Jatropha Genome Database
- JcCA0289141.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0289141.10 - phase: 0 /partial
(1431 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01669 1578 0.0
KJC_c01272 1536 0.0
>KJC_c01669
Length = 1423
Score = 1578 bits (796), Expect = 0.0
Identities = 841/850 (98%), Gaps = 7/850 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 588 atcaccaccaccgagaccatacgagt---acaatgattatggcgactataggggtg-aaa 643
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1 atcaccaccaccgagaccatacgagtcaaaaaatgattatggcgactataggggtggaaa 60
Query: 644 gt-ggacatggaggtcctggaatg-actaggaggacgaggtcatttggagatatgagtga 701
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtaggacatggaggtcctggaatggactaggaggacgaggtcatttggagatatgagtga 120
Query: 702 agcggtcggaagagatggtggagaagggcgagaggaaagaagggcagttactccattgag 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcggtcggaagagatggtggagaagggcgagaggaaagaagggcagttactccattgag 180
Query: 762 ggaaatgaaacctgagagaatttttggcaagatggctcatttgcagaggttattggatag 821
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggaa-tgaaacctgagagaatttttggcaagatggctcatttgcagaggttattggatag 239
Query: 822 gttcttgtcatgtcggcctactggattagccaagaacagcagaatgatactaattgcgct 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 gttcttgtcatgtcggcctactggattagccaagaacagcagaatgatactaattgcgct 299
Query: 882 ttatccagttgtgagggagagttttcagttgtatgcagatatatgtgaggttttggctgt 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ttatccagttgtgagggagagttttcagttgtatgcagatatatgtgaggttttggctgt 359
Query: 942 tttgttggacaaattctttgacatggagtatccagattgtgtgaaggcctttgatgctta 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 tttgttggacaaattctttgacatggagtatccagattgtgtgaaggcctttgatgctta 419
Query: 1002 tgccagtgcagggaaacagattgatgagctaattatattttataattggtgtaaggatac 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 tgccagtgcagggaaacagattgatgagctaattatattttataattggtgtaaggatac 479
Query: 1062 tggtgtggctagatcctcagagtatccagatgtgcagaagattactagtaaattgttgga 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 tggtgtggctagatcctcagagtatccagatgtgcagaagattactagtaaattgttgga 539
Query: 1122 aactttggaggagtttgtcagggatagggccaagcggcccaagagccctgagaggaaaga 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 aactttggaggagtttgtcagggatagggccaagcggcccaagagccctgagaggaaaga 599
Query: 1182 ggaggctcctcctgtggctcaagaggaagagcctgtacctgatatgaacgaaattaaggc 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 ggaggctcctcctgtggctcaagaggaagagcctgtacctgatatgaacgaaattaaggc 659
Query: 1242 attgcctccgcctgagaattacactcctcctccccctcctgagccagagcctacacctca 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 attgcctccgcctgagaattacactcctcctccccctcctgagccagagcctacacctca 719
Query: 1302 gcaaccgcaggttgctgaagatttggtgaatttgagggacgatgttgtctctgcagatga 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 gcaaccgcaggttgctgaagatttggtgaatttgagggacgatgttgtctctgcagatga 779
Query: 1362 tcaaggaaatagattggcattggctttgtttgctgggccacctgctaataatggaaatgg 1421
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 tcaaggaaatagattggcattggctttgttttctgggccacctgctaataatggaaatgg 839
Query: 1422 atcatgggaa 1431
||||||||||
Sbjct: 840 atcatgggaa 849
>KJC_c01272
Length = 814
Score = 1536 bits (775), Expect = 0.0
Identities = 803/807 (99%), Gaps = 4/807 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcgccgagcacaatccgcaaagctatcgggaccgttaaggatcaaacaagtattggc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 810 atggcgccgagcacaatccgcaaagctatcgggaccgttaaggatcaaacaagtattggc 751
Query: 61 atagccaaggtggcaagtaacatggcaccggagctagaagtggcgatagtgaaggcgacg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 750 atagccaaggtggcaagtaacatggcaccggagctagaagtggcgatagtgaaggcgacg 691
Query: 121 agccacgacgatgatccggcgaatgagaaatacataagagagatcttgaacttgacatcg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 690 agccacgacgatgatccggcgaatgagaaatacataagagagatcttgaacttgacatcg 631
Query: 181 tattctcgtggatacgtgcacgcctgtgtggcggcggtgtcgaagcggctggggaagacg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 630 tattctcgtggatacgtgcacgcctgtgtggcggcggtgtcgaagcggctggggaagacg 571
Query: 241 agggactggattgtggcgctcaaggcgctgatgctgattcacaggctgttaaacgatgga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 570 agggactggattgtggcgctcaaggcgctgatgctgattcacaggctgttaaacgatgga 511
Query: 301 gatccattgtttcaagaagaaatactgtatgctacaaggaggggaactaggcttttgaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510 gatccattgtttcaagaagaaatactgtatgctacaaggaggggaactaggcttttgaat 451
Query: 361 atgtctgattttcgagatgaggcccactcgagttcgtgggatcattctgccttcgtaagg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450 atgtctgattttcgagatgaggcccactcgagttcgtgggatcattctgccttcgtaagg 391
Query: 421 acttatgccatgtatttagatcagagacttgaattggtgctttttgaccggaaaggcggc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390 acttatgccatgtatttagatcagagacttgaattggtgctttttgaccggaaaggcggc 331
Query: 481 agtgcccgtggtgaaattgaaagatatggtgctagaggtgatttggactggaaaggcggc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 agtgcccgtggtgaaattgaaagatatggtgctagaggtgatttggactggaaaggcggc 271
Query: 541 agtgcccatggtgaaattgagagatatggagccagaggtgattttagatcaccaccaccg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270 agtgcccatggtgaaattgagagatatggagccagaggtgattttagatcaccaccaccg 211
Query: 601 agaccatacgagtacaatgattatggcgactataggggtgaaagtggacatggaggtcct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210 agaccatacgagtacaatgattatggcgactataggggtgaaagtggacatggaggtcct 151
Query: 661 ggaatgactaggaggacgaggtcatttggagatatgagtgaagcggtcggaagagatggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150 ggaatgactaggaggacgaggtcatttggagatatgagtgaagcggtcggaagagatggt 91
Query: 721 ggagaagggcgagaggaaagaagggcagttactccattgagggaaatgaaacctgagaga 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 90 ggagaagggcgagaggaaag-agggcagttact-cattgagggaaatg-aacctgagaga 34
Query: 781 atttttggcaagatggctcatttgcag 807
| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 33 a-ttttggcaagatggctcatttgcag 8