Jatropha Genome Database
- JcCA0302331.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0302331.10 + phase: 2 /partial
(1069 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00891 1616 0.0
KJC_c00158 1392 0.0
KJC_s13863 103 9e-22
KJC_c00664 84 8e-16
>KJC_c00891
Length = 1218
Score = 1616 bits (815), Expect = 0.0
Identities = 822/823 (99%), Gaps = 1/823 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatgtcgcttctttcagatctcatcaaccttaatctctctgagaccactgacaagatcat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tatgtcgcttctttcagatctcatcaaccttaatctctctgagaccactgacaagatcat 194
Query: 61 cgcggagtacatatggatcggtggatctggcatggacttgaggagcaaagcaaggaccct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 cgcggagtacatatggatcggtggatctggcatggacttgaggagcaaagcaaggaccct 254
Query: 121 ctctggaccagtcagtgatccttcaaagcttccaaagtggaactacgatggttccagcac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ctctggaccagtcagtgatccttcaaagcttccaaagtggaactacgatggttccagcac 314
Query: 181 aggccaggctcctggagaagatagtgaagtgatcctctatcctcaagctatttttaggga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 aggccaggctcctggagaagatagtgaagtgatcctctatcctcaagctatttttaggga 374
Query: 241 tccatttagaaggggcaacaacatccttgtcatttgtgatgcttacaccccagccggtga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 tccatttagaaggggcaacaacatccttgtcatttgtgatgcttacaccccagccggtga 434
Query: 301 gccaattccaacaaacaagagacatgccgccgctaagattttcagccatcctgatgtggt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 gccaattccaacaaacaagagacatgccgccgctaagattttcagccatcctgatgtggt 494
Query: 361 tgctgaagtgccttggtatggcattgagcaagaatacaccttgttgcagaaagacattaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 495 tgctgaagtgccttggtatggcattgagcaagaatacaccttgttgcagaaagacattaa 554
Query: 421 atggcctattggctggcccattgggggcttccctggccctcagggaccatactattgtgg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 555 atggcctattggctggcccattgggggcttccctggccctcagggaccatactattgtgg 614
Query: 481 tgttggtgctgacaagtcatttggaagagacattgttgatgcacattacaaggcttgttt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 615 tgttggtgctgacaagtcatttggaagagacattgttgatgcacattacaaggcttgttt 674
Query: 541 atatgctggtgtcaacattagtggtattaatggagaagttatgcctggccagtgggagtt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 675 atatgctggtgtcaacattagtggtattaatggagaagttatgcctggccagtgggagtt 734
Query: 601 tcaagttggacctgcagttggtatctcagccggagatgaattgtgggttgctcgctacat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 735 tcaagttggacctgcagttggtatctcagccggagatgaattgtgggttgctcgctacat 794
Query: 661 tttggagaggattacagagattgctggagttgtg-ctttcttttgatcctaagccaattc 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 795 tttggagaggattacagagattgctggagttgtgtctttcttttgatcctaagccaattc 854
Query: 720 agggtgactggaatggagcaggtgcacatacaaattacagtacaaagtcaatgagaaatg 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 855 agggtgactggaatggagcaggtgcacatacaaattacagtacaaagtcaatgagaaatg 914
Query: 780 atggaggctatgaggtcatcaagaaagcaattgaaaagctggg 822
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 915 atggaggctatgaggtcatcaagaaagcaattgaaaagctggg 957
>KJC_c00158
Length = 985
Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0
Identities = 702/702 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 368 gtgccttggtatggcattgagcaagaatacaccttgttgcagaaagacattaaatggcct 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951 gtgccttggtatggcattgagcaagaatacaccttgttgcagaaagacattaaatggcct 892
Query: 428 attggctggcccattgggggcttccctggccctcagggaccatactattgtggtgttggt 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 891 attggctggcccattgggggcttccctggccctcagggaccatactattgtggtgttggt 832
Query: 488 gctgacaagtcatttggaagagacattgttgatgcacattacaaggcttgtttatatgct 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831 gctgacaagtcatttggaagagacattgttgatgcacattacaaggcttgtttatatgct 772
Query: 548 ggtgtcaacattagtggtattaatggagaagttatgcctggccagtgggagtttcaagtt 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771 ggtgtcaacattagtggtattaatggagaagttatgcctggccagtgggagtttcaagtt 712
Query: 608 ggacctgcagttggtatctcagccggagatgaattgtgggttgctcgctacattttggag 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711 ggacctgcagttggtatctcagccggagatgaattgtgggttgctcgctacattttggag 652
Query: 668 aggattacagagattgctggagttgtgctttcttttgatcctaagccaattcagggtgac 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 651 aggattacagagattgctggagttgtgctttcttttgatcctaagccaattcagggtgac 592
Query: 728 tggaatggagcaggtgcacatacaaattacagtacaaagtcaatgagaaatgatggaggc 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 591 tggaatggagcaggtgcacatacaaattacagtacaaagtcaatgagaaatgatggaggc 532
Query: 788 tatgaggtcatcaagaaagcaattgaaaagctggggttgaggcacaaaaaacacattgct 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 tatgaggtcatcaagaaagcaattgaaaagctggggttgaggcacaaaaaacacattgct 472
Query: 848 gcatatggtgaaggcaatgagcgccgactcacggggcgacatgaaacagctgacatcaac 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 gcatatggtgaaggcaatgagcgccgactcacggggcgacatgaaacagctgacatcaac 412
Query: 908 actttcaaatggggtgttgcagaccgtggagcatctgttcgcgttggccgggatacagaa 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 actttcaaatggggtgttgcagaccgtggagcatctgttcgcgttggccgggatacagaa 352
Query: 968 aaggaaggaaaagggtattttgaggacagaaggcctgcatcaaacatggatccatatgtt 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 aaggaaggaaaagggtattttgaggacagaaggcctgcatcaaacatggatccatatgtt 292
Query: 1028 gttacttccatgattgcagaaaccaccatcctgtggaaacca 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 gttacttccatgattgcagaaaccaccatcctgtggaaacca 250
>KJC_s13863
Length = 125
Score = 103 bits (52), Expect = 9e-22
Identities = 71/75 (94%), Gaps = 3/75 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 324 atgccgccgctaa-gattttcagccatcctgatgtggttg--ctgaagtgccttggtatg 380
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 51 atgccgccgctaaagattttcagccatcctgatgtggtttgactgaagtgccttggtatg 110
Query: 381 gcattgagcaagaat 395
|||||||||||||||
Sbjct: 111 gcattgagcaagaat 125
Score = 79.8 bits (40), Expect = 1e-14
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 273 tttgtgatgcttacaccccagccggtgagccaattccaac 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 40 tttgtgatgcttacaccccagccggtgagccaattccaac 1
>KJC_c00664
Length = 1237
Score = 83.8 bits (42), Expect = 8e-16
Identities = 63/70 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 530 aaggcttgtttatatgctggtgtcaacattagtggtattaatggagaagttatgcctggc 589
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct: 791 aaggcttgtttatatgctggaattaacattagtggtaccaatggggaagttatgcccggc 850
Query: 590 cagtgggagt 599
||||||||||
Sbjct: 851 cagtgggagt 860