Jatropha Genome Database
- JcCA0309581.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0309581.10 + phase: 0
(1344 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01055 2510 0.0
KJC_c11030 198 2e-50
>KJC_c01055
Length = 1668
Score = 2510 bits (1266), Expect = 0.0
Identities = 1266/1266 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 76 gggagtaattctagtcttgccagaggaatcagtagatatagtactgctgctgctgttgaa 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1668 gggagtaattctagtcttgccagaggaatcagtagatatagtactgctgctgctgttgaa 1609
Query: 136 gagccaatagttccatctgtctctgttagtcatactcaacttttaattaatgggcagttt 195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1608 gagccaatagttccatctgtctctgttagtcatactcaacttttaattaatgggcagttt 1549
Query: 196 gtcgatgccgcttcagggaagacttttccaacattggatcctaggacaggtgaagtgatt 255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1548 gtcgatgccgcttcagggaagacttttccaacattggatcctaggacaggtgaagtgatt 1489
Query: 256 gcccatgttgctgaaggtgatgttgaagacataaatagagcagtgtctgctgctcgcaag 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1488 gcccatgttgctgaaggtgatgttgaagacataaatagagcagtgtctgctgctcgcaag 1429
Query: 316 gcattcgatgaagggccatggccaaagatgaccgcttatgaaaggtcaagaataatgttg 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1428 gcattcgatgaagggccatggccaaagatgaccgcttatgaaaggtcaagaataatgttg 1369
Query: 376 cgattcgctgatttgcttgaaatgcataatgatgaaattgctgcacttgagacttgggat 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1368 cgattcgctgatttgcttgaaatgcataatgatgaaattgctgcacttgagacttgggat 1309
Query: 436 aatgggaaaccgtatgaacaggctgctaaagctgaaatacctatggttgcacgcctattt 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1308 aatgggaaaccgtatgaacaggctgctaaagctgaaatacctatggttgcacgcctattt 1249
Query: 496 cgatactatgctggttgggcagataagatccacggtcttacagttccagctgatgggcag 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1248 cgatactatgctggttgggcagataagatccacggtcttacagttccagctgatgggcag 1189
Query: 556 catcatgtgcaaacattgcacgaaccgattggtgttgcaggtcagattattccatggaat 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1188 catcatgtgcaaacattgcacgaaccgattggtgttgcaggtcagattattccatggaat 1129
Query: 616 ttccctcttctgatgtatgcttggaaagttggaccggcattggcatgtggcaatacggtt 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1128 ttccctcttctgatgtatgcttggaaagttggaccggcattggcatgtggcaatacggtt 1069
Query: 676 gttattaagacagcagagcagacaccattgtccgctttttatgtatctaagctatttcat 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1068 gttattaagacagcagagcagacaccattgtccgctttttatgtatctaagctatttcat 1009
Query: 736 gaggctggacttccagaaggtgttttgaatgtggtttctggttttggcccaactgctggt 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1008 gaggctggacttccagaaggtgttttgaatgtggtttctggttttggcccaactgctggt 949
Query: 796 gctgctcttgcgagccatatgaatgtggataagcttgctttcaccggatcaacagataca 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 948 gctgctcttgcgagccatatgaatgtggataagcttgctttcaccggatcaacagataca 889
Query: 856 ggaaaagttgttcttgagttagcagcaagaagcaatcttaagccagtaactttggaactt 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 888 ggaaaagttgttcttgagttagcagcaagaagcaatcttaagccagtaactttggaactt 829
Query: 916 ggagggaaatcgccttttattgtttgcgaggatgctgatgttgaccaggctgttgagctt 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 828 ggagggaaatcgccttttattgtttgcgaggatgctgatgttgaccaggctgttgagctt 769
Query: 976 gctcactttgctttattctttaatcagggtcaatgctgctgtgctggttcccgcacatat 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 768 gctcactttgctttattctttaatcagggtcaatgctgctgtgctggttcccgcacatat 709
Query: 1036 gttcatgagcgtatatatgatgaattcatagaaaaagcaaaggcaagggctataaaacgg 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 708 gttcatgagcgtatatatgatgaattcatagaaaaagcaaaggcaagggctataaaacgg 649
Query: 1096 gttgttggtgatcctttcagaggaggtattgaacaaggtcctcaggttgattcagaacaa 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 648 gttgttggtgatcctttcagaggaggtattgaacaaggtcctcaggttgattcagaacaa 589
Query: 1156 tttgagaagatactaaggtacataaggtctggcattgaaagtggagctacacttgaagct 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 588 tttgagaagatactaaggtacataaggtctggcattgaaagtggagctacacttgaagct 529
Query: 1216 ggaggagatagatttggtaccaagggctattatatccagcccacagttttctcaaatgtt 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 528 ggaggagatagatttggtaccaagggctattatatccagcccacagttttctcaaatgtt 469
Query: 1276 aaggatgatatgcttatagcgaaagatgagatattcggtccagtgcagtccatcttgaaa 1335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 468 aaggatgatatgcttatagcgaaagatgagatattcggtccagtgcagtccatcttgaaa 409
Query: 1336 ttcaag 1341
||||||
Sbjct: 408 ttcaag 403
>KJC_c11030
Length = 600
Score = 198 bits (100), Expect = 2e-50
Identities = 425/532 (79%), Gaps = 1/532 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 491 tatttcgatactatgctggttgggcagataagatccacggtcttacagttccagctgatg 550
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| | ||
Sbjct: 589 tatttcgttactatgctggttgggcggataagattcatgggctaacagttcctggagaca 530
Query: 551 ggcagcatcatgtgcaaacattgcacgaaccgattggtgttgcaggtcagattattccat 610
| | || ||| | ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct: 529 gtaatcaccatattcaagtattgcatgaacctattggagttgcagggcaaattattccat 470
Query: 611 ggaatttccctcttctgatgtatgcttggaaagttggaccggcattggcatgtggcaata 670
||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||
Sbjct: 469 ggaattttcctcttatcttgtttgcttggaaagttggtcctgcattagcttgtggtaata 410
Query: 671 cggttgttattaagacagcagagcagacaccattgtccgctttttatgtatctaagctat 730
| |||| | || |||||||| |||||||| | | ||| | |||| | ||||| |
Sbjct: 409 ctattgtactgaaaacagcagaacagacacctcttactgctctctatgcaggaaagctct 350
Query: 731 ttcatgaggctggacttccagaaggtgttttgaatgtggtttctggttttggcccaactg 790
| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| || | ||| |||||||
Sbjct: 349 tccatgatgctggccttcctccaggtgttctgaatgtagtttcaggctatggtccaactg 290
Query: 791 ctggtgctgctcttgcgagccatatgaatgtggataagcttgctttcaccggatcaacag 850
||||| | |||||||| || || ||| |||| || ||| || ||||||| |||||||| |
Sbjct: 289 ctggttcagctcttgccagtcacatggatgtagacaagatttctttcacaggatcaactg 230
Query: 851 atacaggaaaagttgttcttgagttagcagcaagaagcaatcttaagccagtaactttgg 910
| ||||| || ||| | || || || || || | ||| |||||||||||||| || || |
Sbjct: 229 agacaggcaaggttatcctcgaattggctgctaaaagtaatcttaagccagttacattag 170
Query: 911 aacttggagggaaatcgccttttattgtttgcgaggatgctgatgttgaccaggctgttg 970
|||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
Sbjct: 169 aacttggagg-aaatcacctttcatagtatgcgaagatgctgatattgacaaggctgtgg 111
Query: 971 agcttgctcactttgctttattctttaatcagggtcaatgctgctgtgctgg 1022
||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct: 110 agcttgcacactttgccttgttctttaatcagggccaatgttgttgtgctgg 59