Jatropha Genome Database
- JcCA0308971.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0308971.10 + phase: 2 /partial
(1132 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02761 1925 0.0
>KJC_c02761
Length = 1711
Score = 1925 bits (971), Expect = 0.0
Identities = 985/987 (99%), Gaps = 2/987 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gtctatatttgatttcgagtccataaggaagctgctttcatctccgaaattcacattttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 gtctatatttgatttcgagtccataaggaagctgctttcatctccgaaattcacattttg 781
Query: 61 ttatgatgcattacatggagttgctggggcttatgcaaaacgtattttcgtggaggagct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 ttatgatgcattacatggagttgctggggcttatgcaaaacgtattttcgtggaggagct 841
Query: 121 tggtgcacaagggagttcattgttgaactgcgtacccaaggaggattttggaggaggtca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 tggtgcacaagggagttcattgttgaactgcgtacccaaggaggattttggaggaggtca 901
Query: 181 tccagatcccaaccttacttatgcaaaagagttggttgctcggatgggattgggtaaatc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 tccagatcccaaccttacttatgcaaaagagttggttgctcggatgggattgggtaaatc 961
Query: 241 aaactctgaggttgaaccgccagaatttggtgctgctgctgatggtgatgcagatcgtaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 aaactctgaggttgaaccgccagaatttggtgctgctgctgatggtgatgcagatcgtaa 1021
Query: 301 catgatccttggtaaaaggttctttgtcactccttcggattctgttgcaattattgctgc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 catgatccttggtaaaaggttctttgtcactccttcggattctgttgcaattattgctgc 1081
Query: 361 caatgcagttgaagcgattccttatttctctgctggactaaagggggttgccaggagcat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 caatgcagttgaagcgattccttatttctctgctggactaaagggggttgccaggagcat 1141
Query: 421 gccaacatcagctgccctcgacgttgtggccaaacatctgaatttgaaattttttgaggt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 gccaacatcagctgccctcgacgttgtggccaaacatctgaatttgaaattttttgaggt 1201
Query: 481 tcccactggctggaagttttttggcaacttgatggatgcaggactgtgttcagtttgtgg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 tcccactggctggaagttttttggcaacttgatggatgcaggactgtgttcagtttgtgg 1261
Query: 541 ggaagaaagttttggaactggctcagaccatatacgtgagaaagatggaatttgggcagt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 ggaagaaagttttggaactggctcagaccatatacgtgagaaagatggaatttgggcagt 1321
Query: 601 tctggcttggctatctatacttgctcacaaaaataaggaaaacctcaatggcggaaagct 660
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 tctggcttggctatctatacttgctcac-aaaataaggaaaacctcaatggcggaaagct 1380
Query: 661 tgtgaccgttgaagatattgttcgcaacca-ttgggctttctatggccgccactattata 719
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 tgtgaccgttgaagatattgttcgcaaccatttgggctttctatggccgccactattata 1440
Query: 720 ctcgatatgactatgagaatgttgatgcaagtgcagcaaaggaactaatggcgcacttgg 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 ctcgatatgactatgagaatgttgatgcaagtgcagcaaaggaactaatggcgcacttgg 1500
Query: 780 ttaatctgcaatcttcccttggtgaagttaacaagattgtgaagggggtaaggtcagatg 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 ttaatctgcaatcttcccttggtgaagttaacaagattgtgaagggggtaaggtcagatg 1560
Query: 840 tgtcaaatgttgtccacgctgatgaatttgaatataaagaccctgttgatggttcaatct 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 tgtcaaatgttgtccacgctgatgaatttgaatataaagaccctgttgatggttcaatct 1620
Query: 900 caagtcaccagggtattcgatatttgtttgaggatggttctcgattggttttccgtctct 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 caagtcaccagggtattcgatatttgtttgaggatggttctcgattggttttccgtctct 1680
Query: 960 cgggaactggctcagaaggtgcaacca 986
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 cgggaactggctcagaaggtgcaacca 1707