Jatropha Genome Database
- JcCA0298381.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0298381.10 - phase: 0 /partial
(2913 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c08055 1885 0.0
KJC_c04852 680 0.0
>KJC_c08055
Length = 1008
Score = 1885 bits (951), Expect = 0.0
Identities = 1000/1012 (98%), Gaps = 5/1012 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 971 aatgttgccggttcttattttcggaggcaatgaatggtggcattttttcctctggaagtt 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1008 aatgttgccggttcttattttcggaggcaatgaatggtggcattttttcctctggaagtt 949
Query: 1031 ttacaaagggctcaaactcagttgcatgtatagattccttgaattgtcaatcatcagaca 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 948 ttacaaagggctcaaactcagttgcatgtatagattccttgaattgtcaatcatcagaca 889
Query: 1091 tccagatgtctcaaattgacagaacttcacaatcaaatacttctttaaaatctggtgtat 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 888 tccagatgtctcaaattgacagaacttcacaatcaaatacttctttaaaatctggtgtat 829
Query: 1151 tgcctacttcaagcagtcaatcatttccatctggtccttcgctactttcagctgatgata 1210
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 828 tgcctact-caagcagtcaatcatttccatctggtccttcgctactttcagctgatgata 770
Query: 1211 gtacactaatatgtggaagggaaccaaatcagtttatgggtcactcttttgcaggccatg 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 769 gtacactaatatgtggaagggaaccaaatcagtttatgggtcactcttttgcaggccatg 710
Query: 1271 aacaagagtttattacaagtcaacatgatggcttcgtatataccaatggcagtgatagtc 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 709 aacaagagtttattacaagtcaacatgatggcttcgtatatac-aatggcagtgatagtc 651
Query: 1331 acccctgtgataatggtacagataccacagacatgcaagagcaacattatatgaaggaac 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 650 acccctgtgataatggtacagataccacagacatgcaagagcaacattatatgaaggaac 591
Query: 1391 cttcaaaattagtgtctgtgaatacttttgattcaggttctaatactctgcagtcatgtc 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 590 cttcaaaattagtgtctgtgaatacttttgattcaggttctaatactctgcagtcatgtc 531
Query: 1451 atgtgaatgaaatattaaatgagcaaagagaacagcaagatggagctctatgctatgaac 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 530 atgtgaatgaaatattaaatgagcaaagagaacagcaagatggagctctatgctatgaac 471
Query: 1511 ctcctcgttttccaagtctggatattccttttctgagctgtgatcttatacaatctggaa 1570
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 470 ctcctcgttttccaagtctggatat-ccttttctgagctgtgatcttatacaatctggaa 412
Query: 1571 gtgatatgcagcaagagtacagtcctcttggtattcgccaactgatgatgtcttccatga 1630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 gtgatatgcagcaagagtacagtcctcttggtattcgccaactgatgatgtcttccatga 352
Query: 1631 attgcagtactccatttaggctatgggactcaccatctcgggatgatagtcctgatgctg 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 attgcagtactccatttaggctatgggactcaccatctcgggatgatagtcctgatgctg 292
Query: 1691 tgctgaagagtgctgctaagactttcactggtacaccatccattttgaagaaacgaaatc 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 tgctgaagagtgctgctaagactttcactggtacaccatccattttgaagaaacgaaatc 232
Query: 1751 gtgatttgttgtcacctttgtctgatagaagaattgnnnnnnngcttgaggttgacatgg 1810
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 231 gtgatttgttgtcacctttgtctgatagaagaattgaaaaaaagcttgaggttgacatgg 172
Query: 1811 catctagtttgacaaaagagttttcaaggttggatgttatatttgctgagaaagagacac 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171 catctagtttgacaaaagagttttcaaggttggatgttatatttgctgagaaagagacac 112
Query: 1871 aaagtgctactctgctgtctccttcttctaatcagaaaaggaaccatgggtcctcctatg 1930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 111 aaagtgctactctgctgtctccttcttctaatcagaaaagg-accatgggtcctcctatg 53
Query: 1931 aagataaggaaaatgtagatcctgctttcgaaggtagacaa-gaaaagggga 1981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 52 aagataaggaaaatgtagatcctgctttcgaaggtagacaaggaaaagggga 1
>KJC_c04852
Length = 826
Score = 680 bits (343), Expect = 0.0
Identities = 357/364 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatgagattttgcgcaaagctgttcagcgtttcaagggaaagaactggnnnnnnnttgct 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 364 gatgagattttgcgcaaagctgttcagcgtttcaagggaaagaactggaaaaaaattgct 305
Query: 61 gagtgtttcaaggacaggactgatgtacaatgcctacataggtggcagaaggttttaaat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 gagtgtttcaaggacaggactgatgtacaatgcctacataggtggcagaaggttttaaat 245
Query: 121 ccggagcttgttaaaggtccatggtcgaaggaggaggatgaaataataattgaactggtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 ccggagcttgttaaaggtccatggtcgaaggaggaggatgaaataataattgaactggtc 185
Query: 181 aacaaatatgggccaaaaaagtggtccacaattgcccaacatttacctggacgaattgga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 aacaaatatgggccaaaaaagtggtccacaattgcccaacatttacctggacgaattgga 125
Query: 241 aaacagtgcagagaaaggtggcataatcatcttaatccttcaataaataaagaggcatgg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 aaacagtgcagagaaaggtggcataatcatcttaatccttcaataaataaagaggcatgg 65
Query: 301 acccaacaggaggagttggccttgattcgtgctcatcagatttatgggaatagatgggca 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64 acccaacaggaggagttggccttgattcgtgctcatcagatttatgggaatagatgggca 5
Query: 361 gagc 364
||||
Sbjct: 4 gagc 1