Jatropha Genome Database
- JcCA0275691.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0275691.10 - phase: 0 /partial
(1316 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02137 2601 0.0
>KJC_c02137
Length = 1494
Score = 2601 bits (1312), Expect = 0.0
Identities = 1315/1316 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggctaaggaattacaagttcttaatgctcttgatgtagcaaaaacacaatggtatcac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 atggctaaggaattacaagttcttaatgctcttgatgtagcaaaaacacaatggtatcac 1356
Query: 61 ttcactgcaattataattgctggaatggggttttttacggatgcatatgacttgttttgc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 ttcactgcaattataattgctggaatggggttttttacggatgcatatgacttgttttgc 1296
Query: 121 atttctctggtcactaaattgcttggccgtatatattaccatgtggatggtgcggaaaag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1295 atttctctggtcactaaattgcttggccgtatatattaccatgtggatggtgcggaaaag 1236
Query: 181 cctgggactttacctcctaatgtatcagcagcagtaaatggtgtagcattctgtggaact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 cctgggactttacctcctaatgtatcagcagcagtaaatggtgtagcattctgtggaact 1176
Query: 241 cttgcaggccagctattttttggctggcttggcgataaaatggggcggaagaaggtctat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 cttgcaggccagctattttttggctggcttggcgataaaatggggcggaagaaggtctat 1116
Query: 301 ggtatgactcttatgcttatggtgatatgttcagttgcttcaggcctttcttttggtcat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 ggtatgactcttatgcttatggtgatatgttcagttgcttcaggcctttcttttggtcat 1056
Query: 361 aatgcaaaagcaattatgtcaactctttgtttctttcggttctggcttggttttggtatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 aatgcaaaagcaattatgtcaactctttgtttctttcggttctggcttggttttggtatc 996
Query: 421 ggaggtgattatccactttctgctacaatcatgtctgaatatgctaacaagaagactcgg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 ggaggtgattatccactttctgctacaatcatgtctgaatatgctaacaagaagactcgg 936
Query: 481 ggcgcttttattgctgctgtatttgctatgcaaggttttggaattttagcaggagggatt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 935 ggcgcttttattgctgctgtatttgctatgcaaggttttggaattttagcaggagggatt 876
Query: 541 tttgctataattatatcatctgcatttcgcgctaggtttgatgctccagcttatcaggat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 875 tttgctataattatatcatctgcatttcgcgctaggtttgatgctccagcttatcaggat 816
Query: 601 gatgcagttgcctcaactgttccacaagcagattacatttggcgtataattctaatggtt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 815 gatgcagttgcctcaactgttccacaagcagattacatttggcgtataattctaatggtt 756
Query: 661 ggagcacttcctgctgctcttacttactattggagaatgaaaatgcctgaaactgctcgt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 ggagcacttcctgctgctcttacttactattggagaatgaaaatgcctgaaactgctcgt 696
Query: 721 tacactgcccttgtagccaagaatgcaaaacaggctgcttctgatatgtcaaaagtttta 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 tacactgcccttgtagccaagaatgcaaaacaggctgcttctgatatgtcaaaagtttta 636
Query: 781 caagttgatcttgaagcggaagagcataaagttcagcaactttctcaggatcaatccaat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 caagttgatcttgaagcggaagagcataaagttcagcaactttctcaggatcaatccaat 576
Query: 841 tcttttggtcttttctcgaaaaagtttcttcatcggcacggacttcacttacttgggaca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 tcttttggtcttttctcgaaaaagtttcttcatcggcacggacttcacttacttgggaca 516
Query: 901 acaactacatggttcttgcttgacattgcattttacagtcaaaatctttttcaaaaggat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 acaactacatggttcttgcttgacattgcattttacagtcaaaatctttttcaaaaggat 456
Query: 961 atctttagtgccattgggtggattcctcctgcaaaaacaatgaatgctattgaagaagtt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 atctttagtgccattgggtggattcctcctgcaaaaacaatgaatgctattgaagaagtt 396
Query: 1021 tatagaattgcaagagcacaaaccctcatcgctctatgcagtacagttcccggctactgg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 tatagaattgcaagagcacaaaccctcatcgctctatgcagtacagttcccggctactgg 336
Query: 1081 tttactgtagctctcattgacaaaattggaagattcgcaattcagttgatgggattcttt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 tttactgtagctctcattgacaaaattggaagattcgcaattcagttgatgggattcttt 276
Query: 1141 ttcatgacagtttttatgtttgcattagctattccttacgatcactggacacataaggaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 ttcatgacagtttttatgtttgcattagctattccttacgatcactggacacataaggaa 216
Query: 1201 aaccgaattggatttgtggtaatgtactcattaacattcttctttgctaactttggacct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 aaccgaattggatttgtggtaatgtactcattaacattcttctttgctaactttggacct 156
Query: 1261 aatgcaactacatttgttgttccggccgagattgtcccagcaagattaaggtctac 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 aatgcaactacatttgttgttccggccgagattttcccagcaagattaaggtctac 100