Jatropha Genome Database
- JcCA0270371.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0270371.10 - phase: 0
(1467 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03571 1707 0.0
KJC_s15080 365 e-100
>KJC_c03571
Length = 888
Score = 1707 bits (861), Expect = 0.0
Identities = 885/889 (99%), Gaps = 3/889 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 137 agttcaaccacagatgtctaa-tccggtctagaggaccggtttccgtgaagggtttgccg 195
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agttcaaccacagatgtctaagtccggtctagaggaccggtttccgtgaagggtttgccg 60
Query: 196 gattttcgatttgagactattccggacggtctgccggtgccaccagatgattatgatgcc 255
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gattttcgatttgagactataccggacggtctgccggtgccaccagatgattatgatgcc 120
Query: 256 acacaagatgttccttccttgtgcgatgcaactagaaagaattgtttagctccatttaaa 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 acacaagatgttccttccttgtgcgatgcaactagaaagaattgtttagctccatttaaa 180
Query: 316 gagttaatcaacaagttaaatttattatctcataatagtgatgatgtgcctcatgttagt 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gagttaatcaacaagttaaatttattatctcataatagtgatgatgtgcctcatgttagt 240
Query: 376 tgtataatttcagatggtgttatgagttttggaatcaaagctggagaggagttaaatata 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgtataatttcagatggtgttatgagttttggaatcaaagctggagaggagttaaatata 300
Query: 436 cctcaggttcagttttggactgcctcagcttgcagtttcatgggttatttacactttagt 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cctcaggttcagttttggactgcctcagcttgcagtttcatgggttatttacactttagt 360
Query: 496 gaactcagaagaagaggcctcgtcccacatcaagttgagaatttcctctgcaatgacatt 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaactcagaagaagaggcctcgtcccacatcaagttgagaatttcctctgcaatgacatt 420
Query: 556 agtaaaacccccattgattggatccctgggatgactaacatccagttaaaggacatgcca 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agtaaaacccccattgattggatccctgggatgactaacatccagttaaaggacatgcca 480
Query: 616 acatttatcagaaccacaaatgatgaactaatgtttgatttcatgggatcagaggcagaa 675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 acatttatcagaaccacaaatgatgaactaatgtttgatttcatgggatcagaggcag-a 539
Query: 676 aactgcttgaactcttgtgcaattatcttcaacacattccacgaattcgaaaatgaagtt 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 aactgcttgaactcttgtgcaattatcttcaacacattccacgaattcgaaaatgaagtt 599
Query: 736 ttacgagctatagttgatcacaagttccctaacatttatactataggccctctccctttg 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 ttacgagctatagttgatcacaagttccctaacatttatactataggccctctccctttg 659
Query: 796 cttgaaaagcaaatccaagaaaatgaactcaactcagtaaaatcaagtttgtggaaagaa 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 cttgaaaagcaaatccaagaaaatgaactcaactcagtaaaatcaagtttgtggaaagaa 719
Query: 856 gattcgaattgcctaaaatggttagataaaagagaagctaaatctgttgtgtatgtaaat 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 gattcgaattgcctaaaatggttagataaaagagaagctaaatctgttgtgtatgtaaat 779
Query: 916 tatggtagtgtggctatgatgacagataaagactt-aaaagagtttgcttggggtcttgc 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 tatggtagtgtggctatgatgacagataaagacttaaaaagagtttgcttggggtcttgc 839
Query: 975 aaatagcagacacccatttttatggattattaggccagatgtagttatg 1023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 aaatagcagacacccatttttatggattattaggccagatgtagttatg 888
>KJC_s15080
Length = 543
Score = 365 bits (184), Expect = e-100
Identities = 221/228 (96%), Gaps = 4/228 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 352 agtgatgatgtgcctcatgttagttgtataatttcagatggtgttat-gagtttt-ggaa 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 541 agtgatgatgtgcctcatgttagttgtataatttcagatggtgttattgagtttttggaa 482
Query: 410 tcaaagctggagaggagtt-aaatatacctcaggttcagtttt-ggactgcctcagcttg 467
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 481 tcaaagctggagaggagtttaaatatacctcaggttcagtttttggactgcctcagcttg 422
Query: 468 cagtttcatgggttatttacactttagtgaactcagaagaagaggcctcgtcccacatca 527
||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cagtttcatgggttatttacactatagtgaactaaaaagaagaggcctcgtcccacatca 362
Query: 528 agttgagaatttcctctgcaatgacattagtaaaacccccattgattg 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 agttgagaatttcctctgcaatgacattagtaaaacccccattgattg 314
Score = 137 bits (69), Expect = 9e-32
Identities = 81/85 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 22 aaaaagcctcacatcgtatgtgtcccatatccatcacaaggccatgtgaccccaatgatg 81
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 236 aaaaaacctcacattgtatgtgtcccatatccatcacaaggccatgtaaccccaatgatg 295
Query: 82 caactggccaagcttttacactcaa 106
|||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 296 caactggccaagcttttacaatcaa 320