Jatropha Genome Database
- JcCA0261941.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0261941.10 + phase: 1 /partial
(818 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02404 1392 0.0
>KJC_c02404
Length = 1811
Score = 1392 bits (702), Expect = 0.0
Identities = 716/718 (99%), Gaps = 2/718 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agttcaacaaaattgaacaggagctggaaagattatctcaaaagtttggggagaacgtgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 agttcaacaaaattgaacaggagctggaaagattatctcaaaagtttggggagaacgtgt 566
Query: 61 tagatgcaacaaagaagtttgaaaaactcattacagacgagaaggaaattgaagggttgc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 tagatgcaacaaagaagtttgaaaaactcattacagacgagaaggaaattgaagggttgc 626
Query: 121 ctgcaacatcacttgcattggctgcacagacagccgcgtctaaggggcataaagatgcaa 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 627 ctgcaacatcacttgcattggctgcacagacagccgcgtctaaggg-cataaagatgcaa 685
Query: 181 cagctgagaatggaccttgggtgattacattggatggccctagttttatgtctgtcatgc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 686 cagctgagaatggaccttgggtgattacattggatggccctagttttatgtctgtcatgc 745
Query: 241 aacatgctcgaaaccgtgatttgcgtgaagaagtctaccgtgcttatgtaactcgtgctt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 746 aacatgctcgaaaccgtgatttgcgtgaagaagtctaccgtgcttatgtaactcgtgctt 805
Query: 301 cgagcggtgatctggataatacaccaattatcgaccaaatagtaaagcttagactggaaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806 cgagcggtgatctggataatacaccaattatcgaccaaatagtaaagcttagactggaaa 865
Query: 361 aggctaagcttctcaattacaacaactatgctgaggtaagcatggcaacaaaaatggcaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 866 aggctaagcttctcaattacaacaactatgctgaggtaagcatggcaacaaaaatggcaa 925
Query: 421 ctgttgagaaggcagaagagctcttagaaaagctgcgctcagcttcctgggatgctgcag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 926 ctgttgagaaggcagaagagctcttagaaaagctgcgctcagcttcctgggatgctgcag 985
Query: 481 tccgagatatggaagaccttaaaattttctccaaaaatcaaggtgcagtagaagcaaatg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 986 tccgagatatggaagaccttaaaattttctccaaaaatcaaggtgcagtagaagcaaatg 1045
Query: 541 atttgagccactgggacataagcttttgggctgagaggcttcgcgagtcaagatatgata 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 atttgagccactgggacataagcttttgggctgagaggcttcgcgagtcaagatatgata 1105
Query: 601 tcaatgaggaagaacttcggccatatttctcattgccaaaggttatggatgggcttttca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1106 tcaatgaggaagaacttcggccatatttctcattgccaaaggttatggatgggcttttca 1165
Query: 661 acctcgcaaagaatctttttggaattgatattgaaccagctgatggtttagcacctgt 718
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1166 acctcgcaaag-atctttttggaattgatattgaaccagctgatggtttagcacctgt 1222