Jatropha Genome Database
- JcCA0304341.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0304341.10 - phase: 2 /partial
(808 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04735 1518 0.0
>KJC_c04735
Length = 1528
Score = 1518 bits (766), Expect = 0.0
Identities = 780/782 (99%), Gaps = 2/782 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgatggtgaaacctttatatcggctgatgacctgcgaatcaacctttggaacttggaaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 tgatggtgaaacctttatatcggctgatgacctgcgaatcaacctttggaacttggaaat 723
Query: 61 tagcaatcaaagtttcaatattgttgatgtaaagccagcaaatatggaggatctaactga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 tagcaatcaaagtttcaatattgttgatgtaaagccagcaaatatggaggatctaactga 663
Query: 121 ggttataacatctgcagaattccaccccaaccactgcaatatgttagcatatagcagttc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 ggttataacatctgcagaattccaccccaaccactgcaatatgttagcatatagcagttc 603
Query: 181 gagaggctcaatccgactaattgatttgcgacaatcagctttatgtgactctcatgccaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 gagaggctcaatccgactaattgatttgcgacaatcagctttatgtgactctcatgccaa 543
Query: 241 attgtttgaggaacaggaggcaccaggttctagatcatttttcacagagataattgcttc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 attgtttgaggaacaggaggcaccaggttctagatcatttttcacagagataattgcttc 483
Query: 301 aatctcagatattaaatttgctaaggatggaaggcatattcttagtcgtgattacatgac 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 482 aatctcagatattaaatttgctaaggatggaaggcatattct-agtcgtgattacatgac 424
Query: 361 tcttaagttatgggacatcaatatggattcaggtccagttgcaaccttccaggttcatga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 tcttaagttatgggacatcaatatggattcaggtccagttgcaaccttccaggttcatga 364
Query: 421 atatttaagacctaagttatgtgatttgtatgaaaatgattcaatcttcgataaattcga 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 atatttaagacctaagttatgtgatttgtatgaaaatgattcaatcttcgataaattcga 304
Query: 481 gtgttgtttgagcggtgatggattgcgagtggcaaccgggtcttacagcaatctgttccg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 gtgttgtttgagcggtgatggattgcgagtggcaaccgggtcttacagcaatctgttccg 244
Query: 541 tgtgtttggttgtgcccctggaagcactgaagaaacaactttggaagccagcaaaaatcc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 tgtgtttggttgtgcccctggaagcactgaagaaacaactttggaagccagcaaaaatcc 184
Query: 601 aatgaggagacaagttcagaccccttcaaggccttccagatccctaagcagtataacacg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 aatgaggagacaagttcagaccccttcaaggccttccagatccctaagcagtataacacg 124
Query: 661 tgttgtaagacggggagcagagagcccaggagttgatgcaaatggaaattcttttgattt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 tgttgtaagacggggagcagagagcccaggagttgatgcaaatggaaattcttttgattt 64
Query: 721 cacaacaaaattgctgcatctagcatggcacccaaccgaaaactcaatcgcctgtgctgc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 cacaacaaaattgctgcatctagcatggcacccaa-cgaaaactcaatcgcctgtgctgc 5
Query: 781 tg 782
||
Sbjct: 4 tg 3