Jatropha Genome Database
- JcCA0301531.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0301531.10 + phase: 0 /pseudo/partial
(1158 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01287 2260 0.0
KJC_c01852 190 5e-48
KJC_c08177 66 2e-10
>KJC_c01287
Length = 1213
Score = 2260 bits (1140), Expect = 0.0
Identities = 1154/1156 (99%), Gaps = 2/1156 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 cttctatagatgatgagaagattgatgtggtatctgcttcaagaagacatggatcagaga 60
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 cttctatagatgatgagaagattgatgtg-tatctgcttcaagaagacatggatcagaga 118
Query: 61 gttggatacccgtctgggaggcaggagccaacttacacggatctgttatcaggctttggg 120
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119 gttggataccc-tctgggaggcaggagccaacttacacggatctgttatcaggctttggg 177
Query: 121 gcaaatgctgattcctcccatgggtttggttcatcctttgttgaccagtcttctacaact 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 gcaaatgctgattcctcccatgggtttggttcatcctttgttgaccagtcttctacaact 237
Query: 181 gccagcagaaagcttgttttggatcaggaaggcaagtttaacttgcttgctagtccgtgg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 gccagcagaaagcttgttttggatcaggaaggcaagtttaacttgcttgctagtccgtgg 297
Query: 241 cctttaatgtcatcaggtctgtcgcaaaagttatcagaatctaatacaaaggctacttta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 cctttaatgtcatcaggtctgtcgcaaaagttatcagaatctaatacaaaggctacttta 357
Query: 301 caaggtcgtgatttgccttaccagatacgggggaatatgagatgcagtgcatttagtgag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 caaggtcgtgatttgccttaccagatacgggggaatatgagatgcagtgcatttagtgag 417
Query: 361 tatcccatgcttaatgctcataggatggagcaatcgcatggaaattggttgatgccaccc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 tatcccatgcttaatgctcataggatggagcaatcgcatggaaattggttgatgccaccc 477
Query: 421 ccacaaacgtctcattttgataatcatgctcatgcgagagaattggtgccaaaacctgca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 ccacaaacgtctcattttgataatcatgctcatgcgagagaattggtgccaaaacctgca 537
Query: 481 ttggtacaagaacatgagacagggaaacctgctgaaggaaattgtaggctctttggcatt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 ttggtacaagaacatgagacagggaaacctgctgaaggaaattgtaggctctttggcatt 597
Query: 541 cccttgtttcgtaatccagttacaaccgagccagcagcctcacatagaaacatggtcagt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 cccttgtttcgtaatccagttacaaccgagccagcagcctcacatagaaacatggtcagt 657
Query: 601 gagcctctcaatcatacacattcatcaagtcatcgacttcatgtattagagtcagatcaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gagcctctcaatcatacacattcatcaagtcatcgacttcatgtattagagtcagatcaa 717
Query: 661 aggtcagaccagtccaaaggttgtaaaatggctgatgataatgaacatgagaaacaatat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 aggtcagaccagtccaaaggttgtaaaatggctgatgataatgaacatgagaaacaatat 777
Query: 721 caagctggtctcctgcatacgagggacaatcaaggcaaagctcaaaatggttcgacaagg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 caagctggtctcctgcatacgagggacaatcaaggcaaagctcaaaatggttcgacaagg 837
Query: 781 agttgtactaaggttcaaaagcaggggattgcacttggtaggtctgttgaccttactaag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 838 agttgtactaaggttcaaaagcaggggattgcacttggtaggtctgttgaccttactaag 897
Query: 841 ttcggcaattatgatgagttgattgctgaattggataggttgtttgagtttgacggtgaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 898 ttcggcaattatgatgagttgattgctgaattggataggttgtttgagtttgacggtgaa 957
Query: 901 ctcctggctcccaaaaggaattggttgattgtgtatacggatgatgaaggcgatatgatg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 958 ctcctggctcccaaaaggaattggttgattgtgtatacggatgatgaaggcgatatgatg 1017
Query: 961 cttgttggagatgatccctggcaggaatttgttggcatggctcggaagattttcatctac 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1018 cttgttggagatgatccctggcaggaatttgttggcatggctcggaagattttcatctac 1077
Query: 1021 actagagaggaggtgcagaagatgaatccagggaccctgaattcaaagggggatgagaat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1078 actagagaggaggtgcagaagatgaatccagggaccctgaattcaaagggggatgagaat 1137
Query: 1081 ttgttggaggtggacggtgtggatgcaaaagaagtgaaacgtttgccacttccttcagca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1138 ttgttggaggtggacggtgtggatgcaaaagaagtgaaacgtttgccacttccttcagca 1197
Query: 1141 catagcaccgagaatt 1156
||||||||||||||||
Sbjct: 1198 catagcaccgagaatt 1213
>KJC_c01852
Length = 484
Score = 190 bits (96), Expect = 5e-48
Identities = 103/104 (99%), Gaps = 1/104 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 cttctatagatgatgagaagattgatgtggtatctgcttcaagaagacatggatcagaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 103 cttctatagatgatgagaagattgatgtggtatctgcttcaagaagacatggatcagaga 44
Query: 61 gttggatacccgtctgggaggcaggagccaacttacacggatct 104
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 43 gttggataccc-tctgggaggcaggagccaacttacacggatct 1
>KJC_c08177
Length = 664
Score = 65.9 bits (33), Expect = 2e-10
Identities = 45/49 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 934 tatacggatgatgaaggcgatatgatgcttgttggagatgatccctggc 982
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct: 131 tatacagatgatgaaggagatatgatgcttgttggtgatgatccatggc 83