||||||
Sbjct: 907 tagtcatgttcttgcaaccaagcttggtgcccgcctcactgacgtccgcaagaacggcac 848
Query: 600 ctgcccatggctaaggcctgatggcaagactcaggttactgttgagtactacaatgacaa 659
|||||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 847 ctgcccttggttgagacctgatggcaaaacccaagtcactgtcgagtactacaatgacaa 788
Query: 660 tggtgccatggtcccagtccgcgtacacactgtcctcatctccacccaacatgatgagac 719
|||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||
Sbjct: 787 tggtgcaatggttccagtgcgtgtacacactgttctcatttcaacccaacatgatgaaac 728
Query: 720 tgtaacaaacgatgaaattgctgctgacctcaaggagcacgtcatcaagccggtcatccc 779
||| || |||||||| ||||| ||||| | || ||||| || || ||||| || |||||
Sbjct: 727 tgtcactaacgatgagattgcagctgatttgaaagagcatgttattaagcctgtgatccc 668
Query: 780 tgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccacctcaacccatcagggcgttttgtcat 839
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 667 tgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccatcttaacccatcaggcaggtttgtcat 608
Query: 840 tggtggtcctcacggtgatgcaggactcactggacgcaagatcattattgatacctatgg 899
|||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct: 607 tggtggtcctcacggtgacgctggactcaccggtcgcaagattatcattgatacctacgg 548
Query: 900 tggatggggagcccatggtggcggtgctttctcaggaaaggacccaaccaaggtggacag 959
||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||
Sbjct: 547 tggctggggagcccacggaggtggtgcattctctggcaaggatcccaccaaagtagacag 488
Query: 960 gagtggtgcttatattgtcaggcaggctgccaagagcattgtagcaaatggtcttgcccg 1019
||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct: 487 gagtggtgcctacattgttaggcaggctgccaagagcattgttgcaaatgggcttgctcg 428
Query: 1020 caggtgcattgtgcaggtctcctacgccattggtgtgcctgagcctttgtctgtctttgt 1079
||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || || || || |||||
Sbjct: 427 cagatgcattgttcaagtgtcttatgctattggcgtgccagaaccattatccgtgtttgt 368
Query: 1080 ggacagttatggaactggaaagattcctgacaaggagatcctcaagattgtgaaggagaa 1139
|| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||
Sbjct: 367 tgattcctatggcaccggaaagatcccagacaaggagattctcaagattgtaaaagaaaa 308
Query: 1140 cttcgacttcagacccggaatgatgaccatcaacctagatctcaagaggggtggcaa--- 1196
|||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||||||||||| || |||||
Sbjct: 307 cttcgacttcaggcctggtatgattgctattaacttagatctcaagagaggcggcaatgg 248
Query: 1197 caggttcttgaagacagctgcatatggtcactttggaagggacgacccagatttcacctg 1256
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||
Sbjct: 247 taggttcttgaagacagctgcctatggtcactttggaagggatgacgctgacttcacatg 188
Query: 1257 ggaggttgtcaagcccctcaagtgggagaagcctcaag 1294
|||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 187 ggaggtggtgaagcccctcaaatgggagaagcctcaag 150
>KJC_c08227
Length = 830
Score = 537 bits (271), Expect = e-152
Identities = 661/791 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 118 gaaatggagacctttctattcacctctgagtccgtgaacgagggacaccccgacaaactc 177
|||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 804 gaaatggagaccttcctattcacttcggaatcggtgaacgagggacaccccgacaagctc 745
Query: 178 tgtgaccagatctctgatgcggtattagatgcctgccttgagcaagatcctgacagcaag 237
|| ||||||||||| ||||| || | ||||| || | | || || || |||||||||
Sbjct: 744 tgcgaccagatctccgatgcagtgctcgatgcttgtttggctcaggaccccgacagcaag 685
Query: 238 gttgcctgtgaaacatgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggagagattaccacc 297
|| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 684 gtggcttgcgaaacttgcaccaagaccaacctggtcatggtttttggagagatcaccact 625
Query: 298 aaagccaaggtagactatgagaagatagttcgtcagacatgccgtggaattggatttatt 357
|||||||| ||||||| |||||||| || || | || |||||| |||||||| | |
Sbjct: 624 aaagccaatatagactacgagaagattgtgcgcgacacttgccgttctattggattcact 565
Query: 358 tccgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtccttgttaacattgagcaacag 417
||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct: 564 tccgatgatgtgggtctcgatgctgaccattgtaaggtgcttgtcaatattgagcaacag 505
Query: 418 agccctgatattgctcagggtgtccatggccacttcaccaagcgcccagaagagattggt 477
|| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||
Sbjct: 504 agtcctgatattgctcaaggtgtccatggccatctcactaagcgccctgaggaaattggt 445
Query: 478 gctggtgatcagggacatatgtttggttatgccactgatgagacccctgagtatatgcct 537
|||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||
Sbjct: 444 gctggtgaccaaggtcacatgtttggctatgctactgatgagacccctgaattaatgccc 385
Query: 538 ttgagccatgtccttgcaaccaagctcggggcaaagctaactgaggttaggaagaacggc 597
||||| ||||| | || ||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| ||
Sbjct: 384 ttgagtcatgttttggctaccaaactcggtgctcgtctcactgaggttcgcaagaatggt 325
Query: 598 acctgcccatggctaaggcctgatggcaagactcaggttactgttgagtactacaatgac 657
|| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 324 acttgcccctggctcaggcctgatggtaaaactcaagttactgtcgagtactacagtgat 265
Query: 658 aatggtgccatggtcccagtccgcgtacacactgtcctcatctccacccaacatgatgag 717
|||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||
Sbjct: 264 aatggtgccatggttcctgtccgtgtccacactgttctcatctctacccagcacgatgag 205
Query: 718 actgtaacaaacgatgaaattgctgctgacctcaaggagcacgtcatcaagccggtcatc 777
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||
Sbjct: 204 actgtgacaaacgatgaaattgctgctgatctcaaggagcatgtcatcaagcctattatt 145
Query: 778 cctgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccacctcaacccatcagggcgttttgtc 837
|||| ||||| | ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||
Sbjct: 144 cctgccaagtatttggatgagaagaccatctttcatctgaatccatctgggcgttttgtt 85
Query: 838 attggtggtcctcacggtgatgcaggactcactggacgcaagatcattattgatacctat 897
|||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || |||
Sbjct: 84 attggtggtcctcatggagatgctggtctcacaggccgtaaaatcattattgacacttat 25
Query: 898 ggtggatgggg 908
|||||||||||
Sbjct: 24 ggtggatgggg 14
>KJC_s18589
Length = 384
Score = 131 bits (66), Expect = 5e-30
Identities = 199/242 (82%), Gaps = 1/242 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 946 accaaggtggacaggagtggtgcttatattgtcaggcaggctgccaagagcattgtagca 1005
||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 7 accaaagtagacaggagtggtgcctacattgttaggcaggctgccaagagcattgttgca 66
Query: 1006 aatggtcttgcccgcaggtgcattgtgcaggtctcctacgccattggtgtgcctgagcc- 1064
||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || ||
Sbjct: 67 aatgggcttgctcgcagatgcattgttcaagtgtcttatgctattggcgtgccagaacca 126
Query: 1065 tttgtctgtctttgtggacagttatggaactggaaagattcctgacaaggagatcctcaa 1124
||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct: 127 tttatccgtgtttgttgattcctatggcaccggaaagatcccagacaaggagattctcaa 186
Query: 1125 gattgtgaaggagaacttcgacttcagacccggaatgatgaccatcaacctagatctcaa 1184
|||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||||||||
Sbjct: 187 gattgtaaaagaaaacttcgacttcaggcctggtatgattgctattaacttagatctcaa 246
Query: 1185 ga 1186
||
Sbjct: 247 ga 248