Jatropha Genome Database
- JcCA0309861.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0309861.20 - phase: 0
(1560 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01260 1725 0.0
KJC_c03994 1251 0.0
KJC_s14149 339 1e-92
>KJC_c01260
Length = 884
Score = 1725 bits (870), Expect = 0.0
Identities = 884/886 (99%), Gaps = 2/886 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 71 aaatggttagggacatgtacagtgcaaagtcacagggtgctgatgttgttgaggtcaggt 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aaatggttagggacatgtacagtgcaaagtcacagggtgctgatgttgttgaggtcaggt 60
Query: 131 tggactacatcaagaactttcagcctggccaagaccttgaaaccatcctcagaaagaagc 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tggactacatcaagaactttcagcctggccaagaccttgaaaccatcctcagaaagaagc 120
Query: 191 ccttgccagtgattattgtgtatcggtcaaaatgtgaaggtggtctttttgaaggagatg 250
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccttgccagtgattattgtgtatcggtcaaa-tgtgaaggtgg-ctttttgaaggagatg 178
Query: 251 agcacacgaggttggaagtacttcgtttggctcatgaactgggagctgattatattgatt 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 agcacacgaggttggaagtacttcgtttggctcatgaactgggagctgattatattgatt 238
Query: 311 tagaactcaaggtggcttctgatatgataggggaactgaaaaagacacatcaaactgata 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 tagaactcaaggtggcttctgatatgataggggaactgaaaaagacacatcaaactgata 298
Query: 371 gcaaaattattgtatcatgttatctcactggtgcaacccctccaaaagaaaatcttagcc 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 gcaaaattattgtatcatgttatctcactggtgcaacccctccaaaagaaaatcttagcc 358
Query: 431 atctggttgggagcatgcaagctgctggagcagatattatcaaacttgtttcaaatgcaa 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 atctggttgggagcatgcaagctgctggagcagatattatcaaacttgtttcaaatgcaa 418
Query: 491 ataatattacagaactgcaaagaattttttatttgcttttacattctcaggtgccattaa 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 ataatattacagaactgcaaagaattttttatttgcttttacattctcaggtgccattaa 478
Query: 551 ttgcatactctgtaggagaaagaggtctcataagccaaatattgtccccaaaatttggtg 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 ttgcatactctgtaggagaaagaggtctcataagccaaatattgtccccaaaatttggtg 538
Query: 611 gttctttagtctatggctccatagaaggaaatttgattcctggtctgcctactttagaca 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 gttctttagtctatggctccatagaaggaaatttgattcctggtctgcctactttagaca 598
Query: 671 gccttagagaagcctataaggttgagcgcatcaattcagatactaaagttttcggtctaa 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 gccttagagaagcctataaggttgagcgcatcaattcagatactaaagttttcggtctaa 658
Query: 731 tttctaaaccagttggccacagcaaaggccccatattgcataatcctacattcagacatg 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 tttctaaaccagttggccacagcaaaggccccatattgcataatcctacattcagacatg 718
Query: 791 taaactataatggaatatatgtgcccatgtttgttgatgatctcaaggaattctttagtg 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 taaactataatggaatatatgtgcccatgtttgttgatgatctcaaggaattctttagtg 778
Query: 851 tctactctagccctgactatgccggttttagtgttggatttccatacaaggaagctgttg 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 tctactctagccctgactatgccggttttagtgttggatttccatacaaggaagctgttg 838
Query: 911 ttgagttttgtgatgaagttcatccacttgctaagtctataggtgc 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 ttgagttttgtgatgaagttcatccacttgctaagtctataggtgc 884
>KJC_c03994
Length = 710
Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0
Identities = 638/639 (99%), Gaps = 1/639 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 923 atgaagttcatccacttgctaagtctataggtgcagttaacaccattgttaggaggccta 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 710 atgaagttcatccacttgctaagtctataggtgcagttaacaccattgttaggaggccta 651
Query: 983 gtgatgggaagctgataggttataatacagactgtgaggcttcgataactgcaattgagg 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 650 gtgatgggaagctgataggttataatacagactgtgaggcttcgataactgcaattgagg 591
Query: 1043 atgctctaaaagaacaaggttacatcaatggcagaacatctttcagctcttcattagctg 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 590 atgctctaaaagaacaaggttacatcaatggcagaacatctttcagctcttcattagctg 531
Query: 1103 gaagacagtttgtgctagttggtgctggaggggc-aggacgagcacttgcatttggtgct 1161
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 530 gaagacagtttgtgctagttggtgctggaggggcgaggacgagcacttgcatttggtgct 471
Query: 1162 aaaagtagaggagcccgtataatcattttcgacattgactttgagagaacaaagtcttta 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 470 aaaagtagaggagcccgtataatcattttcgacattgactttgagagaacaaagtcttta 411
Query: 1222 gctcatgctgtttcgggtgaagctcagcctttcaaaaatctggttcattttcggccagaa 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 410 gctcatgctgtttcgggtgaagctcagcctttcaaaaatctggttcattttcggccagaa 351
Query: 1282 actgacgctatccttgcgaatgcaacaccattggggatgcatccaaatacagagagaatt 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 350 actgacgctatccttgcgaatgcaacaccattggggatgcatccaaatacagagagaatt 291
Query: 1342 cctgtggccgaggaaactttgggaatctaccagctggtctttgatgctgtgtatacacct 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 290 cctgtggccgaggaaactttgggaatctaccagctggtctttgatgctgtgtatacacct 231
Query: 1402 agaaaaaccagactattaaaagaagctgaagcagcaggagcaatcatagtaagcggagtc 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 230 agaaaaaccagactattaaaagaagctgaagcagcaggagcaatcatagtaagcggagtc 171
Query: 1462 gaaatgtttctcagacaggcaatcggccagttcaacctcttcacaggcagagaagcgcca 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 170 gaaatgtttctcagacaggcaatcggccagttcaacctcttcacaggcagagaagcgcca 111
Query: 1522 gaagatttcatgcgagagattgttttagccaagttctga 1560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110 gaagatttcatgcgagagattgttttagccaagttctga 72
>KJC_s14149
Length = 447
Score = 339 bits (171), Expect = 1e-92
Identities = 171/171 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1289 ctatccttgcgaatgcaacaccattggggatgcatccaaatacagagagaattcctgtgg 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 ctatccttgcgaatgcaacaccattggggatgcatccaaatacagagagaattcctgtgg 388
Query: 1349 ccgaggaaactttgggaatctaccagctggtctttgatgctgtgtatacacctagaaaaa 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 ccgaggaaactttgggaatctaccagctggtctttgatgctgtgtatacacctagaaaaa 328
Query: 1409 ccagactattaaaagaagctgaagcagcaggagcaatcatagtaagcggag 1459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 ccagactattaaaagaagctgaagcagcaggagcaatcatagtaagcggag 277