Jatropha Genome Database
- JcCA0307531.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0307531.10 + phase: 0 /partial
(1008 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00388 1943 0.0
KJC_s13734 926 0.0
KJC_c11109 601 e-171
>KJC_c00388
Length = 1622
Score = 1943 bits (980), Expect = 0.0
Identities = 1001/1009 (99%), Gaps = 1/1009 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggtgtcgagttaacccaacagttcaacgaaatggaggatcttaatttcagtgattct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1558 atgggtgtcgagttaacccaacagttcaacgaaatggaggatcttaatttcagtgattct 1499
Query: 61 gacttagtttatcatgtcagggatgctcttatttccgctaaaacgggagataatgaaagt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1498 gacttagtttatcatgtcagggatgctcttatttccgctaaaacgggagataatgaaagt 1439
Query: 121 taccaccagcttgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatcatcggatgaggtggcc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1438 taccaccagcttgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatcatcggatgaggtggcc 1379
Query: 181 cttcttgtgacaagtctaaaggcactatctggggcagtttcttgcatagacaatatttat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1378 cttcttgtgacaagtctaaaggcactatctggggcagtttcttgcatagacaatatttat 1319
Query: 241 catgaatctcttcttagttctattttt-ggaatgagcatgtggaattatggtccagatgt 299
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1318 catgaatctcttcttagttctattttttggaatgagcatgtggaattatggtccagatgt 1259
Query: 300 gatggatgcgttgctcgaattggttatttccttggctgcttcaaatgtcaaatatgttga 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1258 gatggatgcgttgctcgaattggttatttccttggctgcttcaaatgtcaaatatgttga 1199
Query: 360 tgcatgcttggaaatgcttgttggcaatttcgtgccacccatgtatttggtagatgtact 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1198 tgcatgcttggaaatgcttgttggcaatttcgtgccacccatgtatttggtagatgtact 1139
Query: 420 aaagcaaccacgtggtcatggnnnnnnngatcaagttctttctcgcgtgcatactgcttt 479
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1138 aaagcaaccacgtggtcatggaaaaaaagatcaagttctttctcgcgtgcatactgcttt 1079
Query: 480 acaagatattgctgctttggtacctatggcagcattgagattgtcaaacgttgttgtcca 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1078 acaagatattgctgctttggtacctatggcagcattgagattgtcaaacgttgttgtcca 1019
Query: 540 tagaatgccaacaacctataagaaggatcttgagacagatcgactaaaatatcgaactga 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1018 tagaatgccaacaacctataagaaggatcttgagacagatcgactaaaatatcgaactga 959
Query: 600 gatttatgtggagaacatgctaagattggaaagtggtgcaattagagaatttgttgggaa 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 958 gatttatgtggagaacatgctaagattggaaagtggtgcaattagagaatttgttgggaa 899
Query: 660 caggatgattatggctgtggttgacatgctggtagagttggatgtggctattggttggga 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 898 caggatgattatggctgtggttgacatgctggtagagttggatgtggctattggttggga 839
Query: 720 tgacatattacgagatgactctagtaaaggcatctttgcaattgagctagaagaaggtga 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 838 tgacatattacgagatgactctagtaaaggcatctttgcaattgagctagaagaaggtga 779
Query: 780 tattggttctgatgatgaagagaatgacattggcgagtttccaagaacttcaactcataa 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 tattggttctgatgatgaagagaatgacattggcgagtttccaagaacttcaactcataa 719
Query: 840 gagtttaggcaaaaatgttgttgctgatttattggatggcttgatggtgcaaacatttga 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 gagtttaggcaaaaatgttgttgctgatttattggatggcttgatggtgcaaacatttga 659
Query: 900 gcatcttgaattgtgtgcaaacaataagcgcttgagtgaggtatttgaaactcttctgga 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gcatcttgaattgtgtgcaaacaataagcgcttgagtgaggtatttgaaactcttctgga 599
Query: 960 ttcattcatgattactatcctgaacacttacaagtccaagttttctcag 1008
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 ttcattcatgattactatcctgaacacttacaagtccaagttttctcag 550
>KJC_s13734
Length = 499
Score = 926 bits (467), Expect = 0.0
Identities = 490/499 (98%), Gaps = 2/499 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 12 gttaacccaacagttcaacgaaatggaggatcttaatttcagtgattctgacttagttta 71
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttaacccaacagttcaacgaaatggaggatcttaatttcagtgattctgacttagttta 60
Query: 72 tcatgtcagggatgctcttatttccgctaaaacgggagataatgaaagttaccaccagct 131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcatgtcagggatgctcttatttccgctaaaacgggagataatgaaagttaccaccagct 120
Query: 132 tgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatcatcggatgaggtggcccttcttgtgac 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatcatcggatgaggtggcccttcttgtgac 180
Query: 192 aagtctaaaggcactatctggggcagtttcttgcatagacaatatttatcatgaatctct 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagtctaaaggcactatctggggcagtttcttgcatagacaatatttatcatgaatctct 240
Query: 252 tcttagttctatttttggaatgagcatgtggaattatggtccagatgtgatggatgcgtt 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcttagttctatttttggaatgagcatgtggaattatggtccagatgtgatggatgcgtt 300
Query: 312 gctcgaattggttatttccttggctgcttcaaatgtcaaatatgttgatgcatgcttgga 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gctcgaattggttatttccttggctgcttcaaatgtcaaatatgttgatgcatgcttgga 360
Query: 372 aatgcttgttggcaatttcgtgccacccatgtatttggtagatgtactaaagcaaccacg 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aatgcttgttggcaatttcgtgccacccatgtatttggtagatgtactaaagcaaccacg 420
Query: 432 tggtcatgg--nnnnnnngatcaagttctttctcgcgtgcatactgctttacaagatatt 489
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tggtcatggaaaaaaaaagatcaagttctttctcgcgtgcatactgctttacaagatatt 480
Query: 490 gctgctttggtacctatgg 508
|||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gctgctttggtacctatgg 499
>KJC_c11109
Length = 535
Score = 601 bits (303), Expect = e-171
Identities = 326/331 (98%), Gaps = 2/331 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 105 gggagataatgaaagttaccaccagcttgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatc 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 205 gggagataatgaaagttaccaccagcttgttggggtaatgcatcattcaaaacgtctatc 264
Query: 165 atcggatgaggtggcccttcttgtgacaagtctaaaggcactatctggggcagtttcttg 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 265 atcggatgaggtggcccttcttgtgacaagtctaaaggcactatctggggcagtttcttg 324
Query: 225 catagacaatatttatcatgaatctcttcttagttctatttttggaatgagcatgtggaa 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325 catagacaatatttatcatgaatctcttcttagttctatttttggaatgagcatgtggaa 384
Query: 285 ttatggtccagatgtgatggatgcgttgctcgaattggttatttccttggctgcttcaaa 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 ttatggtccagatgtgatggatgcgttgctcgaattggttatttccttggctgcttcaaa 444
Query: 345 tgtcaaatatgttgatgcatgcttggaaatgcttgttggcaatttcgtgccacccatgta 404
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 445 tgtcaaatatgttgatgcatgcttgg-aatgcttgttggcaatttcgtgcca-ccatgta 502
Query: 405 tttggtagatgtactaaagcaaccacgtggt 435
||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 tttggagtatgtactaaagcaaccacgtggt 533