Jatropha Genome Database
- JcCA0267991.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0267991.10 - phase: 0 /partial
(1104 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03290 2125 0.0
>KJC_c03290
Length = 1391
Score = 2125 bits (1072), Expect = 0.0
Identities = 1096/1105 (99%), Gaps = 1/1105 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagagttcaaaacagaataaacagcaacagttcgttttggcatcgataaccgagcta 60
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Sbjct: 170 atggagagttcaaaacagaataaacagcaacagttcgttttggcatcgataaccgagcta 229
Query: 61 tcttctagttcttcttcttctttagctgcttcatctttgccagtggtcgctaggtttagc 120
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Query: 121 gctgataatggagtagtggagcttcgatttcttcacgactctaacgctactgattttatt 180
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Sbjct: 290 gctgataatggagtagtggagcttcgatttcttcacgactctaacgctactgattttatt 349
Query: 181 aatgtcgatcttagtactgctcagttattcaagctaggacccgatcaatcagtttgcata 240
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Sbjct: 350 aatgtcgatcttagtactgctcagttattcaagctaggacccgatcaatcagtttgcata 409
Query: 241 gctgaaggtctagaatctgatagcaacaaagagaaatattcaagaggaatcactatccaa 300
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Query: 301 tttagaaatgaggaggagagcaggaccttccattgtgcatttgagcaatggaagaacgaa 360
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Query: 361 gtcattgttcaaggaacaactttaccgaatggagcactcacagctcctaaaagcaagttt 420
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Query: 421 gattacaaaatagagccgtcatcagccaaaatgtatttccattattatggacaattacta 480
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Sbjct: 590 gattacaaaatagagccgtcatcagccaaaatgtatttccattattatggacaattacta 649
Query: 481 catcagcaaaatatgctacaggattatgtgaggacaggaacctattatgctgctgtcatt 540
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Sbjct: 650 catcagcaaaatatgctacaggattatgtgaggacaggaacctattatgctgctgtcatt 709
Query: 541 gagaaccgtgcag-annnnnnnggtcgtgttgttgttgatgttggtgctggtagtggcat 599
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Query: 600 tttgtctttatttgctgctcaggctggtgcaaagcatgtttatgctgtggaagcatctga 659
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Query: 660 aatggcagaatacgcccgcaaactaattgctgggaacccatcgctgggagaaaggattac 719
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Query: 720 agtaataaagggtaaagttgaggaagttgaattgccagagaaagcagatattatgatctc 779
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Query: 780 tgaaccgatgggcaccctattagtcaatgaaagaatgttagagtcctatgtgatagcaag 839
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Query: 840 agaccgatttcttcatcccaatggaaaaatgttccctacggttggaagaattcatatggc 899
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Query: 900 gcctttcagtgatgaatatttgtttgttgaaattgctaataaggcgctcttttggcagca 959
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Query: 1020 ttctcagcctgtagtagatgctttcgatccaaggttattggtggctcccgcaacatttca 1079
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Query: 1080 cgtcatagattttactgaaataaag 1104
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Sbjct: 1250 cgtcatagattttactgaaataaag 1274