Jatropha Genome Database
- JcCA0229931.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0229931.10 - phase: 1 /partial
(1800 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01056 3352 0.0
KJC_s14264 702 0.0
KJC_c10758 66 3e-10
>KJC_c01056
Length = 2426
Score = 3352 bits (1691), Expect = 0.0
Identities = 1698/1699 (99%), Gaps = 1/1699 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 103 atttccttcagcatatttctggctttctttccttccgttctactataccggattctgttt 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2426 atttccttcagcatatttctggctttctttccttccgttctactataccggattctgttt 2367
Query: 163 atggaatgacggactatcgaatagcatcgacgatgaatctgtggacagacgataactcat 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2366 atggaatgacggactatcgaatagcatcgacgatgaatctgtggacagacgataactcat 2307
Query: 223 ccgtcatggaagctttcatgaactcggatctctcggctctctggccgccgccgcagtcgg 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2306 ccgtcatggaagctttcatgaactcggatctctcggctctctggccgccgccgcagtcgg 2247
Query: 283 ctgcttccacttctacccctgcgccaccaagcgccgaccccaacaagactgtaatcaacc 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2246 ctgcttccacttctacccctgcgccaccaagcgccgaccccaacaagactgtaatcaacc 2187
Query: 343 aatctcagcctatctttaatcaggaaacgctgcagcagcgactcctgaccttgatcgaag 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2186 aatctcagcctatctttaatcaggaaacgctgcagcagcgactcctgaccttgatcgaag 2127
Query: 403 gggccagagagagctggacctacgctatattttggcaatcgtcgtatgattataacggtt 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2126 gggccagagagagctggacctacgctatattttggcaatcgtcgtatgattataacggtt 2067
Query: 463 cggtgctaggttggggtgatggg-tactacaaaggagaggaggataaaggcaaaggcaaa 521
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2066 cggtgctaggttggggtgatggggtactacaaaggagaggaggataaaggcaaaggcaaa 2007
Query: 522 tctaaaagtacgagttcttctgctgtagagcaggagcaccgtaagaaggtgctccgcgag 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2006 tctaaaagtacgagttcttctgctgtagagcaggagcaccgtaagaaggtgctccgcgag 1947
Query: 582 cttaattcgttgatctcaggttctaatacggtcaccgacgatgcggttgatgaagaagtc 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1946 cttaattcgttgatctcaggttctaatacggtcaccgacgatgcggttgatgaagaagtc 1887
Query: 642 actgatactgagtggttctttcttgtttccatgactcaatcatttgttaatggaggtggg 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1886 actgatactgagtggttctttcttgtttccatgactcaatcatttgttaatggaggtggg 1827
Query: 702 cttccgggtcatgctttcttcaatgggagtccggtctgggttgctgggtctgaccggtta 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1826 cttccgggtcatgctttcttcaatgggagtccggtctgggttgctgggtctgaccggtta 1767
Query: 762 tctgcatcgccatgtgagcgggctagacaaggtcaagtttttgggttacagacgttggtt 821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1766 tctgcatcgccatgtgagcgggctagacaaggtcaagtttttgggttacagacgttggtt 1707
Query: 822 tgtatcccatcggcaaatggagttgtcgaacttggttcaacggagctgatttatcaaagc 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1706 tgtatcccatcggcaaatggagttgtcgaacttggttcaacggagctgatttatcaaagc 1647
Query: 882 tcggatctgatgaataaggttagggttctgtttaatttcaatagtgttgaggtgggttca 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1646 tcggatctgatgaataaggttagggttctgtttaatttcaatagtgttgaggtgggttca 1587
Query: 942 tggccgatgggagcaaatcctgaccagggggagaacgatacttcctctctttggatcagt 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1586 tggccgatgggagcaaatcctgaccagggggagaacgatacttcctctctttggatcagt 1527
Query: 1002 gatccatcgcaaagtgggattgagatgaaagatggaaatagtacagttccatcatcagtt 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1526 gatccatcgcaaagtgggattgagatgaaagatggaaatagtacagttccatcatcagtt 1467
Query: 1062 tgcaataatactaacaatagcaataaccagaatggctcgaaaggaattccgttgggaaat 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1466 tgcaataatactaacaatagcaataaccagaatggctcgaaaggaattccgttgggaaat 1407
Query: 1122 cccaattcgagcagcttaactgagacccctaatatgcaacaaaatcaccagcagcaaaat 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1406 cccaattcgagcagcttaactgagacccctaatatgcaacaaaatcaccagcagcaaaat 1347
Query: 1182 caacaacaaatgacgcagacacaaagctttttcactcgcgaattgaattttggggattat 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1346 caacaacaaatgacgcagacacaaagctttttcactcgcgaattgaattttggggattat 1287
Query: 1242 agtggttttgatggaagtagtgctagaaatgggaattctaatttgttgaagccagaatca 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1286 agtggttttgatggaagtagtgctagaaatgggaattctaatttgttgaagccagaatca 1227
Query: 1302 ggggagatattgaattttggggagagtaaaagaagttcttgtagtgccaatggaaatttc 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1226 ggggagatattgaattttggggagagtaaaagaagttcttgtagtgccaatggaaatttc 1167
Query: 1362 ttttcaggtcattcacagtttactgcagaggataataataacaataatagtaataagaag 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1166 ttttcaggtcattcacagtttactgcagaggataataataacaataatagtaataagaag 1107
Query: 1422 aaaagatctcccacttccagaggtagtaacgaagaaggaatgctttcctttacttctggt 1481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1106 aaaagatctcccacttccagaggtagtaacgaagaaggaatgctttcctttacttctggt 1047
Query: 1482 gtgatcttgccttcttctggtgtggtgaaatctagtggcggtacaggagattcagatcat 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 gtgatcttgccttcttctggtgtggtgaaatctagtggcggtacaggagattcagatcat 987
Query: 1542 tctgatcttgaagcctctgtagttagagagacggacagcagcagagttatagagcccgaa 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 986 tctgatcttgaagcctctgtagttagagagacggacagcagcagagttatagagcccgaa 927
Query: 1602 aagaggccgcgaaagcggggaagaaagccagcaaatggaagagaagaaccgttgaatcat 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 926 aagaggccgcgaaagcggggaagaaagccagcaaatggaagagaagaaccgttgaatcat 867
Query: 1662 gttgaagcagagagacaacgaagagagaagctcaatcaaaggttttatgcattgcgagct 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 866 gttgaagcagagagacaacgaagagagaagctcaatcaaaggttttatgcattgcgagct 807
Query: 1722 gtggttccgaatgtgtccaagatggataaagcttcactccttggcgatgcaatttcttat 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806 gtggttccgaatgtgtccaagatggataaagcttcactccttggcgatgcaatttcttat 747
Query: 1782 ataaaggagcttaggacaa 1800
|||||||||||||||||||
Sbjct: 746 ataaaggagcttaggacaa 728
>KJC_s14264
Length = 510
Score = 702 bits (354), Expect = 0.0
Identities = 354/354 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1447 gtaacgaagaaggaatgctttcctttacttctggtgtgatcttgccttcttctggtgtgg 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 gtaacgaagaaggaatgctttcctttacttctggtgtgatcttgccttcttctggtgtgg 388
Query: 1507 tgaaatctagtggcggtacaggagattcagatcattctgatcttgaagcctctgtagtta 1566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 tgaaatctagtggcggtacaggagattcagatcattctgatcttgaagcctctgtagtta 328
Query: 1567 gagagacggacagcagcagagttatagagcccgaaaagaggccgcgaaagcggggaagaa 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 gagagacggacagcagcagagttatagagcccgaaaagaggccgcgaaagcggggaagaa 268
Query: 1627 agccagcaaatggaagagaagaaccgttgaatcatgttgaagcagagagacaacgaagag 1686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 agccagcaaatggaagagaagaaccgttgaatcatgttgaagcagagagacaacgaagag 208
Query: 1687 agaagctcaatcaaaggttttatgcattgcgagctgtggttccgaatgtgtccaagatgg 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 agaagctcaatcaaaggttttatgcattgcgagctgtggttccgaatgtgtccaagatgg 148
Query: 1747 ataaagcttcactccttggcgatgcaatttcttatataaaggagcttaggacaa 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 ataaagcttcactccttggcgatgcaatttcttatataaaggagcttaggacaa 94
>KJC_c10758
Length = 761
Score = 65.9 bits (33), Expect = 3e-10
Identities = 123/153 (80%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1604 gaggccgcgaaagcggggaagaaagccagcaaatggaagagaagaaccgttgaatcatgt 1663
|||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||
Sbjct: 599 gaggcctcgaaaacgaggcaggaagccagcaaatggaagagaagagcccctcaatcatgt 658
Query: 1664 tgaagcagagagacaacgaagagagaagctcaatcaaaggttttatgcattgcgagctgt 1723
|| || ||||| || ||| | |||||||| || || | || ||||| || ||||||||
Sbjct: 659 cgaggctgagaggcagcgacgggagaagctaaaccagcgattctatgctttacgagctgt 718
Query: 1724 ggttccgaatgtgtccaagatggataaagcttc 1756
|| |||||| | ||||||||||| || |||||
Sbjct: 719 tgtgccgaatatttccaagatggacaaggcttc 751