Jatropha Genome Database
- JcCA0240561.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0240561.10 - phase: 1 /partial
(1251 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03187 2107 0.0
KJC_s18559 620 e-177
>KJC_c03187
Length = 1428
Score = 2107 bits (1063), Expect = 0.0
Identities = 1105/1111 (99%), Gaps = 6/1111 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 32 ggttctaaagaacttctgcaaaagttgggtgtatactgttagttctgaggtgccatcatc 91
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1105 ggttctaaagaacttctgcaaaagttgg-tgtatactgttagttctgaggtgccatcatc 1047
Query: 92 aaatttctgtttggctttcttttcaaatatggctggagactccaaggcgagcctttcaaa 151
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 aaatttctgtttggctttcttt-caaatatggctggagactccaaggcgagcctttcaaa 988
Query: 152 tggcactgctaatatacagtctgatccaagaagaacgtaccaagttgttgtggctgctac 211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 987 tggcactgctaatatacagtctgatccaagaagaacgtaccaagttgttgtggctgctac 928
Query: 212 tagggacatgggtattggaaaagaagggaagttgccatggagattgccttctgatctcaa 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 tagggacatgggtattggaaaagaagggaagttgccatggagattgccttctgatctcaa 868
Query: 272 attcttcaaggatgttactctgactacttctgattctggaagaaagaatgcagtaataat 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 attcttcaaggatgttactctgactacttctgattctggaagaaagaatgcagtaataat 808
Query: 332 gggtagaaaaacatgggaaagtattccacttgagcatcgtcctcttcctggtcgccttaa 391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 gggtagaaaaacatgggaaagtattccacttgagcatcgtcctcttcctggtcgccttaa 748
Query: 392 tgttgttctgactcgatctgggagttttgatattgctactgctgagaatgtagtgatatg 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 tgttgttctgactcgatctgggagttttgatattgctactgctgagaatgtagtgatatg 688
Query: 452 tggaagcttaacttctgctctggaattattggctgcatctccttactgcctatcaattga 511
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 tggaagcttaacttctgctctggaattat-ggctgcatctccttactgcctatcaattga 629
Query: 512 gaaagtctttatcattggaggtggccaaatattaagggaatctctcaacgcacctgggtg 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 gaaagtctttatcattggaggtggccaaatattaagggaatctctcaacgcacctgggtg 569
Query: 572 tgatgctatccacatcacagaaatcgagacaagcattgattgtgatacttttatccctaa 631
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 568 tgatgctatccacatcacagaaatcgagacaagcat-gattgtgatacttt-atccctaa 511
Query: 632 aattgattcttctgtctttcaaccttggtattcatcctttcccattgtagaaaacaatgt 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510 aattgattcttctgtctttcaaccttggtattcatcctttcccattgtagaaaacaatgt 451
Query: 692 aagatattgctttgcaacttatgtacgagtgagggtttctgcggttgagtcccatggtca 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450 aagatattgctttgcaacttatgtacgagtgagggtttctgcggttgagtcccatggtca 391
Query: 752 agataatggtctgagctctgataatagttacattaagtttgaggtaaagaagttctcttt 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390 agataatggtctgagctctgataatagttacattaagtttgaggtaaagaagttctcttt 331
Query: 812 ccttccaaagatggtttttgagagacatgaggagttcttgtacctgagacttgtccaaga 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 ccttccaaagatggtttttgagagacatgaggagttcttgtacctgagacttgtccaaga 271
Query: 872 cattatctcagatggcaatttgaaggatgacagaaccggaactggtactttgtccaagtt 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270 cattatctcagatggcaatttgaaggatgacagaaccggaactggtactttgtccaagtt 211
Query: 932 tggatgccagatgcggttcaatttgcgtagaacttttccgctgctgacaacaaagaaagt 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210 tggatgccagatgcggttcaatttgcgtagaacttttccgctgctgacaacaaagaaagt 151
Query: 992 attctggagaggggttgttgaagaacttctgtggttcattagtggctcaacaaattgcaa 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150 attctggagaggggttgttgaagaacttctgtggttcattagtggctcaacaaattgcaa 91
Query: 1052 ggtccttcaggaaaagggcattcatatatgggacggcaatgcatccagagattaccttga 1111
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 90 ggtccttcagg-aaagggcattcatatatgggacggcaatgcatccagagattaccttga 32
Query: 1112 tggtattgggttgaaggacagggaggagggt 1142
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 31 tggtattgggttgaaggacagggaggagggt 1
>KJC_s18559
Length = 516
Score = 620 bits (313), Expect = e-177
Identities = 320/321 (99%), Gaps = 1/321 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 228 ggaaaagaagggaagttgccatggagattgccttctgatctcaaattcttcaaggatgtt 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggaaaagaagggaagttgccatggagattgccttctgatctcaaattcttcaaggatgtt 60
Query: 288 actctgactacttctgattctggaagaaagaatgcagtaataatgggtagaaaaacatgg 347
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 61 actctgactacttctgattctggaagaaagaatgcagtaataatgggtagaaaa-catgg 119
Query: 348 gaaagtattccacttgagcatcgtcctcttcctggtcgccttaatgttgttctgactcga 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 gaaagtattccacttgagcatcgtcctcttcctggtcgccttaatgttgttctgactcga 179
Query: 408 tctgggagttttgatattgctactgctgagaatgtagtgatatgtggaagcttaacttct 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 tctgggagttttgatattgctactgctgagaatgtagtgatatgtggaagcttaacttct 239
Query: 468 gctctggaattattggctgcatctccttactgcctatcaattgagaaagtctttatcatt 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 gctctggaattattggctgcatctccttactgcctatcaattgagaaagtctttatcatt 299
Query: 528 ggaggtggccaaatattaagg 548
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ggaggtggccaaatattaagg 320
Score = 222 bits (112), Expect = 2e-57
Identities = 119/120 (99%), Gaps = 1/120 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 546 agggaatctctcaacgcacctgggtgtgatgctatccacatcacagaaatcgagacaagc 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 397 agggaatctctcaacgcacctgggtgtgatgctatccacatcacagaaatcgagacaagc 456
Query: 606 attgattgtga-tacttttatccctaaaattgattcttctgtctttcaaccttggtattc 664
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 457 attgattgtgattacttttatccctaaaattgattcttctgtctttcaaccttggtattc 516