Jatropha Genome Database
- JcCA0237741.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0237741.10 - phase: 0 /pseudo/partial
(1373 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c08716 1364 0.0
>KJC_c08716
Length = 712
Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0
Identities = 704/712 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 55 attaatggtcgtgcaccataccatgacaaatcatgcagcttctacaatcgattgtcacag 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 attaatggtcgtgcaccataccatgacaaatcatgcagcttctacaatcgattgtcacag 653
Query: 115 agattatctgatgcatctattgttcttgatttatttgcttgttctcttgatcaagtaggg 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 agattatctgatgcatctattgttcttgatttatttgcttgttctcttgatcaagtaggg 593
Query: 175 gtggcggagctaaaagccccagttgagaggtcaggtggattcatgatgttaggagagtta 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 gtggcggagctaaaagccccagttgagaggtcaggtggattcatgatgttaggagagtta 533
Query: 235 tttgagtcagatcaattcaggaaatgcttgaggcacatttttagtcggggtgaagatggg 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tttgagtcagatcaattcaggaaatgcttgaggcacatttttagtcggggtgaagatggg 473
Query: 295 agtttgaagatgtattttgatgcaactattgaggtgatcaccacaagagatgtaaaaatc 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 agtttgaagatgtattttgatgcaactattgaggtgatcaccacaagagatgtaaaaatc 413
Query: 355 tgtggagcacttggaccttgtgtttctcttcatnnnnnnnntgacttagtgagtgatcgt 414
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 412 tgtggagcacttggaccttgtgtttctcttcataaaaaaaatgacttagtgagtgatcgt 353
Query: 415 gaaactgggcagggtggcacgtatgcatggaaattgggcacactaacgaataaaacatgc 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 gaaactgggcagggtggcacgtatgcatggaaattgggcacactaacgaataaaacatgc 293
Query: 475 atagctttcttcttcgaagtaggcgatgaacagaaggcgcatcctgggtctgcatttttt 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 atagctttcttcttcgaagtaggcgatgaacagaaggcgcatcctgggtctgcatttttt 233
Query: 535 atacaatttataacacgataccgacatggaaacatgggaatccagaaaagagttacaaca 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 atacaatttataacacgataccgacatggaaacatgggaatccagaaaagagttacaaca 173
Query: 595 gctgcaagaagatgggttggaaacaagtcagcagaaatcactgctggttttgatcaggaa 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 gctgcaagaagatgggttggaaacaagtcagcagaaatcactgctggttttgatcaggaa 113
Query: 655 gcagcagcttcagtcatggcaagacttgccattcaccgagcagagacatgttatgctcga 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 gcagcagcttcagtcatggcaagacttgccattcaccgagcagagacatgttatgctcga 53
Query: 715 gatgtcatcagatggttagatgacaaccttattcgttttgcttctaagtttg 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 gatgtcatcagatggttagatgacaaccttattcgttttgcttctaagtttg 1