Jatropha Genome Database
- JcCA0307631.30
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0307631.30 - phase: 0
(1815 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02166 1574 0.0
KJC_c11357 775 0.0
>KJC_c02166
Length = 1071
Score = 1574 bits (794), Expect = 0.0
Identities = 801/802 (99%), Gaps = 1/802 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgaagattaagacagacacacctgtggcaaagaaggcacgcgaaggggttatggaattt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 802 atgaagattaagacagacacacctgtggcaaagaaggcacgcgaaggggttatggaattt 743
Query: 61 ttgct-catgaaccatccattggattgtccaatttgtgatcaaggtggagagtgtgatct 119
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742 ttgcttcatgaaccatccattggattgtccaatttgtgatcaaggtggagagtgtgatct 683
Query: 120 tcaggatcaatctatggcatttggatcagatcgtggccgatttactgaaatgaagcgatc 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682 tcaggatcaatctatggcatttggatcagatcgtggccgatttactgaaatgaagcgatc 623
Query: 180 tgtggttgataagaatcttggtcctttggtgaagactgtgatgactcggtgtattcagtg 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622 tgtggttgataagaatcttggtcctttggtgaagactgtgatgactcggtgtattcagtg 563
Query: 240 cacaaggtgtgtcaggtttgcaacagaaattgctggagtccaggatcttggcatgttagg 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 cacaaggtgtgtcaggtttgcaacagaaattgctggagtccaggatcttggcatgttagg 503
Query: 300 tcgtggcagtggagaagaaattgggacttatgttgaaaagctcatgacaagtgaactttc 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 tcgtggcagtggagaagaaattgggacttatgttgaaaagctcatgacaagtgaactttc 443
Query: 360 tggaaatgtgatagatatctgtcctgttggagcccttacttcaaaaccttttgcatttaa 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 tggaaatgtgatagatatctgtcctgttggagcccttacttcaaaaccttttgcatttaa 383
Query: 420 agcccggaattgggaattgaaagggacagaaagcattgatgttagtgatgcggttggatc 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 agcccggaattgggaattgaaagggacagaaagcattgatgttagtgatgcggttggatc 323
Query: 480 caacattcggattgatagtagaggtccggaggtcatgcgcatcattccgcggttaaatga 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 caacattcggattgatagtagaggtccggaggtcatgcgcatcattccgcggttaaatga 263
Query: 540 ggacataaatgaagaatggatatcagataagactcggttttgctatgatggtctgaagag 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 ggacataaatgaagaatggatatcagataagactcggttttgctatgatggtctgaagag 203
Query: 600 gcagagactcaacgaccctatgattcgtggcacggatgggcgctttaaggctgtgagctg 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gcagagactcaacgaccctatgattcgtggcacggatgggcgctttaaggctgtgagctg 143
Query: 660 gcgtgatgccttagctgtagttgctgaggtaatacatcaagttaaacctgaggaaattgt 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 gcgtgatgccttagctgtagttgctgaggtaatacatcaagttaaacctgaggaaattgt 83
Query: 720 tggagttgctggtaagctgtctgatgctgaatccatgatggcactgaaagatttcttgaa 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82 tggagttgctggtaagctgtctgatgctgaatccatgatggcactgaaagatttcttgaa 23
Query: 780 taaaatggggtcaaataatgtc 801
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22 taaaatggggtcaaataatgtc 1
>KJC_c11357
Length = 428
Score = 775 bits (391), Expect = 0.0
Identities = 426/431 (98%), Gaps = 5/431 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1289 ccagccagagtattgagtctgccaagtttgtgtatttga-tgggtgctgatgatgtgaac 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 428 ccagccagagtattgagtctgccaagtttgtgtatttgagtgggtgctgatgatgtgaac 369
Query: 1348 ttggacaagctg-ccaaatgatgcctttttggtatatcaggggcaccatggggaccgtgg 1406
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 368 ttggacaagctgaccaaatgatgcctttttggtatatcaggg-caccatggggaccgtgg 310
Query: 1407 tgtatatcgtgccaatgtcattttgccagcagcagcatttactgaaaaggaaggtaccta 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 tgtatatcgtgccaatgtcattttgccagcagcagcatttactgaaaaggaaggtaccta 250
Query: 1467 tgcgaacacagaagggtgtgcacaacagactttgcctgcagttccaacagttggtgatgc 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 tgcgaacacagaagggtgtgcacaacagactttgcctgcagttccaacagttggtgatgc 190
Query: 1527 aagggatgactggaagataattcgggctctctctgaggtagcaggggcacgcttgcccta 1586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 189 aagggatgactggaagataattcgggctctctctgaggtagca-gggcacgcttgcccta 131
Query: 1587 tgattcaattggtgccatccgatcccggattagaaatgttgcacccaatctcttgagcct 1646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tgattcaattggtgccatccgatcccggattagaaatgttgcacccaatctcttgagcct 71
Query: 1647 ggatgagagagagccagctactttttgggcttcgttgaagcctgagtgcactcaaaagat 1706
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 70 ggatgagagagagccagctac-ttttgggcttcgttgaagcctgagtgcactcaaaagat 12
Query: 1707 tagttcaacac 1717
|||||||||||
Sbjct: 11 tagttcaacac 1