Jatropha Genome Database
- JcCA0262721.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0262721.10 + phase: 2 /partial
(1620 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00214 3205 0.0
KJC_c02455 416 e-116
KJC_c01899 220 8e-57
KJC_c08836 167 1e-40
>KJC_c00214
Length = 2417
Score = 3205 bits (1617), Expect = 0.0
Identities = 1617/1617 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ccatttcattgtccctgaattgggacctgatgtcaaattctcttatgcttctcacaaggc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 ccatttcattgtccctgaattgggacctgatgtcaaattctcttatgcttctcacaaggc 489
Query: 61 agtgactgaatacaaggaggccaaggcgctcggaatagatacagttcctgtccttgttgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 agtgactgaatacaaggaggccaaggcgctcggaatagatacagttcctgtccttgttgg 549
Query: 121 ccctgtctcttacttgttactttctaaacctgctaagggtgtggagaaaaccttttctct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 ccctgtctcttacttgttactttctaaacctgctaagggtgtggagaaaaccttttctct 609
Query: 181 tctctcccttcttggaaagatccttccagtctacaaggaggttatttcagagcttaaaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 tctctcccttcttggaaagatccttccagtctacaaggaggttatttcagagcttaaaga 669
Query: 241 agctggtgcatcctggattcagtttgacgagcctacgcttgttatggaccttgattctca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 agctggtgcatcctggattcagtttgacgagcctacgcttgttatggaccttgattctca 729
Query: 301 caaattgcaagcatttactgatgcctactctgagcttgagtcaactctatccggcttgaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 caaattgcaagcatttactgatgcctactctgagcttgagtcaactctatccggcttgaa 789
Query: 361 tgttgttgtcgagacctactttgctgatgtacctgctgaggcattcaagaccctcacatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790 tgttgttgtcgagacctactttgctgatgtacctgctgaggcattcaagaccctcacatc 849
Query: 421 tttgaagggtgtcactggatatggttttgatttggttcgtggaactaaaactcttgactt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 tttgaagggtgtcactggatatggttttgatttggttcgtggaactaaaactcttgactt 909
Query: 481 gatcaagagtgatttccccaaggggaaatacctatttgctggagtggttgatggaaggaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910 gatcaagagtgatttccccaaggggaaatacctatttgctggagtggttgatggaaggaa 969
Query: 541 catctgggccaatgatcttgcttcttctctcagcacccttcaggaacttgagggcattgt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 970 catctgggccaatgatcttgcttcttctctcagcacccttcaggaacttgagggcattgt 1029
Query: 601 tggcaaagacaaacttgtagtctccacctcttcctcacttctgcacactgctgttgatct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1030 tggcaaagacaaacttgtagtctccacctcttcctcacttctgcacactgctgttgatct 1089
Query: 661 cgtcaatgagaccaagttggaccaggaaatcaaatcatggcttgcatttgctgcccagaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1090 cgtcaatgagaccaagttggaccaggaaatcaaatcatggcttgcatttgctgcccagaa 1149
Query: 721 agttgttgaagtgaatgcattggccaaggccttggctggtgaaaaggatgaggctttctt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1150 agttgttgaagtgaatgcattggccaaggccttggctggtgaaaaggatgaggctttctt 1209
Query: 781 ctctgctaatgcagctgctcaggcctcaaggaagtcctccccaagagtgaccaatgaggc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1210 ctctgctaatgcagctgctcaggcctcaaggaagtcctccccaagagtgaccaatgaggc 1269
Query: 841 tgttcaaaaggcggctgctgctttgagaggttctgaccaccgccgggctacaaatgttag 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1270 tgttcaaaaggcggctgctgctttgagaggttctgaccaccgccgggctacaaatgttag 1329
Query: 901 tgctagactagatgctcaacagaagaagcttaatctcccaatcctcccaactacaactat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1330 tgctagactagatgctcaacagaagaagcttaatctcccaatcctcccaactacaactat 1389
Query: 961 tgggtccttcccacagaccatcgaactcaggagagttcgccgtgaatacaaagcaaaaaa 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1390 tgggtccttcccacagaccatcgaactcaggagagttcgccgtgaatacaaagcaaaaaa 1449
Query: 1021 gatctctgaagaggaatacactaaagctatcaaggcggaaattaacaaagttgtcaaact 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1450 gatctctgaagaggaatacactaaagctatcaaggcggaaattaacaaagttgtcaaact 1509
Query: 1081 ccaagaggaacttgatattgatgttctcgtccatggggagcctgagaggaatgatatggt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1510 ccaagaggaacttgatattgatgttctcgtccatggggagcctgagaggaatgatatggt 1569
Query: 1141 tgaatactttggagagcagttgtcaggttttgtcttcacagtcaatggatgggtgcaatc 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1570 tgaatactttggagagcagttgtcaggttttgtcttcacagtcaatggatgggtgcaatc 1629
Query: 1201 ctatggatcacggtgtgtgaagccaccaatcatctatggtgatgtgagccgccccaaccc 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1630 ctatggatcacggtgtgtgaagccaccaatcatctatggtgatgtgagccgccccaaccc 1689
Query: 1261 aatgactgttttctggtcctctacagctcagagcatgactgcccgcccaatgaagggaat 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1690 aatgactgttttctggtcctctacagctcagagcatgactgcccgcccaatgaagggaat 1749
Query: 1321 gcttacaggccctgtaaccattctcaactggtcctttgtcaggaatgaccagcccagatt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1750 gcttacaggccctgtaaccattctcaactggtcctttgtcaggaatgaccagcccagatt 1809
Query: 1381 tgagacatgctatcagatcgctttggcaattaaggatgaagtggaggatcttgagaaggc 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1810 tgagacatgctatcagatcgctttggcaattaaggatgaagtggaggatcttgagaaggc 1869
Query: 1441 cggtatcaatgttatccaaattgacgaggctgctctgagagaagggttgcctcttaggaa 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1870 cggtatcaatgttatccaaattgacgaggctgctctgagagaagggttgcctcttaggaa 1929
Query: 1501 gtctgagcaagctttctacttggactgggccgtgcactcctttagaattaccaactgcgg 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1930 gtctgagcaagctttctacttggactgggccgtgcactcctttagaattaccaactgcgg 1989
Query: 1561 agtacaagacaccacccagattcacactcacatgtgctactccaacttcaatgacat 1617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1990 agtacaagacaccacccagattcacactcacatgtgctactccaacttcaatgacat 2046
>KJC_c02455
Length = 1057
Score = 416 bits (210), Expect = e-116
Identities = 613/746 (82%), Gaps = 1/746 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 872 tctgaccaccgccgggctacaaatgttagtgctagactagatgctcaacagaagaagctt 931
||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |
Sbjct: 36 tctgaccaccgccgggccacaaatgttagtgccaggcttgatgctcaacagaagaagttg 95
Query: 932 aatctcccaatcctcccaactacaactattgggtccttcccacagaccatcgaactcagg 991
|| || ||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||| | || || |||
Sbjct: 96 aaccttccaattcttcccaccaccacaattggatctttccctcagacactggatctgagg 155
Query: 992 agagttcgccgtgaatacaaagcaaaaaagatctctgaagaggaatacactaaagctatc 1051
||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || || || |||
Sbjct: 156 agagtgcgccgtgaatacaaggctaagaagatctctgaggatgattatgtcaaggccatc 215
Query: 1052 aaggcggaaattaacaaagttgtcaaactccaagaggaacttgatattgatgttctcgtc 1111
|||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||
Sbjct: 216 aaggaggaaattagcaaagtggtcaaaatccaagaagaacttgacattgatgttttggtg 275
Query: 1112 catggggagcctgagaggaatgatatggttgaatactttggagagcagttgtcaggtttt 1171
||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||
Sbjct: 276 catggcgaaccagaaaggaatgacatggttgagtactttggtgagcaattatctggtttt 335
Query: 1172 gtcttcacagtcaatggatgggtgcaatcctatggatcacggtgtgtgaagccaccaatc 1231
| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || ||
Sbjct: 336 gccttcactgcaaatgggtgggtccagtcatatggttctcgttgtgtcaagcctcccata 395
Query: 1232 atctatggtgatgtgagccgccccaacccaatgactgttttctggtcctctacagctcag 1291
|||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | | |||||
Sbjct: 396 atctatggtgatgtgagccgccccaaggctatgaccgtcttctggtcaacaatggctcaa 455
Query: 1292 agcatgactgcccgcccaatgaagggaatgcttacaggccctgtaaccattctcaactgg 1351
||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 456 agcctgactaagcgaccaatgaagggaatgcttactggtcctgttaccattctgaactgg 515
Query: 1352 tcctttgtcaggaatgaccagcccagatttgagacatgctatcagatcgctttggcaatt 1411
||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| || || ||||| ||
Sbjct: 516 tcctttgtcagaaatgaccaacctagacatgagacatgctatcaaattgcgttggccatc 575
Query: 1412 aaggatgaagtggaggatcttgagaaggccggtatcaatgttatccaaattgacgaggct 1471
|||||||| || |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct: 576 aaggatgaggttgaggatcttgagaaagctggaatcactgtcatccagattgatgaggct 635
Query: 1472 gctctgagagaagggttgcctcttaggaagtctgagcaagctttctacttggactgggcc 1531
||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct: 636 gctttgagagagggtttgcc-ctaaggaagtctgagcatgctttctatttggattgggca 694
Query: 1532 gtgcactcctttagaattaccaactgcggagtacaagacaccacccagattcacactcac 1591
|| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||
Sbjct: 695 gttcactctttcaggattactaactgtggtgtccaagatactacacagatacacacccat 754
Query: 1592 atgtgctactccaacttcaatgacat 1617
|||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 755 atgtgctattcaaacttcaatgacat 780
>KJC_c01899
Length = 1128
Score = 220 bits (111), Expect = 8e-57
Identities = 453/567 (79%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ccatttcattgtccctgaattgggacctgatgtcaaattctcttatgcttctcacaaggc 60
||||| ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||
Sbjct: 725 ccattacattgtccctgaattaggaccagaagttaagttctcttatgcatctcataaagc 666
Query: 61 agtgactgaatacaaggaggccaaggcgctcggaatagatacagttcctgtccttgttgg 120
|| ||| |||||||||||||| || || ||||| || || || |||||| | || ||
Sbjct: 665 tgttgatgagtacaaggaggccaaagctctaggaattgaaactgtacctgtcatcgtagg 606
Query: 121 ccctgtctcttacttgttactttctaaacctgctaagggtgtggagaaaaccttttctct 180
|| || ||||| || | || || |||| || ||||||||||||||| | || |||||
Sbjct: 605 tccagtttcttatttactgctatcaaaacaagcaaagggtgtggagaaatctttctctct 546
Query: 181 tctctcccttcttggaaagatccttccagtctacaaggaggttatttcagagcttaaaga 240
||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | ||||| || ||
Sbjct: 545 tctttccctacttgacaagattcttcctgtctacaaggaagttgtgactgagctgaagga 486
Query: 241 agctggtgcatcctggattcagtttgacgagcctacgcttgttatggaccttgattctca 300
|||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |||||| ||||
Sbjct: 485 agctggtgcaagttggattcagttcgatgagcccaagcttgtcatggatcttgatgctca 426
Query: 301 caaattgcaagcatttactgatgcctactctgagcttgagtcaactctatccggcttgaa 360
| |||| |||||||||||| | || ||||| ||||| ||| |||| |||| || ||||
Sbjct: 425 cgaattacaagcatttactcaagcatactcagagctggagggaactttatctggtgtgaa 366
Query: 361 tgttgttgtcgagacctactttgctgatgtacctgctgaggcattcaagaccctcacatc 420
||| | | ||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||| || ||||||||
Sbjct: 365 cgttttgattgagacatactttgctgacattccagctgaggcatacaaaactctcacatc 306
Query: 421 tttgaagggtgtcactggatatggttttgatttggttcgtggaactaaaactcttgactt 480
| |||||||||| | ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct: 305 tctgaagggtgttagtggatttgggtttgatctagttcgtgggactaagacccttgattt 246
Query: 481 gatcaagagtgatttccccaaggggaaatacctatttgctggagtggttgatggaaggaa 540
|| ||| ||| ||||| | || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 245 aattaagggtggattccctacaggcaaattcctctttgctggagtagttgatggaaggaa 186
Query: 541 catctgggccaatgatcttgcttcttc 567
||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct: 185 catttgggctaatgatctcgcttcttc 159
>KJC_c08836
Length = 382
Score = 167 bits (84), Expect = 1e-40
Identities = 222/268 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 762 aaaaggatgaggctttcttctctgctaatgcagctgctcaggcctcaaggaagtcctccc 821
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||| |
Sbjct: 4 aaaaggatgaggctttcttctcttccaatgcgttagctcaggcttcaagaaaatcctctc 63
Query: 822 caagagtgaccaatgaggctgttcaaaaggcggctgctgctttgagaggttctgaccacc 881
| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct: 64 ctagggtcacaaatgaggctgttcagaaggctgctgctgccttgaagggatctgaccacc 123
Query: 882 gccgggctacaaatgttagtgctagactagatgctcaacagaagaagcttaatctcccaa 941
||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || || ||||
Sbjct: 124 gccgggccacaaatgttagtgccaggcttgatgctcaacagaagaagttgaaccttccaa 183
Query: 942 tcctcccaactacaactattgggtccttcccacagaccatcgaactcaggagagttcgcc 1001
| || || || || || ||||| || ||||| ||||| | || || |||||||| ||||
Sbjct: 184 ttcttcccaccaccacaattggatctttccctcagacactggatctgaggagagtgcgcc 243
Query: 1002 gtgaatacaaagcaaaaaagatctctga 1029
|||||||||| || || |||||||||||
Sbjct: 244 gtgaatacaaggctaagaagatctctga 271