Jatropha Genome Database
- JcCA0261901.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0261901.10 - phase: 2 /pseudo/partial
(1084 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02670 1451 0.0
KJC_c02715 563 e-160
>KJC_c02670
Length = 1191
Score = 1451 bits (732), Expect = 0.0
Identities = 742/744 (99%), Gaps = 1/744 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 297 acgatcctctcctcattgagtgggttaaatactccagcaaccctgttctagtccctcctc 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 acgatcctctcctcattgagtgggttaaatactccagcaaccctgttctagtccctcctc 130
Query: 357 caggaattggtataaaggatttccgggatccgacaactgcttggtatacttctgaaggga 416
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 caggaattggtataaaggatttccgggatccgacaactgcttggtatacttctgaagggg 190
Query: 417 aatggaggattactatagggtctaaagttggtaaaactggaatagctttaatttatgata 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 aatggaggattactatagggtctaaagttggtaaaactggaatagctttaatttatgata 250
Query: 477 ctgttgattttataaattatgagttgcgtaatcaggttcttcatggtgtccctggaactg 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 ctgttgattttataaattatgagttgcgtaatcaggttcttcatggtgtccctggaactg 310
Query: 537 gtatgtgggaatgcgtagacttttatcctgtgtcgatttatgaccgaaatggattggaaa 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 gtatgtgggaatgcgtagacttttatcctgtgtcgatttatgaccgaaatggattggaaa 370
Query: 597 cctcagctaatggtcctgaagtgaaacatgttgtcaaggcaagtcttgatgatgatagac 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 cctcagctaatggtcctgaagtgaaacatgttgtcaaggcaagtcttgatgatgatagac 430
Query: 657 atgattattatgcccttggaacttatgatgacaagaatgctacttggtatcctgatattc 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 atgattattatgcccttggaacttatgatgacaagaatgctacttggtatcctgatattc 490
Query: 717 cagaaattgatgttggtattggtcttagatatgattatggtatattctatgcttccaaga 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 cagaaattgatgttggtattggtcttagatatgattatggtatattctatgcttccaaga 550
Query: 777 cattttatgatcagcacagagggagaagagtgttgtggggttggattggtgagtctgata 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 cattttatgatcagcacagagggagaagagtgttgtggggttggattggtgagtctgata 610
Query: 837 gtgaagctgctgatgttaagaaaggatgggcttctcttcagggtattccgaggacagttg 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 gtgaagctgctgatgttaagaaaggatgggcttctcttcagggtattccgaggacagttg 670
Query: 897 cttttgacacaaagagtggcagcaatttgcttcagtggccagtcgaagaagtagagaatt 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 cttttgacacaaagagtggcagcaatttgcttcagtggccagtcgaagaagtagagaatt 730
Query: 957 tgagattaagaagcaaagaattcaagaacgtagaggtcaagccagggt-cagttgtgcct 1015
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 731 tgagattaagaagcaaagaattcaagaacgtagaggtcaagccagggtccagttgtgcct 790
Query: 1016 ctagatcttgaagcagctacacag 1039
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 ctagatcttgaagcagctacacag 814
Score = 143 bits (72), Expect = 1e-33
Identities = 72/72 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 227 gtaatgctatacactgggtccaccaatgaatctgttcaagtccagaatcttgcatatcca 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72 gtaatgctatacactgggtccaccaatgaatctgttcaagtccagaatcttgcatatcca 13
Query: 287 gcagaccataac 298
||||||||||||
Sbjct: 12 gcagaccataac 1
>KJC_c02715
Length = 736
Score = 563 bits (284), Expect = e-160
Identities = 284/284 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 20 ggtccattattttacaagggctggtaccatttcttctaccagtacaatccagatgcagcc 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 ggtccattattttacaagggctggtaccatttcttctaccagtacaatccagatgcagcc 512
Query: 80 gtttggggtaacatagtttggggtcatgcagtgtcaaaagatttaatccattggcttcac 139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 513 gtttggggtaacatagtttggggtcatgcagtgtcaaaagatttaatccattggcttcac 572
Query: 140 ctcccattagcaatggttgcagaccaatggtatgacatcaatggtgtttggactggctct 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 573 ctcccattagcaatggttgcagaccaatggtatgacatcaatggtgtttggactggctct 632
Query: 200 gccacaattctgccagatggtaaaattgtaatgctatacactgggtccaccaatgaatct 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 633 gccacaattctgccagatggtaaaattgtaatgctatacactgggtccaccaatgaatct 692
Query: 260 gttcaagtccagaatcttgcatatccagcagaccataacgatcc 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 693 gttcaagtccagaatcttgcatatccagcagaccataacgatcc 736